RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CTU2-204ENST00000564105 UNC13BO14795 1591 aa28.52■■■□□ 2.16
CTU2-204ENST00000564105 DEPDC5O75140 1603 aa28.52■■■□□ 2.16
CTU2-204ENST00000564105 HRCP23327 699 aa28.51■■■□□ 2.15
CTU2-204ENST00000564105 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CTU2-204ENST00000564105 AGLP35573 1532 aa28.46■■■□□ 2.15
CTU2-204ENST00000564105 KIF3BO15066 747 aa28.45■■■□□ 2.15
CTU2-204ENST00000564105 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CTU2-204ENST00000564105 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CTU2-204ENST00000564105 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.44■■■□□ 2.14
CTU2-204ENST00000564105 TRIM52Q96A61 297 aa28.42■■■□□ 2.14
CTU2-204ENST00000564105 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.41■■■□□ 2.14
CTU2-204ENST00000564105 CEP152O94986 1710 aa28.41■■■□□ 2.14
CTU2-204ENST00000564105 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CTU2-204ENST00000564105 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.4■■■□□ 2.14
CTU2-204ENST00000564105 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
CTU2-204ENST00000564105 NUP155O75694 1391 aa28.36■■■□□ 2.13
CTU2-204ENST00000564105 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.34■■■□□ 2.13
CTU2-204ENST00000564105 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CTU2-204ENST00000564105 GGT6Q6P531 493 aa28.34■■■□□ 2.13
CTU2-204ENST00000564105 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CTU2-204ENST00000564105 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.33■■■□□ 2.13
CTU2-204ENST00000564105 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.33■■■□□ 2.13
CTU2-204ENST00000564105 MLECQ14165 292 aa28.33■■■□□ 2.12
CTU2-204ENST00000564105 KANK1Q14678 1352 aa28.32■■■□□ 2.12
CTU2-204ENST00000564105 PZPP20742 1482 aa28.32■■■□□ 2.12
CTU2-204ENST00000564105 TET3O43151 1660 aa28.31■■■□□ 2.12
CTU2-204ENST00000564105 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CTU2-204ENST00000564105 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CTU2-204ENST00000564105 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.28■■■□□ 2.12
CTU2-204ENST00000564105 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.26■■■□□ 2.11
CTU2-204ENST00000564105 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.26■■■□□ 2.11
CTU2-204ENST00000564105 E9PCH4 1651 aa28.25■■■□□ 2.11
CTU2-204ENST00000564105 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CTU2-204ENST00000564105 ABCC3O15438 1527 aa28.24■■■□□ 2.11
CTU2-204ENST00000564105 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.23■■■□□ 2.11
CTU2-204ENST00000564105 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.23■■■□□ 2.11
CTU2-204ENST00000564105 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.21■■■□□ 2.11
CTU2-204ENST00000564105 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.2■■■□□ 2.1
CTU2-204ENST00000564105 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU2-204ENST00000564105 MROH2AA6NES4 1674 aa28.17■■■□□ 2.1
CTU2-204ENST00000564105 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CTU2-204ENST00000564105 PKD2Q13563 968 aa28.16■■■□□ 2.1
CTU2-204ENST00000564105 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.15■■■□□ 2.1
CTU2-204ENST00000564105 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CTU2-204ENST00000564105 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CTU2-204ENST00000564105 FOXD1Q16676 465 aa28.11■■■□□ 2.09
CTU2-204ENST00000564105 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CTU2-204ENST00000564105 HSPA2P54652 639 aa28.1■■■□□ 2.09
CTU2-204ENST00000564105 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.09■■■□□ 2.09
CTU2-204ENST00000564105 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.09■■■□□ 2.09
CTU2-204ENST00000564105 C3P01024 1663 aa28.08■■■□□ 2.09
CTU2-204ENST00000564105 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CTU2-204ENST00000564105 NPATQ14207 1427 aa28.07■■■□□ 2.08
CTU2-204ENST00000564105 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU2-204ENST00000564105 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.03■■■□□ 2.08
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.01■■■□□ 2.08
CTU2-204ENST00000564105 ZMYM3Q14202 1370 aa28.01■■■□□ 2.07
CTU2-204ENST00000564105 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CTU2-204ENST00000564105 KIF1BO60333 1816 aa27.98■■■□□ 2.07
CTU2-204ENST00000564105 TRPM2O94759 1503 aa27.98■■■□□ 2.07
CTU2-204ENST00000564105 PLA2R1Q13018 1463 aa27.97■■■□□ 2.07
CTU2-204ENST00000564105 PTPRTO14522 1441 aa27.97■■■□□ 2.07
CTU2-204ENST00000564105 SYNMO15061 1565 aa27.95■■■□□ 2.06
CTU2-204ENST00000564105 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.94■■■□□ 2.06
CTU2-204ENST00000564105 CLTCL1P53675 1640 aa27.94■■■□□ 2.06
CTU2-204ENST00000564105 ERVK-7P63135 1459 aa27.93■■■□□ 2.06
CTU2-204ENST00000564105 NOS1P29475 1434 aa27.93■■■□□ 2.06
CTU2-204ENST00000564105 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.92■■■□□ 2.06
CTU2-204ENST00000564105 PIK3C2BO00750 1634 aa27.91■■■□□ 2.06
CTU2-204ENST00000564105 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CTU2-204ENST00000564105 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.9■■■□□ 2.06
CTU2-204ENST00000564105 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.89■■■□□ 2.06
CTU2-204ENST00000564105 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.89■■■□□ 2.06
CTU2-204ENST00000564105 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.89■■■□□ 2.06
CTU2-204ENST00000564105 STRCQ7RTU9 1775 aa27.87■■■□□ 2.05
CTU2-204ENST00000564105 NEUROD1Q13562 356 aa27.86■■■□□ 2.05
CTU2-204ENST00000564105 TNRQ92752 1358 aa27.8■■■□□ 2.04
CTU2-204ENST00000564105 FBXO41Q8TF61 875 aa27.78■■■□□ 2.04
CTU2-204ENST00000564105 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.78■■■□□ 2.04
CTU2-204ENST00000564105 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.77■■■□□ 2.04
CTU2-204ENST00000564105 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.75■■■□□ 2.03
CTU2-204ENST00000564105 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.75■■■□□ 2.03
CTU2-204ENST00000564105 IDI1Q13907 227 aa27.74■■■□□ 2.03
CTU2-204ENST00000564105 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
CTU2-204ENST00000564105 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.73■■■□□ 2.03
CTU2-204ENST00000564105 ADGRB3O60242 1522 aa27.73■■■□□ 2.03
CTU2-204ENST00000564105 TONSLQ96HA7 1378 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU2-204ENST00000564105 IFT172Q9UG01 1749 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU2-204ENST00000564105 NLRP1Q9C000 1473 aa27.71■■■□□ 2.03
CTU2-204ENST00000564105 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.7■■■□□ 2.03
CTU2-204ENST00000564105 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
CTU2-204ENST00000564105 PPLO60437 1756 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU2-204ENST00000564105 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
CTU2-204ENST00000564105 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CTU2-204ENST00000564105 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.66■■■□□ 2.02
CTU2-204ENST00000564105 RGL3Q3MIN7 710 aa27.65■■■□□ 2.02
CTU2-204ENST00000564105 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.65■■■□□ 2.02
CTU2-204ENST00000564105 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
CTU2-204ENST00000564105 CERKQ8TCT0 537 aa27.64■■■□□ 2.01
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