RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558139.1

LHX4-202, Transcript of LIM homeobox 4, humanhuman

TSL 3

Gene LHX4, Length 721 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4-202ENST00000558139 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.97■■■□□ 2.23
LHX4-202ENST00000558139 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
LHX4-202ENST00000558139 POTEAQ6S8J7 498 aa28.96■■■□□ 2.23
LHX4-202ENST00000558139 MED14O60244 1454 aa28.96■■■□□ 2.23
LHX4-202ENST00000558139 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.96■■■□□ 2.23
LHX4-202ENST00000558139 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.95■■■□□ 2.23
LHX4-202ENST00000558139 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.94■■■□□ 2.22
LHX4-202ENST00000558139 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
LHX4-202ENST00000558139 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
LHX4-202ENST00000558139 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.92■■■□□ 2.22
LHX4-202ENST00000558139 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.9■■■□□ 2.22
LHX4-202ENST00000558139 PZPP20742 1482 aa28.89■■■□□ 2.22
LHX4-202ENST00000558139 MIA2Q96PC5 1412 aa28.88■■■□□ 2.21
LHX4-202ENST00000558139 NLRP1Q9C000 1473 aa28.87■■■□□ 2.21
LHX4-202ENST00000558139 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.87■■■□□ 2.21
LHX4-202ENST00000558139 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
LHX4-202ENST00000558139 KIF3BO15066 747 aa28.86■■■□□ 2.21
LHX4-202ENST00000558139 DEPDC5O75140 1603 aa28.86■■■□□ 2.21
LHX4-202ENST00000558139 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
LHX4-202ENST00000558139 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.85■■■□□ 2.21
LHX4-202ENST00000558139 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.83■■■□□ 2.21
LHX4-202ENST00000558139 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.82■■■□□ 2.2
LHX4-202ENST00000558139 SYNMO15061 1565 aa28.79■■■□□ 2.2
LHX4-202ENST00000558139 IQGAP1P46940 1657 aa28.79■■■□□ 2.2
LHX4-202ENST00000558139 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.77■■■□□ 2.2
LHX4-202ENST00000558139 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.77■■■□□ 2.2
LHX4-202ENST00000558139 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.76■■■□□ 2.19
LHX4-202ENST00000558139 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.74■■■□□ 2.19
LHX4-202ENST00000558139 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
LHX4-202ENST00000558139 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.69■■■□□ 2.18
LHX4-202ENST00000558139 MBD5Q9P267 1494 aa28.68■■■□□ 2.18
LHX4-202ENST00000558139 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.63■■■□□ 2.17
LHX4-202ENST00000558139 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.61■■■□□ 2.17
LHX4-202ENST00000558139 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.61■■■□□ 2.17
LHX4-202ENST00000558139 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.59■■■□□ 2.17
LHX4-202ENST00000558139 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
LHX4-202ENST00000558139 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.58■■■□□ 2.17
LHX4-202ENST00000558139 LTKP29376 864 aa28.57■■■□□ 2.16
LHX4-202ENST00000558139 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
LHX4-202ENST00000558139 EID1Q9Y6B2 187 aa28.55■■■□□ 2.16
LHX4-202ENST00000558139 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
LHX4-202ENST00000558139 TMEM94Q12767 1356 aa28.53■■■□□ 2.16
LHX4-202ENST00000558139 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.5■■■□□ 2.15
LHX4-202ENST00000558139 JCADQ9P266 1359 aa28.5■■■□□ 2.15
LHX4-202ENST00000558139 ERVK-7P63135 1459 aa28.49■■■□□ 2.15
LHX4-202ENST00000558139 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
LHX4-202ENST00000558139 TSPY4P0CV99 314 aa28.47■■■□□ 2.15
LHX4-202ENST00000558139 TSPY10P0CW01 314 aa28.47■■■□□ 2.15
