RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563367.1

NME3-203, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 3

Gene NME3, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-203ENST00000563367 KIF15Q9NS87 1388 aa43.67■■■■■ 4.58
NME3-203ENST00000563367 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.66■■■■■ 4.58
NME3-203ENST00000563367 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.66■■■■■ 4.58
NME3-203ENST00000563367 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
NME3-203ENST00000563367 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.6■■■■■ 4.57
NME3-203ENST00000563367 NPATQ14207 1427 aa43.58■■■■■ 4.57
NME3-203ENST00000563367 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa43.58■■■■■ 4.57
NME3-203ENST00000563367 FAM135AQ9P2D6 1515 aa43.58■■■■■ 4.57
NME3-203ENST00000563367 PTPRKQ15262 1439 aa43.56■■■■■ 4.56
NME3-203ENST00000563367 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa43.56■■■■■ 4.56
NME3-203ENST00000563367 MROH1Q8NDA8 1641 aa43.56■■■■■ 4.56
NME3-203ENST00000563367 NCOA1Q15788 1441 aa43.56■■■■■ 4.56
NME3-203ENST00000563367 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa43.55■■■■■ 4.56
NME3-203ENST00000563367 ADGRL2O95490 1459 aa43.53■■■■■ 4.56
NME3-203ENST00000563367 ERBINQ96RT1 1412 aa43.53■■■■■ 4.56
NME3-203ENST00000563367 ABCC3O15438 1527 aa43.46■■■■■ 4.55
NME3-203ENST00000563367 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
NME3-203ENST00000563367 CEP152O94986 1710 aa43.44■■■■■ 4.54
NME3-203ENST00000563367 PZPP20742 1482 aa43.42■■■■■ 4.54
NME3-203ENST00000563367 MYO3AQ8NEV4 1616 aa43.41■■■■■ 4.54
NME3-203ENST00000563367 DEPDC5O75140 1603 aa43.4■■■■■ 4.54
NME3-203ENST00000563367 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
NME3-203ENST00000563367 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.4■■■■■ 4.54
NME3-203ENST00000563367 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
NME3-203ENST00000563367 STRCQ7RTU9 1775 aa43.36■■■■■ 4.53
NME3-203ENST00000563367 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
NME3-203ENST00000563367 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa43.33■■■■■ 4.53
NME3-203ENST00000563367 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
NME3-203ENST00000563367 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
NME3-203ENST00000563367 ITGAEP38570 1179 aa43.31■■■■■ 4.52
NME3-203ENST00000563367 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP43.31■■■■■ 4.52
NME3-203ENST00000563367 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
NME3-203ENST00000563367 TNRQ92752 1358 aa43.29■■■■■ 4.52
NME3-203ENST00000563367 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa43.28■■■■■ 4.52
NME3-203ENST00000563367 ROCK1Q13464 1354 aa43.27■■■■■ 4.52
NME3-203ENST00000563367 VWDEQ8N2E2 1590 aa43.22■■■■■ 4.51
NME3-203ENST00000563367 KANK1Q14678 1352 aa43.2■■■■■ 4.51
NME3-203ENST00000563367 A2ML1A8K2U0 1454 aa43.19■■■■■ 4.51
NME3-203ENST00000563367 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa43.19■■■■■ 4.5
NME3-203ENST00000563367 ERVK-7P63135 1459 aa43.17■■■■■ 4.5
NME3-203ENST00000563367 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa43.14■■■■■ 4.5
NME3-203ENST00000563367 LMTK2Q8IWU2 1503 aa43.14■■■■■ 4.5
NME3-203ENST00000563367 NLRP1Q9C000 1473 aa43.1■■■■■ 4.49
NME3-203ENST00000563367 UNC13BO14795 1591 aa43.07■■■■■ 4.49
NME3-203ENST00000563367 DMRT2Q9Y5R5 561 aa43.07■■■■■ 4.49
NME3-203ENST00000563367 PLA2R1Q13018 1463 aa43.06■■■■■ 4.48
