RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563387.5

C15orf40-210, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf40, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-210ENST00000563387 KIF21BO75037 1637 aa5.94□□□□□ -1.46
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C15orf40-210ENST00000563387 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
C15orf40-210ENST00000563387 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
C15orf40-210ENST00000563387 ZRANB1Q9UGI0 708 aa5.93□□□□□ -1.46
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C15orf40-210ENST00000563387 CCDC61Q9Y6R9 512 aa5.82□□□□□ -1.48
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C15orf40-210ENST00000563387 IQSEC2Q5JU85 1478 aa5.82□□□□□ -1.48
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C15orf40-210ENST00000563387 CUL7Q14999 1698 aa5.8□□□□□ -1.48
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C15orf40-210ENST00000563387 ASXL2Q76L83 1435 aa5.8□□□□□ -1.48
C15orf40-210ENST00000563387 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa5.79□□□□□ -1.48
C15orf40-210ENST00000563387 PLB1Q6P1J6 1458 aa5.79□□□□□ -1.48
C15orf40-210ENST00000563387 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
C15orf40-210ENST00000563387 SPOCK2Q92563 424 aa5.79□□□□□ -1.48
C15orf40-210ENST00000563387 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
C15orf40-210ENST00000563387 CEP120Q8N960 986 aa5.78□□□□□ -1.48
C15orf40-210ENST00000563387 RGS22Q8NE09 1264 aa5.78□□□□□ -1.48
C15orf40-210ENST00000563387 KIF12Q96FN5 646 aa5.78□□□□□ -1.48
C15orf40-210ENST00000563387 DCBLD2Q96PD2 775 aa5.78□□□□□ -1.48
C15orf40-210ENST00000563387 HDAC5Q9UQL6 1122 aa5.78□□□□□ -1.48
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