RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559365.5

PSMA4-212, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSMA4, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-212ENST00000559365 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.4■■■■■ 4.38
PSMA4-212ENST00000559365 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
PSMA4-212ENST00000559365 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.37■■■■■ 4.37
PSMA4-212ENST00000559365 PTPRTO14522 1441 aa42.37■■■■■ 4.37
PSMA4-212ENST00000559365 CERKQ8TCT0 537 aa42.34■■■■■ 4.37
PSMA4-212ENST00000559365 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
PSMA4-212ENST00000559365 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.34■■■■■ 4.37
PSMA4-212ENST00000559365 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
PSMA4-212ENST00000559365 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.29■■■■■ 4.36
PSMA4-212ENST00000559365 PZPP20742 1482 aa42.29■■■■■ 4.36
PSMA4-212ENST00000559365 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.26■■■■■ 4.36
PSMA4-212ENST00000559365 ABCC5O15440 1437 aa42.25■■■■■ 4.35
PSMA4-212ENST00000559365 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
PSMA4-212ENST00000559365 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.23■■■■■ 4.35
PSMA4-212ENST00000559365 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
PSMA4-212ENST00000559365 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
PSMA4-212ENST00000559365 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.22■■■■■ 4.35
PSMA4-212ENST00000559365 PLA2R1Q13018 1463 aa42.22■■■■■ 4.35
PSMA4-212ENST00000559365 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.21■■■■■ 4.35
PSMA4-212ENST00000559365 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
PSMA4-212ENST00000559365 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.2■■■■■ 4.35
PSMA4-212ENST00000559365 TNRQ92752 1358 aa42.2■■■■■ 4.35
PSMA4-212ENST00000559365 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa42.19■■■■■ 4.34
PSMA4-212ENST00000559365 ABCC3O15438 1527 aa42.18■■■■■ 4.34
PSMA4-212ENST00000559365 DAPK1P53355 1430 aa42.17■■■■■ 4.34
PSMA4-212ENST00000559365 CEP152O94986 1710 aa42.14■■■■■ 4.34
PSMA4-212ENST00000559365 KIF15Q9NS87 1388 aa42.14■■■■■ 4.34
PSMA4-212ENST00000559365 LTBP4Q8N2S1 1624 aa42.12■■■■■ 4.33
PSMA4-212ENST00000559365 PKD2Q13563 968 aa42.09■■■■■ 4.33
PSMA4-212ENST00000559365 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.07■■■■■ 4.33
PSMA4-212ENST00000559365 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
PSMA4-212ENST00000559365 ERBINQ96RT1 1412 aa42.05■■■■■ 4.32
PSMA4-212ENST00000559365 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
PSMA4-212ENST00000559365 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
PSMA4-212ENST00000559365 NLRP1Q9C000 1473 aa42.02■■■■■ 4.32
PSMA4-212ENST00000559365 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.01■■■■■ 4.32
PSMA4-212ENST00000559365 DEPDC5O75140 1603 aa41.98■■■■■ 4.31
PSMA4-212ENST00000559365 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.97■■■■■ 4.31
PSMA4-212ENST00000559365 ERVK-7P63135 1459 aa41.97■■■■■ 4.31
PSMA4-212ENST00000559365 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.95■■■■■ 4.31
PSMA4-212ENST00000559365 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.94■■■■■ 4.3
PSMA4-212ENST00000559365 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.94■■■■■ 4.3
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
PSMA4-212ENST00000559365 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.89■■■■■ 4.3
PSMA4-212ENST00000559365 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
PSMA4-212ENST00000559365 ADGRL2O95490 1459 aa41.88■■■■■ 4.29
PSMA4-212ENST00000559365 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.88■■■■■ 4.29
PSMA4-212ENST00000559365 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
PSMA4-212ENST00000559365 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.85■■■■■ 4.29
