RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556049.1

PITX2-208, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

TSL 2

Gene PITX2, Length 941 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-208ENST00000556049 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PITX2-208ENST00000556049 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PITX2-208ENST00000556049 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PITX2-208ENST00000556049 TIAM1Q13009 1591 aa15.33■□□□□ 0.05
PITX2-208ENST00000556049 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.33■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.33■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.32■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 PTPRKQ15262 1439 aa15.32■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 MBD5Q9P267 1494 aa15.31■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 PLXNC1O60486 1568 aa15.31■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.31■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.3■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 NCOA2Q15596 1464 aa15.3■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.29■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.27■□□□□ 0.04
PITX2-208ENST00000556049 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 TNRQ92752 1358 aa15.26■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.26■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.26■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 APLP2Q06481 763 aa15.26■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 PLA2R1Q13018 1463 aa15.26■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 ANKLE2Q86XL3 938 aa15.25■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.25■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.25■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.24■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.24■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.22■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.21■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.21■□□□□ 0.03
PITX2-208ENST00000556049 PIP4K2BP78356 416 aa15.2■□□□□ 0.02
PITX2-208ENST00000556049 PZPP20742 1482 aa15.2■□□□□ 0.02
PITX2-208ENST00000556049 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.2■□□□□ 0.02
PITX2-208ENST00000556049 MIA2Q96PC5 1412 aa15.19■□□□□ 0.02
PITX2-208ENST00000556049 TOM1O60784 492 aa15.19■□□□□ 0.02
PITX2-208ENST00000556049 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PITX2-208ENST00000556049 ILDR2Q71H61 639 aa15.19■□□□□ 0.02
PITX2-208ENST00000556049 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
PITX2-208ENST00000556049 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PITX2-208ENST00000556049 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.17■□□□□ 0.02
PITX2-208ENST00000556049 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.17■□□□□ 0.02
PITX2-208ENST00000556049 SOCS7O14512 581 aa15.16■□□□□ 0.02
PITX2-208ENST00000556049 NLRP1Q9C000 1473 aa15.14■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.14■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.14■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.14■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 BCANQ96GW7 911 aa15.13■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.13■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.12■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.12■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 MAP3K1Q13233 1512 aa15.11■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 CPS1P31327 1500 aa15.1■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 HSPA1LP34931 641 aa15.09■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 KIF15Q9NS87 1388 aa15.09■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 ABCC3O15438 1527 aa15.08■□□□□ 0.01
PITX2-208ENST00000556049 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.08■□□□□ 0
PITX2-208ENST00000556049 EID1Q9Y6B2 187 aa15.08■□□□□ 0
PITX2-208ENST00000556049 KANK1Q14678 1352 aa15.08■□□□□ 0
PITX2-208ENST00000556049 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.07■□□□□ 0
PITX2-208ENST00000556049 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.07■□□□□ 0
PITX2-208ENST00000556049 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.07■□□□□ 0
PITX2-208ENST00000556049 ERVK-7P63135 1459 aa15.06■□□□□ 0
PITX2-208ENST00000556049 NEURL4Q96JN8 1562 aa15.06■□□□□ 0
PITX2-208ENST00000556049 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PITX2-208ENST00000556049 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PITX2-208ENST00000556049 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PITX2-208ENST00000556049 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PITX2-208ENST00000556049 MED14O60244 1454 aa15.04■□□□□ -0
PITX2-208ENST00000556049 ABCC5O15440 1437 aa15.02■□□□□ -0
PITX2-208ENST00000556049 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.02■□□□□ -0
PITX2-208ENST00000556049 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
PITX2-208ENST00000556049 DEPDC5O75140 1603 aa15.02□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 ERBINQ96RT1 1412 aa15.01□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 IQGAP1P46940 1657 aa15□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 VWDEQ8N2E2 1590 aa15□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 LTKP29376 864 aa15□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 CEP152O94986 1710 aa15□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 DAPK1P53355 1430 aa15□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.99□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.99□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.98□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.96□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 IDI1Q13907 227 aa14.96□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 HOMEZQ8IX15 550 aa14.96□□□□□ -0.01
PITX2-208ENST00000556049 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.95□□□□□ -0.02
PITX2-208ENST00000556049 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PITX2-208ENST00000556049 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.94□□□□□ -0.02
PITX2-208ENST00000556049 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms