RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, human

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP10-208	ENST00000563386	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		29.05	■■■□□ 2.24
USP10-208	ENST00000563386	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		29.04	■■■□□ 2.24
USP10-208	ENST00000563386	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		29.03	■■■□□ 2.24
USP10-208	ENST00000563386	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		29.03	■■■□□ 2.24
USP10-208	ENST00000563386	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
USP10-208	ENST00000563386	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
USP10-208	ENST00000563386	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		28.99	■■■□□ 2.23
USP10-208	ENST00000563386	ITGAE	P38570	1179 aa		28.98	■■■□□ 2.23
USP10-208	ENST00000563386	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
USP10-208	ENST00000563386	NPAT	Q14207	1427 aa		28.96	■■■□□ 2.23
USP10-208	ENST00000563386	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.95	■■■□□ 2.23
USP10-208	ENST00000563386	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.94	■■■□□ 2.22
USP10-208	ENST00000563386	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		28.94	■■■□□ 2.22
USP10-208	ENST00000563386	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.94	■■■□□ 2.22
USP10-208	ENST00000563386	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
USP10-208	ENST00000563386	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.92	■■■□□ 2.22
USP10-208	ENST00000563386	ADGRL2	O95490	1459 aa		28.91	■■■□□ 2.22
USP10-208	ENST00000563386	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		28.9	■■■□□ 2.22
USP10-208	ENST00000563386	ABCC3	O15438	1527 aa		28.89	■■■□□ 2.21
USP10-208	ENST00000563386	PZP	P20742	1482 aa		28.86	■■■□□ 2.21
USP10-208	ENST00000563386	CEP152	O94986	1710 aa		28.86	■■■□□ 2.21
USP10-208	ENST00000563386	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
USP10-208	ENST00000563386	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.83	■■■□□ 2.21
USP10-208	ENST00000563386	KANK1	Q14678	1352 aa		28.83	■■■□□ 2.21
USP10-208	ENST00000563386	TNR	Q92752	1358 aa		28.82	■■■□□ 2.2
USP10-208	ENST00000563386	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.82	■■■□□ 2.2
USP10-208	ENST00000563386	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
USP10-208	ENST00000563386	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.81	■■■□□ 2.2
USP10-208	ENST00000563386	DEPDC5	O75140	1603 aa		28.8	■■■□□ 2.2
USP10-208	ENST00000563386	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.79	■■■□□ 2.2
USP10-208	ENST00000563386	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
USP10-208	ENST00000563386	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
USP10-208	ENST00000563386	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.76	■■■□□ 2.2
USP10-208	ENST00000563386	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
USP10-208	ENST00000563386	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.74	■■■□□ 2.19
USP10-208	ENST00000563386	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
USP10-208	ENST00000563386	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		28.72	■■■□□ 2.19
USP10-208	ENST00000563386	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.71	■■■□□ 2.19
USP10-208	ENST00000563386	ERVK-7	P63135	1459 aa		28.7	■■■□□ 2.18
USP10-208	ENST00000563386	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
USP10-208	ENST00000563386	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.69	■■■□□ 2.18
USP10-208	ENST00000563386	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.67	■■■□□ 2.18
USP10-208	ENST00000563386	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.67	■■■□□ 2.18
USP10-208	ENST00000563386	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.66	■■■□□ 2.18
USP10-208	ENST00000563386	NLRP1	Q9C000	1473 aa		28.66	■■■□□ 2.18
USP10-208	ENST00000563386	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.64	■■■□□ 2.17
USP10-208	ENST00000563386	UNC13B	O14795	1591 aa		28.6	■■■□□ 2.17
USP10-208	ENST00000563386	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		28.6	■■■□□ 2.17
USP10-208	ENST00000563386	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
USP10-208	ENST00000563386	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.59	■■■□□ 2.17
USP10-208	ENST00000563386	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.59	■■■□□ 2.17
USP10-208	ENST00000563386	PKD2	Q13563	968 aa		28.58	■■■□□ 2.17
USP10-208	ENST00000563386	PTPRT	O14522	1441 aa		28.58	■■■□□ 2.17
USP10-208	ENST00000563386	NUP155	O75694	1391 aa		28.56	■■■□□ 2.16
USP10-208	ENST00000563386	TET3	O43151	1660 aa		28.54	■■■□□ 2.16
USP10-208	ENST00000563386	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		28.52	■■■□□ 2.16
USP10-208	ENST00000563386	NAIP	Q13075	1403 aa		28.52	■■■□□ 2.16
USP10-208	ENST00000563386	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.51	■■■□□ 2.15
USP10-208	ENST00000563386	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.5	■■■□□ 2.15
USP10-208	ENST00000563386	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.49	■■■□□ 2.15
USP10-208	ENST00000563386	SYNM	O15061	1565 aa		28.48	■■■□□ 2.15
USP10-208	ENST00000563386	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		28.48	■■■□□ 2.15
USP10-208	ENST00000563386	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
USP10-208	ENST00000563386	NOS1	P29475	1434 aa		28.47	■■■□□ 2.15
USP10-208	ENST00000563386	IDI1	Q13907	227 aa		28.47	■■■□□ 2.15
USP10-208	ENST00000563386	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.47	■■■□□ 2.15
USP10-208	ENST00000563386	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
USP10-208	ENST00000563386	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.45	■■■□□ 2.14
USP10-208	ENST00000563386	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.44	■■■□□ 2.14
USP10-208	ENST00000563386		E9PCH4	1651 aa		28.44	■■■□□ 2.14
USP10-208	ENST00000563386	TRIM52	Q96A61	297 aa		28.43	■■■□□ 2.14
USP10-208	ENST00000563386	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		28.42	■■■□□ 2.14
USP10-208	ENST00000563386	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.4	■■■□□ 2.14
USP10-208	ENST00000563386	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
USP10-208	ENST00000563386	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
USP10-208	ENST00000563386	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		28.37	■■■□□ 2.13
USP10-208	ENST00000563386	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.36	■■■□□ 2.13
USP10-208	ENST00000563386	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
USP10-208	ENST00000563386	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.35	■■■□□ 2.13
USP10-208	ENST00000563386	LTK	P29376	864 aa		28.34	■■■□□ 2.13
USP10-208	ENST00000563386	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.33	■■■□□ 2.13
USP10-208	ENST00000563386	MED14	O60244	1454 aa		28.33	■■■□□ 2.13
USP10-208	ENST00000563386	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
USP10-208	ENST00000563386	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.33	■■■□□ 2.13
USP10-208	ENST00000563386	SLIT1	O75093	1534 aa		28.33	■■■□□ 2.13
USP10-208	ENST00000563386	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.32	■■■□□ 2.12
USP10-208	ENST00000563386	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.32	■■■□□ 2.12
USP10-208	ENST00000563386	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.32	■■■□□ 2.12
USP10-208	ENST00000563386	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
USP10-208	ENST00000563386	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
USP10-208	ENST00000563386	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
USP10-208	ENST00000563386	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.25	■■■□□ 2.11
USP10-208	ENST00000563386	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.24	■■■□□ 2.11
USP10-208	ENST00000563386	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.23	■■■□□ 2.11
USP10-208	ENST00000563386	BCAN	Q96GW7	911 aa		28.23	■■■□□ 2.11
USP10-208	ENST00000563386	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.2	■■■□□ 2.11
USP10-208	ENST00000563386	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
USP10-208	ENST00000563386	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		28.19	■■■□□ 2.1
USP10-208	ENST00000563386	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
USP10-208	ENST00000563386	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1

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