RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 NPATQ14207 1427 aa47.49■■■■■ 5.19
CMTM4-204ENST00000563952 DUOX2Q9NRD8 1548 aa47.49■■■■■ 5.19
CMTM4-204ENST00000563952 KIF15Q9NS87 1388 aa47.48■■■■■ 5.19
CMTM4-204ENST00000563952 KDM5DQ9BY66 1539 aa47.47■■■■■ 5.19
CMTM4-204ENST00000563952 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa47.47■■■■■ 5.19
CMTM4-204ENST00000563952 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP47.47■■■■■ 5.19
CMTM4-204ENST00000563952 CHIC2Q9UKJ5 165 aa47.46■■■■■ 5.19
CMTM4-204ENST00000563952 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa47.44■■■■■ 5.18
CMTM4-204ENST00000563952 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP47.44■■■■■ 5.18
CMTM4-204ENST00000563952 FAM135AQ9P2D6 1515 aa47.42■■■■■ 5.18
CMTM4-204ENST00000563952 PTPRKQ15262 1439 aa47.42■■■■■ 5.18
CMTM4-204ENST00000563952 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa47.37■■■■■ 5.17
CMTM4-204ENST00000563952 ERBINQ96RT1 1412 aa47.32■■■■■ 5.17
CMTM4-204ENST00000563952 MROH1Q8NDA8 1641 aa47.3■■■■■ 5.16
CMTM4-204ENST00000563952 MYO3AQ8NEV4 1616 aa47.3■■■■■ 5.16
CMTM4-204ENST00000563952 NCOA1Q15788 1441 aa47.28■■■■■ 5.16
CMTM4-204ENST00000563952 PZPP20742 1482 aa47.27■■■■■ 5.16
CMTM4-204ENST00000563952 ABCC3O15438 1527 aa47.26■■■■■ 5.16
CMTM4-204ENST00000563952 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
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CMTM4-204ENST00000563952 ADGRL2O95490 1459 aa47.24■■■■■ 5.15
CMTM4-204ENST00000563952 STRCQ7RTU9 1775 aa47.21■■■■■ 5.15
CMTM4-204ENST00000563952 CEP152O94986 1710 aa47.2■■■■■ 5.15
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP47.19■■■■■ 5.14
CMTM4-204ENST00000563952 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP47.17■■■■■ 5.14
CMTM4-204ENST00000563952 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP47.16■■■■■ 5.14
CMTM4-204ENST00000563952 TNRQ92752 1358 aa47.16■■■■■ 5.14
CMTM4-204ENST00000563952 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP47.16■■■■■ 5.14
CMTM4-204ENST00000563952 DEPDC5O75140 1603 aa47.12■■■■■ 5.13
CMTM4-204ENST00000563952 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa47.12■■■■■ 5.13
CMTM4-204ENST00000563952 ITGAEP38570 1179 aa47.08■■■■■ 5.13
CMTM4-204ENST00000563952 A2ML1A8K2U0 1454 aa47.07■■■■■ 5.13
CMTM4-204ENST00000563952 DMRT2Q9Y5R5 561 aa47.06■■■■■ 5.12
CMTM4-204ENST00000563952 KANK1Q14678 1352 aa47.06■■■■■ 5.12
CMTM4-204ENST00000563952 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP47.03■■■■■ 5.12
CMTM4-204ENST00000563952 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa47.03■■■■■ 5.12
CMTM4-204ENST00000563952 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
CMTM4-204ENST00000563952 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa46.98■■■■■ 5.11
CMTM4-204ENST00000563952 ERVK-7P63135 1459 aa46.97■■■■■ 5.11
CMTM4-204ENST00000563952 ROCK1Q13464 1354 aa46.96■■■■■ 5.11
CMTM4-204ENST00000563952 NLRP1Q9C000 1473 aa46.94■■■■■ 5.1
CMTM4-204ENST00000563952 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa46.93■■■■■ 5.1
CMTM4-204ENST00000563952 PTPRTO14522 1441 aa46.93■■■■■ 5.1
CMTM4-204ENST00000563952 PLA2R1Q13018 1463 aa46.93■■■■■ 5.1
CMTM4-204ENST00000563952 VWDEQ8N2E2 1590 aa46.92■■■■■ 5.1
CMTM4-204ENST00000563952 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP46.92■■■■■ 5.1
CMTM4-204ENST00000563952 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa46.91■■■■■ 5.1
