RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559322.5

SEMA4B-211, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 559 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-211ENST00000559322 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.44■■■□□ 2.62
SEMA4B-211ENST00000559322 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.41■■■□□ 2.62
SEMA4B-211ENST00000559322 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
SEMA4B-211ENST00000559322 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.37■■■□□ 2.61
SEMA4B-211ENST00000559322 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.37■■■□□ 2.615e-6■■■■■ 30.5
SEMA4B-211ENST00000559322 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
SEMA4B-211ENST00000559322 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
SEMA4B-211ENST00000559322 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.34■■■□□ 2.61
SEMA4B-211ENST00000559322 KIF3BO15066 747 aa31.34■■■□□ 2.61
SEMA4B-211ENST00000559322 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
SEMA4B-211ENST00000559322 PZPP20742 1482 aa31.33■■■□□ 2.61
SEMA4B-211ENST00000559322 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.33■■■□□ 2.61
SEMA4B-211ENST00000559322 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.32■■■□□ 2.6
SEMA4B-211ENST00000559322 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
SEMA4B-211ENST00000559322 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.31■■■□□ 2.6
SEMA4B-211ENST00000559322 MBD5Q9P267 1494 aa31.3■■■□□ 2.6
SEMA4B-211ENST00000559322 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.28■■■□□ 2.6
SEMA4B-211ENST00000559322 ALKQ9UM73 1620 aa31.27■■■□□ 2.6
SEMA4B-211ENST00000559322 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.27■■■□□ 2.6
SEMA4B-211ENST00000559322 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.27■■■□□ 2.6
SEMA4B-211ENST00000559322 NLRP1Q9C000 1473 aa31.27■■■□□ 2.6
SEMA4B-211ENST00000559322 MIA2Q96PC5 1412 aa31.26■■■□□ 2.6
SEMA4B-211ENST00000559322 MED14O60244 1454 aa31.26■■■□□ 2.59
SEMA4B-211ENST00000559322 TIAM1Q13009 1591 aa31.26■■■□□ 2.59
SEMA4B-211ENST00000559322 DEPDC5O75140 1603 aa31.24■■■□□ 2.59
SEMA4B-211ENST00000559322 IQGAP1P46940 1657 aa31.2■■■□□ 2.59
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.17■■■□□ 2.58
SEMA4B-211ENST00000559322 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.17■■■□□ 2.58
SEMA4B-211ENST00000559322 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
SEMA4B-211ENST00000559322 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.16■■■□□ 2.58
SEMA4B-211ENST00000559322 SYNMO15061 1565 aa31.13■■■□□ 2.57
SEMA4B-211ENST00000559322 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.11■■■□□ 2.57
SEMA4B-211ENST00000559322 STRCP1A6NGW2 1772 aa31.1■■■□□ 2.57
SEMA4B-211ENST00000559322 CEP162Q5TB80 1403 aa31.1■■■□□ 2.57
SEMA4B-211ENST00000559322 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.07■■■□□ 2.56
SEMA4B-211ENST00000559322 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
SEMA4B-211ENST00000559322 TSPY4P0CV99 314 aa31.04■■■□□ 2.56
SEMA4B-211ENST00000559322 TSPY10P0CW01 314 aa31.04■■■□□ 2.56
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCC3O15438 1527 aa30.98■■■□□ 2.55
SEMA4B-211ENST00000559322 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
SEMA4B-211ENST00000559322 ERVK-7P63135 1459 aa30.97■■■□□ 2.55
SEMA4B-211ENST00000559322 NCOA2Q15596 1464 aa30.96■■■□□ 2.55
SEMA4B-211ENST00000559322 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.94■■■□□ 2.54
SEMA4B-211ENST00000559322 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.91■■■□□ 2.54
SEMA4B-211ENST00000559322 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.91■■■□□ 2.54
SEMA4B-211ENST00000559322 LTKP29376 864 aa30.88■■■□□ 2.53
SEMA4B-211ENST00000559322 POTEAQ6S8J7 498 aa30.88■■■□□ 2.53
