RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550649.5

NUBPL-208, Transcript of nucleotide binding protein like, human

TSL 5

Gene NUBPL, Length 557 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUBPL-208	ENST00000550649	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		29.03	■■■□□ 2.24
NUBPL-208	ENST00000550649	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		29.02	■■■□□ 2.24
NUBPL-208	ENST00000550649	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		29.02	■■■□□ 2.24
NUBPL-208	ENST00000550649	CEP152	O94986	1710 aa		29.02	■■■□□ 2.24
NUBPL-208	ENST00000550649	PTPRK	Q15262	1439 aa		29.02	■■■□□ 2.24
NUBPL-208	ENST00000550649	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		29.02	■■■□□ 2.24
NUBPL-208	ENST00000550649	NCOA1	Q15788	1441 aa		29.01	■■■□□ 2.23
NUBPL-208	ENST00000550649	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
NUBPL-208	ENST00000550649	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
NUBPL-208	ENST00000550649	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	29	■■■□□ 2.23
NUBPL-208	ENST00000550649	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.99	■■■□□ 2.23
NUBPL-208	ENST00000550649	DEPDC5	O75140	1603 aa		28.99	■■■□□ 2.23
NUBPL-208	ENST00000550649	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.23
NUBPL-208	ENST00000550649	ITGAE	P38570	1179 aa		28.95	■■■□□ 2.22
NUBPL-208	ENST00000550649	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
NUBPL-208	ENST00000550649	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		28.93	■■■□□ 2.22
NUBPL-208	ENST00000550649	ABCC3	O15438	1527 aa		28.92	■■■□□ 2.22
NUBPL-208	ENST00000550649	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.91	■■■□□ 2.22
NUBPL-208	ENST00000550649	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.91	■■■□□ 2.22
NUBPL-208	ENST00000550649	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.9	■■■□□ 2.22
NUBPL-208	ENST00000550649	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.88	■■■□□ 2.21
NUBPL-208	ENST00000550649	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.87	■■■□□ 2.21
NUBPL-208	ENST00000550649	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
NUBPL-208	ENST00000550649	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.86	■■■□□ 2.21
NUBPL-208	ENST00000550649	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.86	■■■□□ 2.21
NUBPL-208	ENST00000550649	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.84	■■■□□ 2.21
NUBPL-208	ENST00000550649	NPAT	Q14207	1427 aa		28.84	■■■□□ 2.21
NUBPL-208	ENST00000550649	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.82	■■■□□ 2.2
NUBPL-208	ENST00000550649	PZP	P20742	1482 aa		28.82	■■■□□ 2.2
NUBPL-208	ENST00000550649	UNC13B	O14795	1591 aa		28.82	■■■□□ 2.2
NUBPL-208	ENST00000550649	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
NUBPL-208	ENST00000550649	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.8	■■■□□ 2.2
NUBPL-208	ENST00000550649	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.78	■■■□□ 2.2	2e-6	■■□□□ 13.3
NUBPL-208	ENST00000550649	KANK1	Q14678	1352 aa		28.75	■■■□□ 2.19
NUBPL-208	ENST00000550649	HSPA2	P54652	639 aa		28.73	■■■□□ 2.19
NUBPL-208	ENST00000550649	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
NUBPL-208	ENST00000550649	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.71	■■■□□ 2.19
NUBPL-208	ENST00000550649	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.71	■■■□□ 2.19
NUBPL-208	ENST00000550649	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.71	■■■□□ 2.19
NUBPL-208	ENST00000550649	TET3	O43151	1660 aa		28.7	■■■□□ 2.19
NUBPL-208	ENST00000550649	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
NUBPL-208	ENST00000550649	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.69	■■■□□ 2.18
NUBPL-208	ENST00000550649	ERVK-7	P63135	1459 aa		28.68	■■■□□ 2.18
NUBPL-208	ENST00000550649	TNR	Q92752	1358 aa		28.68	■■■□□ 2.18
NUBPL-208	ENST00000550649	NAIP	Q13075	1403 aa		28.66	■■■□□ 2.18
NUBPL-208	ENST00000550649	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.65	■■■□□ 2.18
NUBPL-208	ENST00000550649	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.64	■■■□□ 2.18
NUBPL-208	ENST00000550649	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.63	■■■□□ 2.17
NUBPL-208	ENST00000550649		E9PCH4	1651 aa		28.61	■■■□□ 2.17