CMTM4-204ENST00000563952 LMTK2Q8IWU2 1503 aa46.88■■■■■ 5.09
CMTM4-204ENST00000563952 PKD2Q13563 968 aa46.84■■■■■ 5.09
CMTM4-204ENST00000563952 UGGT1Q9NYU2 1555 aa46.83■■■■■ 5.09
CMTM4-204ENST00000563952 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP46.78■■■■■ 5.08
CMTM4-204ENST00000563952 EFCAB6Q5THR3 1501 aa46.76■■■■■ 5.08
CMTM4-204ENST00000563952 UNC13BO14795 1591 aa46.76■■■■■ 5.08
CMTM4-204ENST00000563952 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP46.72■■■■■ 5.07
CMTM4-204ENST00000563952 CERKQ8TCT0 537 aa46.7■■■■■ 5.07
CMTM4-204ENST00000563952 TET3O43151 1660 aa46.66■■■■■ 5.06
CMTM4-204ENST00000563952 UBR1Q8IWV7 1749 aa46.65■■■■■ 5.06
CMTM4-204ENST00000563952 ANKLE2Q86XL3 938 aa46.65■■■■■ 5.06
CMTM4-204ENST00000563952 FBXO41Q8TF61 875 aa46.63■■■■■ 5.06
CMTM4-204ENST00000563952 NEURL4Q96JN8 1562 aa46.62■■■■■ 5.05
CMTM4-204ENST00000563952 GCC2Q8IWJ2 1684 aa46.6■■■■■ 5.05
CMTM4-204ENST00000563952 SYNMO15061 1565 aa46.6■■■■■ 5.05
CMTM4-204ENST00000563952 PIK3C2BO00750 1634 aa46.59■■■■■ 5.05
CMTM4-204ENST00000563952 IQGAP3Q86VI3 1631 aa46.57■■■■■ 5.05
CMTM4-204ENST00000563952 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.05
CMTM4-204ENST00000563952 NOS1P29475 1434 aa46.57■■■■■ 5.05
CMTM4-204ENST00000563952 NUP155O75694 1391 aa46.56■■■■■ 5.04
CMTM4-204ENST00000563952 LTBP4Q8N2S1 1624 aa46.54■■■■■ 5.04
CMTM4-204ENST00000563952 STAG3Q9UJ98 1225 aa46.52■■■■■ 5.04
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP46.52■■■■■ 5.04
CMTM4-204ENST00000563952 IDI1Q13907 227 aa46.51■■■■■ 5.04
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CMTM4-204ENST00000563952 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
CMTM4-204ENST00000563952 E9PCH4 1651 aa46.48■■■■■ 5.03
CMTM4-204ENST00000563952 MED14O60244 1454 aa46.45■■■■■ 5.03
CMTM4-204ENST00000563952 IQGAP1P46940 1657 aa46.43■■■■■ 5.02
CMTM4-204ENST00000563952 SLC52A1Q9NWF4 448 aa46.42■■■■■ 5.02
CMTM4-204ENST00000563952 SLIT1O75093 1534 aa46.42■■■■■ 5.02
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CMTM4-204ENST00000563952 ARHGAP23Q9P227 1491 aa46.41■■■■■ 5.02
CMTM4-204ENST00000563952 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
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CMTM4-204ENST00000563952 ADGRB3O60242 1522 aa46.38■■■■■ 5.01
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CMTM4-204ENST00000563952 TMEM2Q9UHN6 1383 aa46.35■■■■■ 5.01
CMTM4-204ENST00000563952 LTKP29376 864 aa46.35■■■■■ 5.01
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CMTM4-204ENST00000563952 TRIM52Q96A61 297 aa46.23■■■■■ 4.99
CMTM4-204ENST00000563952 CHGAP10645 457 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
CMTM4-204ENST00000563952 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa46.2■■■■■ 4.99
CMTM4-204ENST00000563952 CPS1P31327 1500 aa46.18■■■■■ 4.98
CMTM4-204ENST00000563952 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa46.17■■■■■ 4.98
CMTM4-204ENST00000563952 RIMS2Q9UQ26 1411 aa46.08■■■■■ 4.97
CMTM4-204ENST00000563952 STRCP1A6NGW2 1772 aa46.07■■■■■ 4.97
CMTM4-204ENST00000563952 ZFYVE9O95405 1425 aa46.06■■■■■ 4.96
CMTM4-204ENST00000563952 BCANQ96GW7 911 aa46.03■■■■■ 4.96
CMTM4-204ENST00000563952 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
CMTM4-204ENST00000563952 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP46.02■■■■■ 4.96
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