RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	NCOA1	Q15788	1441 aa		43.42	■■■■■ 4.54
PCNX1-206	ENST00000554292	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	43.42	■■■■■ 4.54
PCNX1-206	ENST00000554292	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	43.42	■■■■■ 4.54
PCNX1-206	ENST00000554292	C3	P01024	1663 aa		43.4	■■■■■ 4.54
PCNX1-206	ENST00000554292	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		43.38	■■■■■ 4.53
PCNX1-206	ENST00000554292	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		43.33	■■■■■ 4.53
PCNX1-206	ENST00000554292	PTPRK	Q15262	1439 aa		43.31	■■■■■ 4.52
PCNX1-206	ENST00000554292	ROCK1	Q13464	1354 aa		43.29	■■■■■ 4.52
PCNX1-206	ENST00000554292	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	43.29	■■■■■ 4.52
PCNX1-206	ENST00000554292	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	43.28	■■■■■ 4.52
PCNX1-206	ENST00000554292	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	43.27	■■■■■ 4.52
PCNX1-206	ENST00000554292	ZMYM3	Q14202	1370 aa		43.27	■■■■■ 4.52
PCNX1-206	ENST00000554292	ITGAE	P38570	1179 aa		43.26	■■■■■ 4.52
PCNX1-206	ENST00000554292	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		43.24	■■■■■ 4.51
PCNX1-206	ENST00000554292	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		43.23	■■■■■ 4.51
PCNX1-206	ENST00000554292	DEPDC5	O75140	1603 aa		43.22	■■■■■ 4.51
PCNX1-206	ENST00000554292	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		43.22	■■■■■ 4.51
PCNX1-206	ENST00000554292	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	43.22	■■■■■ 4.51
PCNX1-206	ENST00000554292	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		43.2	■■■■■ 4.51
PCNX1-206	ENST00000554292	NPAT	Q14207	1427 aa		43.18	■■■■■ 4.5
PCNX1-206	ENST00000554292	ABCC3	O15438	1527 aa		43.16	■■■■■ 4.5
PCNX1-206	ENST00000554292	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		43.13	■■■■■ 4.5
PCNX1-206	ENST00000554292	CEP152	O94986	1710 aa		43.13	■■■■■ 4.49
PCNX1-206	ENST00000554292	KANK1	Q14678	1352 aa		43.12	■■■■■ 4.49
PCNX1-206	ENST00000554292	PZP	P20742	1482 aa		43.09	■■■■■ 4.49
PCNX1-206	ENST00000554292	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		43.09	■■■■■ 4.49
PCNX1-206	ENST00000554292	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		43.06	■■■■■ 4.48
PCNX1-206	ENST00000554292	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	43.04	■■■■■ 4.48
PCNX1-206	ENST00000554292	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		43	■■■■■ 4.47
PCNX1-206	ENST00000554292	UNC13B	O14795	1591 aa		42.99	■■■■■ 4.47
PCNX1-206	ENST00000554292	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.98	■■■■■ 4.47
PCNX1-206	ENST00000554292	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.97	■■■■■ 4.47
PCNX1-206	ENST00000554292	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.96	■■■■■ 4.47
PCNX1-206	ENST00000554292	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.92	■■■■■ 4.46
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.91	■■■■■ 4.46
PCNX1-206	ENST00000554292	TNR	Q92752	1358 aa		42.9	■■■■■ 4.46
PCNX1-206	ENST00000554292	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.88	■■■■■ 4.45
PCNX1-206	ENST00000554292	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.88	■■■■■ 4.45
PCNX1-206	ENST00000554292	NAIP	Q13075	1403 aa		42.88	■■■■■ 4.45
PCNX1-206	ENST00000554292	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	42.87	■■■■■ 4.45
PCNX1-206	ENST00000554292	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.86	■■■■■ 4.45
PCNX1-206	ENST00000554292	HSPA2	P54652	639 aa		42.85	■■■■■ 4.45
PCNX1-206	ENST00000554292	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PCNX1-206	ENST00000554292	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PCNX1-206	ENST00000554292	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.84	■■■■■ 4.45
PCNX1-206	ENST00000554292	TET3	O43151	1660 aa		42.83	■■■■■ 4.45
PCNX1-206	ENST00000554292	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.82	■■■■■ 4.44
PCNX1-206	ENST00000554292	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.78	■■■■■ 4.44
PCNX1-206	ENST00000554292	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.78	■■■■■ 4.44
PCNX1-206	ENST00000554292	NUP155	O75694	1391 aa		42.74	■■■■■ 4.43
PCNX1-206	ENST00000554292	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.74	■■■■■ 4.43
PCNX1-206	ENST00000554292		E9PCH4	1651 aa		42.62	■■■■■ 4.41
PCNX1-206	ENST00000554292	STRC	Q7RTU9	1775 aa		42.62	■■■■■ 4.41
PCNX1-206	ENST00000554292	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.61	■■■■■ 4.41
PCNX1-206	ENST00000554292	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.61	■■■■■ 4.41
PCNX1-206	ENST00000554292	NOS1	P29475	1434 aa		42.59	■■■■■ 4.41
PCNX1-206	ENST00000554292	SYNM	O15061	1565 aa		42.56	■■■■■ 4.4
PCNX1-206	ENST00000554292	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
PCNX1-206	ENST00000554292	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.52	■■■■■ 4.4
PCNX1-206	ENST00000554292	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.51	■■■■■ 4.4
PCNX1-206	ENST00000554292	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.51	■■■■■ 4.4
PCNX1-206	ENST00000554292	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	42.5	■■■■■ 4.39
PCNX1-206	ENST00000554292	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.49	■■■■■ 4.39
PCNX1-206	ENST00000554292	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
PCNX1-206	ENST00000554292	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.48	■■■■■ 4.39
PCNX1-206	ENST00000554292	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		42.46	■■■■■ 4.39
PCNX1-206	ENST00000554292	PKD2	Q13563	968 aa		42.45	■■■■■ 4.39
PCNX1-206	ENST00000554292	PTPRT	O14522	1441 aa		42.42	■■■■■ 4.38
PCNX1-206	ENST00000554292	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		42.41	■■■■■ 4.38
PCNX1-206	ENST00000554292	IDI1	Q13907	227 aa		42.39	■■■■■ 4.38
PCNX1-206	ENST00000554292	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		42.39	■■■■■ 4.38
PCNX1-206	ENST00000554292	ADGRB3	O60242	1522 aa		42.36	■■■■■ 4.37
PCNX1-206	ENST00000554292	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.36	■■■■■ 4.37
PCNX1-206	ENST00000554292	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.34	■■■■■ 4.37
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
PCNX1-206	ENST00000554292	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.32	■■■■■ 4.37
PCNX1-206	ENST00000554292	SLIT1	O75093	1534 aa		42.3	■■■■■ 4.36
PCNX1-206	ENST00000554292	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		42.28	■■■■■ 4.36
PCNX1-206	ENST00000554292	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.27	■■■■■ 4.36
PCNX1-206	ENST00000554292	TRPM2	O94759	1503 aa		42.25	■■■■■ 4.35
PCNX1-206	ENST00000554292	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		42.24	■■■■■ 4.35
PCNX1-206	ENST00000554292	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		42.23	■■■■■ 4.35
PCNX1-206	ENST00000554292	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.22	■■■■■ 4.35
PCNX1-206	ENST00000554292	MED14	O60244	1454 aa		42.22	■■■■■ 4.35
PCNX1-206	ENST00000554292	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
PCNX1-206	ENST00000554292	EID1	Q9Y6B2	187 aa		42.2	■■■■■ 4.35
PCNX1-206	ENST00000554292	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.18	■■■■■ 4.34
PCNX1-206	ENST00000554292	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.18	■■■■■ 4.34
PCNX1-206	ENST00000554292	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		42.17	■■■■■ 4.34
PCNX1-206	ENST00000554292	HRC	P23327	699 aa		42.16	■■■■■ 4.34
PCNX1-206	ENST00000554292	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
PCNX1-206	ENST00000554292	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.14	■■■■■ 4.34
PCNX1-206	ENST00000554292	CLTCL1	P53675	1640 aa		42.13	■■■■■ 4.34
PCNX1-206	ENST00000554292	KIF1B	O60333	1816 aa		42.11	■■■■■ 4.33
PCNX1-206	ENST00000554292	LTK	P29376	864 aa		42.07	■■■■■ 4.33
PCNX1-206	ENST00000554292	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	42.07	■■■■■ 4.33
PCNX1-206	ENST00000554292	ZFYVE9	O95405	1425 aa		42.03	■■■■■ 4.32
PCNX1-206	ENST00000554292	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		42.03	■■■■■ 4.32
PCNX1-206	ENST00000554292	FOXD1	Q16676	465 aa		42.01	■■■■■ 4.32

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