RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
NEDD1-208ENST00000555806 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.57■■■□□ 2.16
NEDD1-208ENST00000555806 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
NEDD1-208ENST00000555806 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.55■■■□□ 2.16
NEDD1-208ENST00000555806 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.55■■■□□ 2.16
NEDD1-208ENST00000555806 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
NEDD1-208ENST00000555806 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
NEDD1-208ENST00000555806 STRCQ7RTU9 1775 aa28.54■■■□□ 2.16
NEDD1-208ENST00000555806 KIF15Q9NS87 1388 aa28.53■■■□□ 2.16
NEDD1-208ENST00000555806 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.5■■■□□ 2.15
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
NEDD1-208ENST00000555806 PZPP20742 1482 aa28.49■■■□□ 2.15
NEDD1-208ENST00000555806 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
NEDD1-208ENST00000555806 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.49■■■□□ 2.15
NEDD1-208ENST00000555806 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
NEDD1-208ENST00000555806 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.47■■■□□ 2.15
NEDD1-208ENST00000555806 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.47■■■□□ 2.15
NEDD1-208ENST00000555806 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
NEDD1-208ENST00000555806 NCOA1Q15788 1441 aa28.45■■■□□ 2.15
NEDD1-208ENST00000555806 ERBINQ96RT1 1412 aa28.45■■■□□ 2.15
NEDD1-208ENST00000555806 ABCC3O15438 1527 aa28.45■■■□□ 2.15
NEDD1-208ENST00000555806 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.45■■■□□ 2.14
NEDD1-208ENST00000555806 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.44■■■□□ 2.14
NEDD1-208ENST00000555806 TNRQ92752 1358 aa28.44■■■□□ 2.14
NEDD1-208ENST00000555806 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.4■■■□□ 2.14
NEDD1-208ENST00000555806 PTPRTO14522 1441 aa28.4■■■□□ 2.14
NEDD1-208ENST00000555806 CEP152O94986 1710 aa28.4■■■□□ 2.14
NEDD1-208ENST00000555806 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
NEDD1-208ENST00000555806 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
NEDD1-208ENST00000555806 PLA2R1Q13018 1463 aa28.36■■■□□ 2.13
NEDD1-208ENST00000555806 FBXO41Q8TF61 875 aa28.36■■■□□ 2.13
NEDD1-208ENST00000555806 ADGRL2O95490 1459 aa28.35■■■□□ 2.13
NEDD1-208ENST00000555806 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
NEDD1-208ENST00000555806 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.35■■■□□ 2.13
NEDD1-208ENST00000555806 DEPDC5O75140 1603 aa28.32■■■□□ 2.12
NEDD1-208ENST00000555806 CERKQ8TCT0 537 aa28.31■■■□□ 2.12
NEDD1-208ENST00000555806 KANK1Q14678 1352 aa28.31■■■□□ 2.12
NEDD1-208ENST00000555806 NLRP1Q9C000 1473 aa28.31■■■□□ 2.12
NEDD1-208ENST00000555806 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.3■■■□□ 2.12
NEDD1-208ENST00000555806 ERVK-7P63135 1459 aa28.3■■■□□ 2.12
NEDD1-208ENST00000555806 PKD2Q13563 968 aa28.3■■■□□ 2.12
NEDD1-208ENST00000555806 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.24■■■□□ 2.11
NEDD1-208ENST00000555806 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
NEDD1-208ENST00000555806 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.23■■■□□ 2.11
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.23■■■□□ 2.11
NEDD1-208ENST00000555806 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
NEDD1-208ENST00000555806 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
NEDD1-208ENST00000555806 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
NEDD1-208ENST00000555806 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.2■■■□□ 2.1
NEDD1-208ENST00000555806 ITGAEP38570 1179 aa28.19■■■□□ 2.1
NEDD1-208ENST00000555806 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.18■■■□□ 2.1
NEDD1-208ENST00000555806 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.16■■■□□ 2.1
NEDD1-208ENST00000555806 ROCK1Q13464 1354 aa28.15■■■□□ 2.1
NEDD1-208ENST00000555806 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.15■■■□□ 2.1
NEDD1-208ENST00000555806 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.15■■■□□ 2.1
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
NEDD1-208ENST00000555806 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.13■■■□□ 2.09
NEDD1-208ENST00000555806 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.1■■■□□ 2.09
NEDD1-208ENST00000555806 UNC13BO14795 1591 aa28.08■■■□□ 2.09
NEDD1-208ENST00000555806 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
NEDD1-208ENST00000555806 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
NEDD1-208ENST00000555806 PIK3C2BO00750 1634 aa28.05■■■□□ 2.08
NEDD1-208ENST00000555806 TET3O43151 1660 aa28.04■■■□□ 2.08
NEDD1-208ENST00000555806 SYNMO15061 1565 aa28.03■■■□□ 2.08
NEDD1-208ENST00000555806 MED14O60244 1454 aa28.03■■■□□ 2.08
NEDD1-208ENST00000555806 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.03■■■□□ 2.08
NEDD1-208ENST00000555806 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.02■■■□□ 2.08
NEDD1-208ENST00000555806 IQGAP1P46940 1657 aa28.02■■■□□ 2.08
NEDD1-208ENST00000555806 NOS1P29475 1434 aa28.01■■■□□ 2.08
NEDD1-208ENST00000555806 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
NEDD1-208ENST00000555806 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28■■■□□ 2.07
NEDD1-208ENST00000555806 SLIT1O75093 1534 aa27.98■■■□□ 2.07
NEDD1-208ENST00000555806 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
NEDD1-208ENST00000555806 IDI1Q13907 227 aa27.98■■■□□ 2.07
NEDD1-208ENST00000555806 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.97■■■□□ 2.07
NEDD1-208ENST00000555806 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.96■■■□□ 2.07
NEDD1-208ENST00000555806 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
NEDD1-208ENST00000555806 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.95■■■□□ 2.06
NEDD1-208ENST00000555806 NUP155O75694 1391 aa27.95■■■□□ 2.06
NEDD1-208ENST00000555806 EID1Q9Y6B2 187 aa27.94■■■□□ 2.06
NEDD1-208ENST00000555806 LTKP29376 864 aa27.93■■■□□ 2.06
NEDD1-208ENST00000555806 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.93■■■□□ 2.06
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.93■■■□□ 2.06
NEDD1-208ENST00000555806 ADGRB3O60242 1522 aa27.92■■■□□ 2.06
NEDD1-208ENST00000555806 CPS1P31327 1500 aa27.92■■■□□ 2.06
NEDD1-208ENST00000555806 E9PCH4 1651 aa27.92■■■□□ 2.06
NEDD1-208ENST00000555806 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.86■■■□□ 2.05
NEDD1-208ENST00000555806 NAIPQ13075 1403 aa27.84■■■□□ 2.05
NEDD1-208ENST00000555806 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
NEDD1-208ENST00000555806 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.8■■■□□ 2.04
NEDD1-208ENST00000555806 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.8■■■□□ 2.04
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.78■■■□□ 2.04
NEDD1-208ENST00000555806 HFM1A2PYH4 1435 aa27.77■■■□□ 2.04
NEDD1-208ENST00000555806 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.75■■■□□ 2.03
NEDD1-208ENST00000555806 BCANQ96GW7 911 aa27.74■■■□□ 2.03
NEDD1-208ENST00000555806 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.73■■■□□ 2.03
NEDD1-208ENST00000555806 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.73■■■□□ 2.03
NEDD1-208ENST00000555806 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
NEDD1-208ENST00000555806 ZFYVE9O95405 1425 aa27.73■■■□□ 2.03
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