RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-218ENST00000550159 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CS-218ENST00000550159 TSPY4P0CV99 314 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-218ENST00000550159 TSPY10P0CW01 314 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-218ENST00000550159 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-218ENST00000550159 PREX2Q70Z35 1606 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-218ENST00000550159 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CS-218ENST00000550159 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.52□□□□□ -0.08
CS-218ENST00000550159 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CS-218ENST00000550159 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.52□□□□□ -0.08
CS-218ENST00000550159 ABCC1P33527 1531 aa14.51□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.48□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.47□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.47□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 TNRQ92752 1358 aa14.47□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-218ENST00000550159 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.46□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 A2MP01023 1474 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 ITGAEP38570 1179 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.43□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 MED14O60244 1454 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 ATP7AQ04656 1500 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
CS-218ENST00000550159 PLXNC1O60486 1568 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 DAPK1P53355 1430 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 DEPDC5O75140 1603 aa14.35□□□□□ -0.11
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CS-218ENST00000550159 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 PZPP20742 1482 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 NLRP1Q9C000 1473 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 KIF3BO15066 747 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 SYNMO15061 1565 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 IQGAP1P46940 1657 aa14.33□□□□□ -0.11
CS-218ENST00000550159 MBD5Q9P267 1494 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-218ENST00000550159 ABCC5O15440 1437 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-218ENST00000550159 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
CS-218ENST00000550159 ROCK1Q13464 1354 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-218ENST00000550159 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-218ENST00000550159 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
CS-218ENST00000550159 KIF15Q9NS87 1388 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-218ENST00000550159 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
CS-218ENST00000550159 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-218ENST00000550159 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.27□□□□□ -0.12
CS-218ENST00000550159 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.27□□□□□ -0.12
CS-218ENST00000550159 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 KANK1Q14678 1352 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 JCADQ9P266 1359 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 ADGRL2O95490 1459 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 TMEM94Q12767 1356 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 RXRBP28702 533 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 LTKP29376 864 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 ERBINQ96RT1 1412 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 EID1Q9Y6B2 187 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-218ENST00000550159 HFM1A2PYH4 1435 aa14.21□□□□□ -0.13
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CS-218ENST00000550159 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-218ENST00000550159 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
CS-218ENST00000550159 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CS-218ENST00000550159 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-218ENST00000550159 KCNA6P17658 529 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-218ENST00000550159 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.18□□□□□ -0.146e-9■□□□□ 10
CS-218ENST00000550159 HRCP23327 699 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-218ENST00000550159 LRP6O75581 1613 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-218ENST00000550159 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
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