RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546930.5

CS-206, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-206ENST00000546930 IQGAP3Q86VI3 1631 aa12.73□□□□□ -0.37
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CS-206ENST00000546930 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-206ENST00000546930 ABCC3O15438 1527 aa12.71□□□□□ -0.38
CS-206ENST00000546930 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-206ENST00000546930 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-206ENST00000546930 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-206ENST00000546930 KDM5DQ9BY66 1539 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-206ENST00000546930 E9PCH4 1651 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-206ENST00000546930 TET3O43151 1660 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-206ENST00000546930 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa12.69□□□□□ -0.38
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CS-206ENST00000546930 TSPY10P0CW01 314 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-206ENST00000546930 PREX1Q8TCU6 1659 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-206ENST00000546930 EFCAB6Q5THR3 1501 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-206ENST00000546930 PZPP20742 1482 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-206ENST00000546930 LMTK2Q8IWU2 1503 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-206ENST00000546930 FAM135AQ9P2D6 1515 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-206ENST00000546930 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-206ENST00000546930 MYT1LQ9UL68 1186 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-206ENST00000546930 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa12.63□□□□□ -0.39
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CS-206ENST00000546930 SYNMO15061 1565 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-206ENST00000546930 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-206ENST00000546930 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-206ENST00000546930 KIF3BO15066 747 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-206ENST00000546930 MYO3AQ8NEV4 1616 aa12.6□□□□□ -0.39
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CS-206ENST00000546930 PTPRMP28827 1452 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-206ENST00000546930 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-206ENST00000546930 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-206ENST00000546930 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-206ENST00000546930 PIK3C2BO00750 1634 aa12.59□□□□□ -0.39
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CS-206ENST00000546930 NPATQ14207 1427 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-206ENST00000546930 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-206ENST00000546930 CLTCL1P53675 1640 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-206ENST00000546930 ERVK-7P63135 1459 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-206ENST00000546930 GGT6Q6P531 493 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-206ENST00000546930 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-206ENST00000546930 CNTLNQ9NXG0 1405 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-206ENST00000546930 PLA2R1Q13018 1463 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-206ENST00000546930 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-206ENST00000546930 TRPM2O94759 1503 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.51□□□□□ -0.416e-9■□□□□ 10
CS-206ENST00000546930 NUP155O75694 1391 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 NOS1P29475 1434 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 ZMYM3Q14202 1370 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 IFT172Q9UG01 1749 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 PCGF6Q9BYE7 350 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 KIF1BO60333 1816 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
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CS-206ENST00000546930 STRCQ7RTU9 1775 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 KANK1Q14678 1352 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-206ENST00000546930 ADGRB3O60242 1522 aa12.46□□□□□ -0.42
CS-206ENST00000546930 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CS-206ENST00000546930 FOXD1Q16676 465 aa12.45□□□□□ -0.42
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CS-206ENST00000546930 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.44□□□□□ -0.42
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CS-206ENST00000546930 HRCP23327 699 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-206ENST00000546930 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.42□□□□□ -0.42
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CS-206ENST00000546930 NEURL4Q96JN8 1562 aa12.42□□□□□ -0.42
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CS-206ENST00000546930 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa12.4□□□□□ -0.42
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CS-206ENST00000546930 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-206ENST00000546930 NLRP1Q9C000 1473 aa12.39□□□□□ -0.43
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CS-206ENST00000546930 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-206ENST00000546930 ARHGAP23Q9P227 1491 aa12.36□□□□□ -0.43
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CS-206ENST00000546930 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-206ENST00000546930 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
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CS-206ENST00000546930 IDI1Q13907 227 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-206ENST00000546930 CCDC144AA2RUR9 1427 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-206ENST00000546930 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-206ENST00000546930 HSPA2P54652 639 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-206ENST00000546930 SIN3AQ96ST3 1273 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 RIMS2Q9UQ26 1411 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-206ENST00000546930 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.26□□□□□ -0.45
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