PSMA4-212ENST00000559365 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.84■■■■■ 4.29
PSMA4-212ENST00000559365 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.8■■■■■ 4.28
PSMA4-212ENST00000559365 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.8■■■■■ 4.28
PSMA4-212ENST00000559365 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.79■■■■■ 4.28
PSMA4-212ENST00000559365 KANK1Q14678 1352 aa41.78■■■■■ 4.28
PSMA4-212ENST00000559365 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.75■■■■■ 4.27
PSMA4-212ENST00000559365 MED14O60244 1454 aa41.73■■■■■ 4.27
PSMA4-212ENST00000559365 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
PSMA4-212ENST00000559365 IQGAP1P46940 1657 aa41.7■■■■■ 4.27
PSMA4-212ENST00000559365 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.66■■■■■ 4.26
PSMA4-212ENST00000559365 PIK3C2BO00750 1634 aa41.64■■■■■ 4.26
PSMA4-212ENST00000559365 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.64■■■■■ 4.26
PSMA4-212ENST00000559365 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
PSMA4-212ENST00000559365 CPS1P31327 1500 aa41.59■■■■■ 4.25
PSMA4-212ENST00000559365 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.58■■■■■ 4.25
PSMA4-212ENST00000559365 SYNMO15061 1565 aa41.58■■■■■ 4.25
PSMA4-212ENST00000559365 SLIT1O75093 1534 aa41.57■■■■■ 4.25
PSMA4-212ENST00000559365 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
PSMA4-212ENST00000559365 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
PSMA4-212ENST00000559365 NOS1P29475 1434 aa41.52■■■■■ 4.24
PSMA4-212ENST00000559365 ROCK1Q13464 1354 aa41.51■■■■■ 4.24
PSMA4-212ENST00000559365 UNC13BO14795 1591 aa41.51■■■■■ 4.24
PSMA4-212ENST00000559365 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.51■■■■■ 4.24
PSMA4-212ENST00000559365 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.51■■■■■ 4.24
PSMA4-212ENST00000559365 TET3O43151 1660 aa41.5■■■■■ 4.23
PSMA4-212ENST00000559365 LTKP29376 864 aa41.49■■■■■ 4.23
PSMA4-212ENST00000559365 IDI1Q13907 227 aa41.47■■■■■ 4.23
PSMA4-212ENST00000559365 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.46■■■■■ 4.23
PSMA4-212ENST00000559365 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.45■■■■■ 4.23
PSMA4-212ENST00000559365 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
PSMA4-212ENST00000559365 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.42■■■■■ 4.22
PSMA4-212ENST00000559365 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.42■■■■■ 4.22
PSMA4-212ENST00000559365 ITGAEP38570 1179 aa41.41■■■■■ 4.22
PSMA4-212ENST00000559365 ADGRB3O60242 1522 aa41.39■■■■■ 4.22
PSMA4-212ENST00000559365 EID1Q9Y6B2 187 aa41.38■■■■■ 4.21
PSMA4-212ENST00000559365 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.35■■■■■ 4.21
PSMA4-212ENST00000559365 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.34■■■■■ 4.21
PSMA4-212ENST00000559365 E9PCH4 1651 aa41.34■■■■■ 4.21
PSMA4-212ENST00000559365 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.34■■■■■ 4.21
PSMA4-212ENST00000559365 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.31■■■■■ 4.2
PSMA4-212ENST00000559365 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
PSMA4-212ENST00000559365 TOM1O60784 492 aa41.26■■■■■ 4.2
PSMA4-212ENST00000559365 ALKQ9UM73 1620 aa41.26■■■■■ 4.19
PSMA4-212ENST00000559365 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.22■■■■■ 4.19
PSMA4-212ENST00000559365 PIP4K2BP78356 416 aa41.21■■■■■ 4.19
PSMA4-212ENST00000559365 NUP155O75694 1391 aa41.21■■■■■ 4.19
PSMA4-212ENST00000559365 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
PSMA4-212ENST00000559365 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.19
PSMA4-212ENST00000559365 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.17■■■■■ 4.18
PSMA4-212ENST00000559365 ZFYVE9O95405 1425 aa41.14■■■■■ 4.18
PSMA4-212ENST00000559365 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.1■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms