RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549940.5

GNPTAB-206, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 1,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-206ENST00000549940 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
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GNPTAB-206ENST00000549940 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.32■■■■■ 4.05
GNPTAB-206ENST00000549940 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
GNPTAB-206ENST00000549940 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.31■■■■■ 4.04
GNPTAB-206ENST00000549940 PKD2Q13563 968 aa40.31■■■■■ 4.04
GNPTAB-206ENST00000549940 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.3■■■■■ 4.04
GNPTAB-206ENST00000549940 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.29■■■■■ 4.04
GNPTAB-206ENST00000549940 NEUROD1Q13562 356 aa40.28■■■■■ 4.04
GNPTAB-206ENST00000549940 FOXD1Q16676 465 aa40.28■■■■■ 4.04
GNPTAB-206ENST00000549940 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.25■■■■■ 4.03
GNPTAB-206ENST00000549940 KANK1Q14678 1352 aa40.25■■■■■ 4.03
GNPTAB-206ENST00000549940 DEPDC5O75140 1603 aa40.24■■■■■ 4.03
GNPTAB-206ENST00000549940 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.2■■■■■ 4.03
GNPTAB-206ENST00000549940 ATP10AO60312 1499 aa40.2■■■■■ 4.03
GNPTAB-206ENST00000549940 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.15■■■■■ 4.02
GNPTAB-206ENST00000549940 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
GNPTAB-206ENST00000549940 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.14■■■■■ 4.02
GNPTAB-206ENST00000549940 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.02
GNPTAB-206ENST00000549940 GGT6Q6P531 493 aa40.11■■■■■ 4.01
GNPTAB-206ENST00000549940 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.09■■■■■ 4.01
GNPTAB-206ENST00000549940 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.08■■■■■ 4.01
GNPTAB-206ENST00000549940 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.08■■■■■ 4.01
GNPTAB-206ENST00000549940 REREQ9P2R6 1566 aa40.08■■■■■ 4.01
GNPTAB-206ENST00000549940 TONSLQ96HA7 1378 aa40.06■■■■■ 4
GNPTAB-206ENST00000549940 TET3O43151 1660 aa40.01■■■■■ 4
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GNPTAB-206ENST00000549940 AGLP35573 1532 aa39.98■■■■□ 3.99
GNPTAB-206ENST00000549940 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa39.97■■■■□ 3.99
GNPTAB-206ENST00000549940 LMTK2Q8IWU2 1503 aa39.95■■■■□ 3.99
GNPTAB-206ENST00000549940 E9PCH4 1651 aa39.92■■■■□ 3.98
GNPTAB-206ENST00000549940 CEP152O94986 1710 aa39.9■■■■□ 3.98
GNPTAB-206ENST00000549940 EFCAB6Q5THR3 1501 aa39.88■■■■□ 3.97
GNPTAB-206ENST00000549940 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.88■■■■□ 3.97
GNPTAB-206ENST00000549940 ABCC3O15438 1527 aa39.87■■■■□ 3.97
GNPTAB-206ENST00000549940 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.85■■■■□ 3.97
GNPTAB-206ENST00000549940 PLA2R1Q13018 1463 aa39.84■■■■□ 3.97
GNPTAB-206ENST00000549940 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
GNPTAB-206ENST00000549940 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.96
GNPTAB-206ENST00000549940 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
GNPTAB-206ENST00000549940 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.78■■■■□ 3.96
GNPTAB-206ENST00000549940 PTPRTO14522 1441 aa39.78■■■■□ 3.96
GNPTAB-206ENST00000549940 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.78■■■■□ 3.96
GNPTAB-206ENST00000549940 MLECQ14165 292 aa39.76■■■■□ 3.96
GNPTAB-206ENST00000549940 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa39.76■■■■□ 3.96
GNPTAB-206ENST00000549940 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.75■■■■□ 3.95
GNPTAB-206ENST00000549940 TRPM2O94759 1503 aa39.74■■■■□ 3.95
GNPTAB-206ENST00000549940 NPATQ14207 1427 aa39.73■■■■□ 3.95
GNPTAB-206ENST00000549940 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa39.69■■■■□ 3.94
GNPTAB-206ENST00000549940 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
GNPTAB-206ENST00000549940 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.6■■■■□ 3.93
GNPTAB-206ENST00000549940 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
GNPTAB-206ENST00000549940 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
GNPTAB-206ENST00000549940 CLTCL1P53675 1640 aa39.57■■■■□ 3.93
GNPTAB-206ENST00000549940 RGL3Q3MIN7 710 aa39.57■■■■□ 3.92
GNPTAB-206ENST00000549940 NOS1P29475 1434 aa39.54■■■■□ 3.92
GNPTAB-206ENST00000549940 DCAF11Q8TEB1 546 aa39.51■■■■□ 3.92
GNPTAB-206ENST00000549940 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.49■■■■□ 3.91
GNPTAB-206ENST00000549940 UGGT1Q9NYU2 1555 aa39.48■■■■□ 3.91
GNPTAB-206ENST00000549940 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa39.46■■■■□ 3.91
GNPTAB-206ENST00000549940 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.45■■■■□ 3.91
GNPTAB-206ENST00000549940 KIF1BO60333 1816 aa39.44■■■■□ 3.9
GNPTAB-206ENST00000549940 ZMYM3Q14202 1370 aa39.44■■■■□ 3.9
GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
GNPTAB-206ENST00000549940 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.42■■■■□ 3.9
GNPTAB-206ENST00000549940 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.42■■■■□ 3.9
GNPTAB-206ENST00000549940 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.41■■■■□ 3.9
GNPTAB-206ENST00000549940 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
GNPTAB-206ENST00000549940 SYNMO15061 1565 aa39.41■■■■□ 3.9
GNPTAB-206ENST00000549940 ERVK-7P63135 1459 aa39.41■■■■□ 3.9
GNPTAB-206ENST00000549940 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.9
GNPTAB-206ENST00000549940 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.38■■■■□ 3.89
GNPTAB-206ENST00000549940 STAC3Q96MF2 364 aa39.35■■■■□ 3.89
GNPTAB-206ENST00000549940 PIK3C2BO00750 1634 aa39.35■■■■□ 3.89
GNPTAB-206ENST00000549940 MROH2AA6NES4 1674 aa39.34■■■■□ 3.89
GNPTAB-206ENST00000549940 IDI1Q13907 227 aa39.32■■■■□ 3.89
GNPTAB-206ENST00000549940 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.31■■■■□ 3.88
GNPTAB-206ENST00000549940 ADGRB3O60242 1522 aa39.3■■■■□ 3.88
GNPTAB-206ENST00000549940 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.29■■■■□ 3.88
GNPTAB-206ENST00000549940 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.26■■■■□ 3.88
GNPTAB-206ENST00000549940 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.21■■■■□ 3.87
GNPTAB-206ENST00000549940 RALGAPBQ86X10 1494 aa39.2■■■■□ 3.87
GNPTAB-206ENST00000549940 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.19■■■■□ 3.86
GNPTAB-206ENST00000549940 TNRQ92752 1358 aa39.18■■■■□ 3.86
GNPTAB-206ENST00000549940 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP39.16■■■■□ 3.86
GNPTAB-206ENST00000549940 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
GNPTAB-206ENST00000549940 MYOM2P54296 1465 aa39.14■■■■□ 3.86
GNPTAB-206ENST00000549940 C3P01024 1663 aa39.13■■■■□ 3.85
GNPTAB-206ENST00000549940 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.12■■■■□ 3.85
GNPTAB-206ENST00000549940 MADDQ8WXG6 1647 aa39.11■■■■□ 3.85
GNPTAB-206ENST00000549940 IFT172Q9UG01 1749 aa39.11■■■■□ 3.85
GNPTAB-206ENST00000549940 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
GNPTAB-206ENST00000549940 CARD11Q9BXL7 1154 aa39.1■■■■□ 3.85
GNPTAB-206ENST00000549940 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa39.1■■■■□ 3.85
GNPTAB-206ENST00000549940 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.08■■■■□ 3.85
GNPTAB-206ENST00000549940 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.07■■■■□ 3.85
GNPTAB-206ENST00000549940 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
GNPTAB-206ENST00000549940 PPLO60437 1756 aa39.06■■■■□ 3.84
GNPTAB-206ENST00000549940 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
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