RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.96■■□□□ 1.91
BRF1-209ENST00000547052 MROH2AA6NES4 1674 aa26.95■■□□□ 1.91
BRF1-209ENST00000547052 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
BRF1-209ENST00000547052 PTPRKQ15262 1439 aa26.95■■□□□ 1.9
BRF1-209ENST00000547052 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.94■■□□□ 1.9
BRF1-209ENST00000547052 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
BRF1-209ENST00000547052 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
BRF1-209ENST00000547052 KANK1Q14678 1352 aa26.92■■□□□ 1.9
BRF1-209ENST00000547052 DEPDC5O75140 1603 aa26.9■■□□□ 1.9
BRF1-209ENST00000547052 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.9■■□□□ 1.9
BRF1-209ENST00000547052 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.9■■□□□ 1.9
BRF1-209ENST00000547052 CEP152O94986 1710 aa26.87■■□□□ 1.89
BRF1-209ENST00000547052 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
BRF1-209ENST00000547052 PTPRMP28827 1452 aa26.85■■□□□ 1.89
BRF1-209ENST00000547052 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.85■■□□□ 1.89
BRF1-209ENST00000547052 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
BRF1-209ENST00000547052 C3P01024 1663 aa26.84■■□□□ 1.89
BRF1-209ENST00000547052 HFM1A2PYH4 1435 aa26.83■■□□□ 1.89
BRF1-209ENST00000547052 UNC13BO14795 1591 aa26.82■■□□□ 1.88
BRF1-209ENST00000547052 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
BRF1-209ENST00000547052 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
BRF1-209ENST00000547052 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.79■■□□□ 1.88
BRF1-209ENST00000547052 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
BRF1-209ENST00000547052 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.79■■□□□ 1.88
BRF1-209ENST00000547052 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.78■■□□□ 1.88
BRF1-209ENST00000547052 NAIPQ13075 1403 aa26.78■■□□□ 1.88
BRF1-209ENST00000547052 ABCC3O15438 1527 aa26.77■■□□□ 1.88
BRF1-209ENST00000547052 TET3O43151 1660 aa26.73■■□□□ 1.87
BRF1-209ENST00000547052 ZMYM3Q14202 1370 aa26.72■■□□□ 1.87
BRF1-209ENST00000547052 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.72■■□□□ 1.87
BRF1-209ENST00000547052 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.71■■□□□ 1.87
BRF1-209ENST00000547052 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.7■■□□□ 1.86
BRF1-209ENST00000547052 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.68■■□□□ 1.86
BRF1-209ENST00000547052 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
BRF1-209ENST00000547052 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.68■■□□□ 1.86
BRF1-209ENST00000547052 NUP155O75694 1391 aa26.68■■□□□ 1.86
BRF1-209ENST00000547052 PZPP20742 1482 aa26.68■■□□□ 1.86
BRF1-209ENST00000547052 NPATQ14207 1427 aa26.66■■□□□ 1.86
BRF1-209ENST00000547052 TRIM52Q96A61 297 aa26.66■■□□□ 1.86
BRF1-209ENST00000547052 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.65■■□□□ 1.86
BRF1-209ENST00000547052 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
BRF1-209ENST00000547052 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.61■■□□□ 1.85
BRF1-209ENST00000547052 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
BRF1-209ENST00000547052 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.58■■□□□ 1.85
BRF1-209ENST00000547052 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.57■■□□□ 1.84
BRF1-209ENST00000547052 E9PCH4 1651 aa26.57■■□□□ 1.84
BRF1-209ENST00000547052 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.56■■□□□ 1.84
BRF1-209ENST00000547052 TNRQ92752 1358 aa26.55■■□□□ 1.84
BRF1-209ENST00000547052 ERVK-7P63135 1459 aa26.55■■□□□ 1.84
BRF1-209ENST00000547052 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.54■■□□□ 1.84
BRF1-209ENST00000547052 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
BRF1-209ENST00000547052 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.53■■□□□ 1.84
BRF1-209ENST00000547052 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
BRF1-209ENST00000547052 NLRP1Q9C000 1473 aa26.49■■□□□ 1.83
BRF1-209ENST00000547052 HRCP23327 699 aa26.49■■□□□ 1.83
BRF1-209ENST00000547052 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
BRF1-209ENST00000547052 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
BRF1-209ENST00000547052 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.43■■□□□ 1.82
BRF1-209ENST00000547052 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.42■■□□□ 1.82
BRF1-209ENST00000547052 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
BRF1-209ENST00000547052 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.41■■□□□ 1.82
BRF1-209ENST00000547052 KIF1BO60333 1816 aa26.41■■□□□ 1.82
BRF1-209ENST00000547052 PKD2Q13563 968 aa26.4■■□□□ 1.82
BRF1-209ENST00000547052 SYNMO15061 1565 aa26.4■■□□□ 1.82
BRF1-209ENST00000547052 NOS1P29475 1434 aa26.39■■□□□ 1.82
BRF1-209ENST00000547052 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.39■■□□□ 1.82
BRF1-209ENST00000547052 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.39■■□□□ 1.82
BRF1-209ENST00000547052 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.38■■□□□ 1.81
BRF1-209ENST00000547052 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.37■■□□□ 1.81
BRF1-209ENST00000547052 PIK3C2BO00750 1634 aa26.37■■□□□ 1.81
BRF1-209ENST00000547052 TRPM2O94759 1503 aa26.34■■□□□ 1.81
BRF1-209ENST00000547052 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.34■■□□□ 1.81
BRF1-209ENST00000547052 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
BRF1-209ENST00000547052 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
BRF1-209ENST00000547052 ADGRB3O60242 1522 aa26.31■■□□□ 1.8
BRF1-209ENST00000547052 PTPRTO14522 1441 aa26.29■■□□□ 1.8
BRF1-209ENST00000547052 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.28■■□□□ 1.8
BRF1-209ENST00000547052 PLA2R1Q13018 1463 aa26.27■■□□□ 1.8
BRF1-209ENST00000547052 CLTCL1P53675 1640 aa26.26■■□□□ 1.79
BRF1-209ENST00000547052 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
BRF1-209ENST00000547052 HSPA2P54652 639 aa26.26■■□□□ 1.79
BRF1-209ENST00000547052 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.25■■□□□ 1.79
BRF1-209ENST00000547052 IDI1Q13907 227 aa26.25■■□□□ 1.79
BRF1-209ENST00000547052 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.23■■□□□ 1.79
BRF1-209ENST00000547052 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
BRF1-209ENST00000547052 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.21■■□□□ 1.79
BRF1-209ENST00000547052 EID1Q9Y6B2 187 aa26.21■■□□□ 1.79
BRF1-209ENST00000547052 STRCQ7RTU9 1775 aa26.2■■□□□ 1.79
BRF1-209ENST00000547052 FOXD1Q16676 465 aa26.2■■□□□ 1.78
BRF1-209ENST00000547052 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.19■■□□□ 1.78
BRF1-209ENST00000547052 SLIT1O75093 1534 aa26.17■■□□□ 1.78
BRF1-209ENST00000547052 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
BRF1-209ENST00000547052 IQGAP1P46940 1657 aa26.13■■□□□ 1.77
BRF1-209ENST00000547052 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
BRF1-209ENST00000547052 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.13■■□□□ 1.77
BRF1-209ENST00000547052 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
BRF1-209ENST00000547052 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
BRF1-209ENST00000547052 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.11■■□□□ 1.77
BRF1-209ENST00000547052 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.09■■□□□ 1.77
BRF1-209ENST00000547052 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.09■■□□□ 1.77
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