NUBPL-208	ENST00000550649	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		28.61	■■■□□ 2.17
NUBPL-208	ENST00000550649	NLRP1	Q9C000	1473 aa		28.58	■■■□□ 2.17
NUBPL-208	ENST00000550649	SYNM	O15061	1565 aa		28.56	■■■□□ 2.16
NUBPL-208	ENST00000550649	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
NUBPL-208	ENST00000550649	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		28.55	■■■□□ 2.16
NUBPL-208	ENST00000550649	NUP155	O75694	1391 aa		28.54	■■■□□ 2.16
NUBPL-208	ENST00000550649	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.53	■■■□□ 2.16
NUBPL-208	ENST00000550649	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		28.53	■■■□□ 2.16
NUBPL-208	ENST00000550649	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
NUBPL-208	ENST00000550649	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.48	■■■□□ 2.15
NUBPL-208	ENST00000550649	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.47	■■■□□ 2.15
NUBPL-208	ENST00000550649	NOS1	P29475	1434 aa		28.47	■■■□□ 2.15
NUBPL-208	ENST00000550649	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.47	■■■□□ 2.15
NUBPL-208	ENST00000550649	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
NUBPL-208	ENST00000550649	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.39	■■■□□ 2.14
NUBPL-208	ENST00000550649	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		28.39	■■■□□ 2.14
NUBPL-208	ENST00000550649	TRIM52	Q96A61	297 aa		28.38	■■■□□ 2.13
NUBPL-208	ENST00000550649	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.37	■■■□□ 2.13
NUBPL-208	ENST00000550649	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.35	■■■□□ 2.13
NUBPL-208	ENST00000550649	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
NUBPL-208	ENST00000550649	PTPRT	O14522	1441 aa		28.33	■■■□□ 2.13
NUBPL-208	ENST00000550649	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.32	■■■□□ 2.12
NUBPL-208	ENST00000550649	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.32	■■■□□ 2.12
NUBPL-208	ENST00000550649	IDI1	Q13907	227 aa		28.31	■■■□□ 2.12
NUBPL-208	ENST00000550649	SLIT1	O75093	1534 aa		28.3	■■■□□ 2.12
NUBPL-208	ENST00000550649	PKD2	Q13563	968 aa		28.3	■■■□□ 2.12
NUBPL-208	ENST00000550649	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.3	■■■□□ 2.12
NUBPL-208	ENST00000550649	CLTCL1	P53675	1640 aa		28.29	■■■□□ 2.12
NUBPL-208	ENST00000550649	TRPM2	O94759	1503 aa		28.28	■■■□□ 2.12
NUBPL-208	ENST00000550649	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.28	■■■□□ 2.12
NUBPL-208	ENST00000550649	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		28.28	■■■□□ 2.12
NUBPL-208	ENST00000550649	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.28	■■■□□ 2.12
NUBPL-208	ENST00000550649	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.27	■■■□□ 2.12
NUBPL-208	ENST00000550649	KIF1B	O60333	1816 aa		28.26	■■■□□ 2.11
NUBPL-208	ENST00000550649	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
NUBPL-208	ENST00000550649	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
NUBPL-208	ENST00000550649	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		28.23	■■■□□ 2.11
NUBPL-208	ENST00000550649	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.22	■■■□□ 2.11
NUBPL-208	ENST00000550649	MED14	O60244	1454 aa		28.21	■■■□□ 2.11
NUBPL-208	ENST00000550649	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
NUBPL-208	ENST00000550649	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
NUBPL-208	ENST00000550649	LTK	P29376	864 aa		28.14	■■■□□ 2.1
NUBPL-208	ENST00000550649	FOXD1	Q16676	465 aa		28.14	■■■□□ 2.1
NUBPL-208	ENST00000550649	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.14	■■■□□ 2.09
NUBPL-208	ENST00000550649	ZFYVE9	O95405	1425 aa		28.13	■■■□□ 2.09
NUBPL-208	ENST00000550649	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		28.13	■■■□□ 2.09
NUBPL-208	ENST00000550649	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		28.13	■■■□□ 2.09
NUBPL-208	ENST00000550649	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.12	■■■□□ 2.09
NUBPL-208	ENST00000550649	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
NUBPL-208	ENST00000550649	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		28.11	■■■□□ 2.09
NUBPL-208	ENST00000550649	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09

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