LHX4-202ENST00000558139 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
LHX4-202ENST00000558139 TRIM52Q96A61 297 aa28.47■■■□□ 2.15
LHX4-202ENST00000558139 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
LHX4-202ENST00000558139 KCNA6P17658 529 aa28.46■■■□□ 2.15
LHX4-202ENST00000558139 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.45■■■□□ 2.15
LHX4-202ENST00000558139 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.45■■■□□ 2.14
LHX4-202ENST00000558139 TIAM1Q13009 1591 aa28.45■■■□□ 2.14
LHX4-202ENST00000558139 NCOA2Q15596 1464 aa28.44■■■□□ 2.14
LHX4-202ENST00000558139 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.44■■■□□ 2.14
LHX4-202ENST00000558139 ABCC3O15438 1527 aa28.43■■■□□ 2.14
LHX4-202ENST00000558139 SLIT1O75093 1534 aa28.43■■■□□ 2.14
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LHX4-202ENST00000558139 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
LHX4-202ENST00000558139 SLAIN2Q9P270 581 aa28.41■■■□□ 2.14
LHX4-202ENST00000558139 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.4■■■□□ 2.14
LHX4-202ENST00000558139 RXRBP28702 533 aa28.37■■■□□ 2.13
LHX4-202ENST00000558139 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.37■■■□□ 2.13
LHX4-202ENST00000558139 CEP162Q5TB80 1403 aa28.36■■■□□ 2.13
LHX4-202ENST00000558139 MSH6P52701 1360 aa28.36■■■□□ 2.13
LHX4-202ENST00000558139 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.35■■■□□ 2.13
LHX4-202ENST00000558139 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.35■■■□□ 2.13
LHX4-202ENST00000558139 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.34■■■□□ 2.13
LHX4-202ENST00000558139 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.33■■■□□ 2.13
LHX4-202ENST00000558139 MAP3K1Q13233 1512 aa28.33■■■□□ 2.13
LHX4-202ENST00000558139 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.32■■■□□ 2.12
LHX4-202ENST00000558139 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.31■■■□□ 2.12
LHX4-202ENST00000558139 PHLPP1O60346 1717 aa28.29■■■□□ 2.12
LHX4-202ENST00000558139 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
LHX4-202ENST00000558139 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.26■■■□□ 2.12
LHX4-202ENST00000558139 LRP6O75581 1613 aa28.25■■■□□ 2.11
LHX4-202ENST00000558139 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
LHX4-202ENST00000558139 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.23■■■□□ 2.11
LHX4-202ENST00000558139 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.22■■■□□ 2.11
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LHX4-202ENST00000558139 BCANQ96GW7 911 aa28.21■■■□□ 2.11
LHX4-202ENST00000558139 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
LHX4-202ENST00000558139 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
LHX4-202ENST00000558139 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
LHX4-202ENST00000558139 TET3O43151 1660 aa28.16■■■□□ 2.1
LHX4-202ENST00000558139 IDI1Q13907 227 aa28.16■■■□□ 2.1
LHX4-202ENST00000558139 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.16■■■□□ 2.1
LHX4-202ENST00000558139 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.14■■■□□ 2.1
LHX4-202ENST00000558139 CEP152O94986 1710 aa28.13■■■□□ 2.09
LHX4-202ENST00000558139 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
LHX4-202ENST00000558139 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
LHX4-202ENST00000558139 FOXD1Q16676 465 aa28.13■■■□□ 2.09
LHX4-202ENST00000558139 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
LHX4-202ENST00000558139 PIK3C2BO00750 1634 aa28.13■■■□□ 2.09
LHX4-202ENST00000558139 NWD1Q149M9 1564 aa28.11■■■□□ 2.09
LHX4-202ENST00000558139 C14orf37Q86TY3 774 aa28.11■■■□□ 2.09
LHX4-202ENST00000558139 AFF2P51816 1311 aa28.1■■■□□ 2.09
LHX4-202ENST00000558139 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.09■■■□□ 2.09
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