RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.11■■■□□ 2.73
TMOD3-203ENST00000558455 NCOA1Q15788 1441 aa32.11■■■□□ 2.73
TMOD3-203ENST00000558455 ZMYM3Q14202 1370 aa32.1■■■□□ 2.73
TMOD3-203ENST00000558455 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
TMOD3-203ENST00000558455 ERBINQ96RT1 1412 aa32.09■■■□□ 2.73
TMOD3-203ENST00000558455 PTPRKQ15262 1439 aa32.09■■■□□ 2.73
TMOD3-203ENST00000558455 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.08■■■□□ 2.733e-7■■□□□ 11.7
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TMOD3-203ENST00000558455 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.07■■■□□ 2.72
TMOD3-203ENST00000558455 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
TMOD3-203ENST00000558455 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.03■■■□□ 2.72
TMOD3-203ENST00000558455 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.02■■■□□ 2.72
TMOD3-203ENST00000558455 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.01■■■□□ 2.71
TMOD3-203ENST00000558455 NPATQ14207 1427 aa32■■■□□ 2.71
TMOD3-203ENST00000558455 ITGAEP38570 1179 aa31.99■■■□□ 2.71
TMOD3-203ENST00000558455 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.98■■■□□ 2.71
TMOD3-203ENST00000558455 ABCC3O15438 1527 aa31.97■■■□□ 2.71
TMOD3-203ENST00000558455 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
TMOD3-203ENST00000558455 ROCK1Q13464 1354 aa31.95■■■□□ 2.71
TMOD3-203ENST00000558455 HSPA2P54652 639 aa31.95■■■□□ 2.71
TMOD3-203ENST00000558455 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.93■■■□□ 2.7
TMOD3-203ENST00000558455 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
TMOD3-203ENST00000558455 DEPDC5O75140 1603 aa31.93■■■□□ 2.7
TMOD3-203ENST00000558455 PZPP20742 1482 aa31.92■■■□□ 2.7
TMOD3-203ENST00000558455 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.89■■■□□ 2.7
TMOD3-203ENST00000558455 CEP152O94986 1710 aa31.87■■■□□ 2.69
TMOD3-203ENST00000558455 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
TMOD3-203ENST00000558455 KANK1Q14678 1352 aa31.84■■■□□ 2.69
TMOD3-203ENST00000558455 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.83■■■□□ 2.69
TMOD3-203ENST00000558455 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.83■■■□□ 2.69
TMOD3-203ENST00000558455 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.81■■■□□ 2.68
TMOD3-203ENST00000558455 TNRQ92752 1358 aa31.81■■■□□ 2.68
TMOD3-203ENST00000558455 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.76■■■□□ 2.68
TMOD3-203ENST00000558455 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
TMOD3-203ENST00000558455 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.75■■■□□ 2.67
TMOD3-203ENST00000558455 ERVK-7P63135 1459 aa31.75■■■□□ 2.67
TMOD3-203ENST00000558455 UNC13BO14795 1591 aa31.73■■■□□ 2.67
TMOD3-203ENST00000558455 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.73■■■□□ 2.67
TMOD3-203ENST00000558455 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.72■■■□□ 2.67
TMOD3-203ENST00000558455 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.68■■■□□ 2.66
TMOD3-203ENST00000558455 NAIPQ13075 1403 aa31.67■■■□□ 2.66
TMOD3-203ENST00000558455 NLRP1Q9C000 1473 aa31.67■■■□□ 2.66
TMOD3-203ENST00000558455 STRCQ7RTU9 1775 aa31.64■■■□□ 2.66
TMOD3-203ENST00000558455 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.64■■■□□ 2.65
TMOD3-203ENST00000558455 HFM1A2PYH4 1435 aa31.63■■■□□ 2.65
TMOD3-203ENST00000558455 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
TMOD3-203ENST00000558455 TET3O43151 1660 aa31.6■■■□□ 2.65
TMOD3-203ENST00000558455 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.6■■■□□ 2.65
TMOD3-203ENST00000558455 PLA2R1Q13018 1463 aa31.59■■■□□ 2.65
TMOD3-203ENST00000558455 NUP155O75694 1391 aa31.59■■■□□ 2.65
TMOD3-203ENST00000558455 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.57■■■□□ 2.64
TMOD3-203ENST00000558455 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
TMOD3-203ENST00000558455 NOS1P29475 1434 aa31.54■■■□□ 2.64
TMOD3-203ENST00000558455 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.53■■■□□ 2.64
TMOD3-203ENST00000558455 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.52■■■□□ 2.64
TMOD3-203ENST00000558455 SYNMO15061 1565 aa31.52■■■□□ 2.64
TMOD3-203ENST00000558455 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
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TMOD3-203ENST00000558455 E9PCH4 1651 aa31.48■■■□□ 2.63
TMOD3-203ENST00000558455 PKD2Q13563 968 aa31.48■■■□□ 2.63
TMOD3-203ENST00000558455 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.45■■■□□ 2.63
TMOD3-203ENST00000558455 PIK3C2BO00750 1634 aa31.45■■■□□ 2.62
TMOD3-203ENST00000558455 IDI1Q13907 227 aa31.43■■■□□ 2.62
TMOD3-203ENST00000558455 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.4■■■□□ 2.62
TMOD3-203ENST00000558455 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.39■■■□□ 2.62
TMOD3-203ENST00000558455 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
TMOD3-203ENST00000558455 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.39■■■□□ 2.62
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM52Q96A61 297 aa31.39■■■□□ 2.62
TMOD3-203ENST00000558455 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.37■■■□□ 2.61
TMOD3-203ENST00000558455 ADGRB3O60242 1522 aa31.35■■■□□ 2.61
TMOD3-203ENST00000558455 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
TMOD3-203ENST00000558455 SLIT1O75093 1534 aa31.34■■■□□ 2.61
TMOD3-203ENST00000558455 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.33■■■□□ 2.61
TMOD3-203ENST00000558455 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.31■■■□□ 2.6
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.3■■■□□ 2.6
TMOD3-203ENST00000558455 MED14O60244 1454 aa31.3■■■□□ 2.6
TMOD3-203ENST00000558455 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
TMOD3-203ENST00000558455 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
TMOD3-203ENST00000558455 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
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TMOD3-203ENST00000558455 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.25■■■□□ 2.59
TMOD3-203ENST00000558455 EID1Q9Y6B2 187 aa31.24■■■□□ 2.59
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.24■■■□□ 2.59
TMOD3-203ENST00000558455 IQGAP1P46940 1657 aa31.23■■■□□ 2.59
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
TMOD3-203ENST00000558455 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.22■■■□□ 2.59
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TMOD3-203ENST00000558455 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
TMOD3-203ENST00000558455 TRPM2O94759 1503 aa31.2■■■□□ 2.59
TMOD3-203ENST00000558455 CERKQ8TCT0 537 aa31.19■■■□□ 2.58
TMOD3-203ENST00000558455 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.18■■■□□ 2.58
TMOD3-203ENST00000558455 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
TMOD3-203ENST00000558455 ZFYVE9O95405 1425 aa31.15■■■□□ 2.58
TMOD3-203ENST00000558455 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.15■■■□□ 2.58
TMOD3-203ENST00000558455 CLTCL1P53675 1640 aa31.15■■■□□ 2.58
TMOD3-203ENST00000558455 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.14■■■□□ 2.58
TMOD3-203ENST00000558455 FOXD1Q16676 465 aa31.13■■■□□ 2.57
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