NME3-203ENST00000563367 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa43.03■■■■■ 4.48
NME3-203ENST00000563367 PTPRTO14522 1441 aa43.02■■■■■ 4.48
NME3-203ENST00000563367 EFCAB6Q5THR3 1501 aa43.02■■■■■ 4.48
NME3-203ENST00000563367 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.99■■■■■ 4.47
NME3-203ENST00000563367 TET3O43151 1660 aa42.95■■■■■ 4.47
NME3-203ENST00000563367 PKD2Q13563 968 aa42.93■■■■■ 4.46
NME3-203ENST00000563367 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.92■■■■■ 4.46
NME3-203ENST00000563367 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
NME3-203ENST00000563367 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
NME3-203ENST00000563367 UBR1Q8IWV7 1749 aa42.91■■■■■ 4.46
NME3-203ENST00000563367 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.9■■■■■ 4.46
NME3-203ENST00000563367 SYNMO15061 1565 aa42.88■■■■■ 4.45
NME3-203ENST00000563367 NAIPQ13075 1403 aa42.88■■■■■ 4.45
NME3-203ENST00000563367 NOS1P29475 1434 aa42.86■■■■■ 4.45
NME3-203ENST00000563367 PIK3C2BO00750 1634 aa42.84■■■■■ 4.45
NME3-203ENST00000563367 NUP155O75694 1391 aa42.84■■■■■ 4.45
NME3-203ENST00000563367 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
NME3-203ENST00000563367 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.83■■■■■ 4.45
NME3-203ENST00000563367 E9PCH4 1651 aa42.82■■■■■ 4.45
NME3-203ENST00000563367 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.78■■■■■ 4.44
NME3-203ENST00000563367 IDI1Q13907 227 aa42.77■■■■■ 4.44
NME3-203ENST00000563367 HFM1A2PYH4 1435 aa42.77■■■■■ 4.44
NME3-203ENST00000563367 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
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NME3-203ENST00000563367 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
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NME3-203ENST00000563367 MED14O60244 1454 aa42.67■■■■■ 4.42
NME3-203ENST00000563367 SLIT1O75093 1534 aa42.66■■■■■ 4.42
NME3-203ENST00000563367 SLC52A1Q9NWF4 448 aa42.66■■■■■ 4.42
NME3-203ENST00000563367 ARHGAP23Q9P227 1491 aa42.66■■■■■ 4.42
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NME3-203ENST00000563367 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.41
NME3-203ENST00000563367 IQGAP1P46940 1657 aa42.63■■■■■ 4.41
NME3-203ENST00000563367 MYO5BQ9ULV0 1848 aa42.62■■■■■ 4.41
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NME3-203ENST00000563367 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
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NME3-203ENST00000563367 TXNDC2Q86VQ3 553 aa42.56■■■■■ 4.4
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NME3-203ENST00000563367 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa42.53■■■■■ 4.4
NME3-203ENST00000563367 TRIM52Q96A61 297 aa42.52■■■■■ 4.4
NME3-203ENST00000563367 EID1Q9Y6B2 187 aa42.49■■■■■ 4.39
NME3-203ENST00000563367 CHGAP10645 457 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
NME3-203ENST00000563367 STRCP1A6NGW2 1772 aa42.37■■■■■ 4.37
NME3-203ENST00000563367 ZFYVE9O95405 1425 aa42.37■■■■■ 4.37
NME3-203ENST00000563367 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
NME3-203ENST00000563367 IQSEC2Q5JU85 1478 aa42.36■■■■■ 4.37
NME3-203ENST00000563367 RIMS2Q9UQ26 1411 aa42.33■■■■■ 4.37
NME3-203ENST00000563367 TRPM2O94759 1503 aa42.32■■■■■ 4.37
NME3-203ENST00000563367 CPS1P31327 1500 aa42.32■■■■■ 4.37
NME3-203ENST00000563367 SETD5Q9C0A6 1442 aa42.32■■■■■ 4.37
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