SEMA4B-211ENST00000559322 EID1Q9Y6B2 187 aa30.87■■■□□ 2.53
SEMA4B-211ENST00000559322 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.86■■■□□ 2.53
SEMA4B-211ENST00000559322 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
SEMA4B-211ENST00000559322 SLIT1O75093 1534 aa30.83■■■□□ 2.53
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.83■■■□□ 2.53
SEMA4B-211ENST00000559322 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
SEMA4B-211ENST00000559322 CEP152O94986 1710 aa30.81■■■□□ 2.52
SEMA4B-211ENST00000559322 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.8■■■□□ 2.52
SEMA4B-211ENST00000559322 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.79■■■□□ 2.52
SEMA4B-211ENST00000559322 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
SEMA4B-211ENST00000559322 TMEM94Q12767 1356 aa30.77■■■□□ 2.52
SEMA4B-211ENST00000559322 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.76■■■□□ 2.51
SEMA4B-211ENST00000559322 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.73■■■□□ 2.51
SEMA4B-211ENST00000559322 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.72■■■□□ 2.51
SEMA4B-211ENST00000559322 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.7■■■□□ 2.5
SEMA4B-211ENST00000559322 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.69■■■□□ 2.5
SEMA4B-211ENST00000559322 KCNA6P17658 529 aa30.69■■■□□ 2.5
SEMA4B-211ENST00000559322 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.68■■■□□ 2.5
SEMA4B-211ENST00000559322 PIK3C2BO00750 1634 aa30.67■■■□□ 2.5
SEMA4B-211ENST00000559322 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
SEMA4B-211ENST00000559322 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
SEMA4B-211ENST00000559322 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.64■■■□□ 2.5
SEMA4B-211ENST00000559322 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
SEMA4B-211ENST00000559322 MAP3K1Q13233 1512 aa30.63■■■□□ 2.49
SEMA4B-211ENST00000559322 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.49
SEMA4B-211ENST00000559322 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.61■■■□□ 2.49
SEMA4B-211ENST00000559322 MSH6P52701 1360 aa30.6■■■□□ 2.49
SEMA4B-211ENST00000559322 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.59■■■□□ 2.49
SEMA4B-211ENST00000559322 KIF15Q9NS87 1388 aa30.59■■■□□ 2.49
SEMA4B-211ENST00000559322 JCADQ9P266 1359 aa30.58■■■□□ 2.49
SEMA4B-211ENST00000559322 ERBINQ96RT1 1412 aa30.57■■■□□ 2.48
SEMA4B-211ENST00000559322 KANK1Q14678 1352 aa30.57■■■□□ 2.48
SEMA4B-211ENST00000559322 BCANQ96GW7 911 aa30.57■■■□□ 2.48
SEMA4B-211ENST00000559322 PHLPP1O60346 1717 aa30.56■■■□□ 2.48
SEMA4B-211ENST00000559322 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
SEMA4B-211ENST00000559322 IDI1Q13907 227 aa30.55■■■□□ 2.48
SEMA4B-211ENST00000559322 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.55■■■□□ 2.48
SEMA4B-211ENST00000559322 SLAIN2Q9P270 581 aa30.55■■■□□ 2.48
SEMA4B-211ENST00000559322 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
SEMA4B-211ENST00000559322 TET3O43151 1660 aa30.54■■■□□ 2.48
SEMA4B-211ENST00000559322 NWD1Q149M9 1564 aa30.5■■■□□ 2.47
SEMA4B-211ENST00000559322 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
SEMA4B-211ENST00000559322 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
SEMA4B-211ENST00000559322 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.47
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
SEMA4B-211ENST00000559322 TRIM52Q96A61 297 aa30.45■■■□□ 2.47
SEMA4B-211ENST00000559322 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.44■■■□□ 2.46
SEMA4B-211ENST00000559322 ADGRB3O60242 1522 aa30.43■■■□□ 2.46
SEMA4B-211ENST00000559322 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.43■■■□□ 2.46
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCC5O15440 1437 aa30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms