RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 C3P01024 1663 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 PTPRKQ15262 1439 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 ROCK1Q13464 1354 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 KIF15Q9NS87 1388 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 KDM5DQ9BY66 1539 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 NPATQ14207 1427 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 ABCC3O15438 1527 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 MLECQ14165 292 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 UNC13BO14795 1591 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 KIF3BO15066 747 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 PZPP20742 1482 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 CEP152O94986 1710 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 ZMYM3Q14202 1370 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 GGT6Q6P531 493 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 MYO3AQ8NEV4 1616 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 HFM1A2PYH4 1435 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 IQGAP3Q86VI3 1631 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 NAIPQ13075 1403 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-213ENST00000548746 TET3O43151 1660 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 ERVK-7P63135 1459 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 NLRP1Q9C000 1473 aa9□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 KANK1Q14678 1352 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 TNRQ92752 1358 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 PLA2R1Q13018 1463 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 STRCQ7RTU9 1775 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 E9PCH4 1651 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 NOS1P29475 1434 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 SYNMO15061 1565 aa8.96□□□□□ -0.97
CS-213ENST00000548746 PIK3C2BO00750 1634 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 ITGAEP38570 1179 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 UBR1Q8IWV7 1749 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 NUP155O75694 1391 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 SLIT1O75093 1534 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 PTPRTO14522 1441 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 HSPA2P54652 639 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 ADGRB3O60242 1522 aa8.91□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 TRPM2O94759 1503 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 MED14O60244 1454 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-213ENST00000548746 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.9□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 HRCP23327 699 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 PKD2Q13563 968 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 IDI1Q13907 227 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 IQGAP1P46940 1657 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 CLTCL1P53675 1640 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 TMEM2Q9UHN6 1383 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 ZFYVE9O95405 1425 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 KIF1BO60333 1816 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-213ENST00000548746 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.83□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.83□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.83□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 TRIM52Q96A61 297 aa8.82□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 MPHOSPH9Q99550 1183 aa8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms