RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 KIF15Q9NS87 1388 aa33.71■■■□□ 2.99
PUS1-211ENST00000544662 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.7■■■□□ 2.99
PUS1-211ENST00000544662 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.7■■■□□ 2.99
PUS1-211ENST00000544662 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
PUS1-211ENST00000544662 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.68■■■□□ 2.98
PUS1-211ENST00000544662 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.68■■■□□ 2.98
PUS1-211ENST00000544662 NPATQ14207 1427 aa33.67■■■□□ 2.98
PUS1-211ENST00000544662 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.67■■■□□ 2.98
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.66■■■□□ 2.98
PUS1-211ENST00000544662 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa33.63■■■□□ 2.97
PUS1-211ENST00000544662 PTPRKQ15262 1439 aa33.62■■■□□ 2.97
PUS1-211ENST00000544662 ERBINQ96RT1 1412 aa33.62■■■□□ 2.97
PUS1-211ENST00000544662 NCOA1Q15788 1441 aa33.62■■■□□ 2.97
PUS1-211ENST00000544662 ADGRL2O95490 1459 aa33.61■■■□□ 2.97
PUS1-211ENST00000544662 MROH1Q8NDA8 1641 aa33.61■■■□□ 2.97
PUS1-211ENST00000544662 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
PUS1-211ENST00000544662 ABCC3O15438 1527 aa33.54■■■□□ 2.96
PUS1-211ENST00000544662 PZPP20742 1482 aa33.52■■■□□ 2.96
PUS1-211ENST00000544662 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.51■■■□□ 2.96
PUS1-211ENST00000544662 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.51■■■□□ 2.96
PUS1-211ENST00000544662 CEP152O94986 1710 aa33.5■■■□□ 2.95
PUS1-211ENST00000544662 DEPDC5O75140 1603 aa33.5■■■□□ 2.95
PUS1-211ENST00000544662 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
PUS1-211ENST00000544662 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
PUS1-211ENST00000544662 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
PUS1-211ENST00000544662 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.44■■■□□ 2.94
PUS1-211ENST00000544662 ITGAEP38570 1179 aa33.44■■■□□ 2.94
PUS1-211ENST00000544662 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP33.44■■■□□ 2.941e-6■■□□□ 12
PUS1-211ENST00000544662 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
PUS1-211ENST00000544662 STRCQ7RTU9 1775 aa33.43■■■□□ 2.94
PUS1-211ENST00000544662 TNRQ92752 1358 aa33.43■■■□□ 2.94
PUS1-211ENST00000544662 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.42■■■□□ 2.94
PUS1-211ENST00000544662 ROCK1Q13464 1354 aa33.41■■■□□ 2.94
PUS1-211ENST00000544662 KANK1Q14678 1352 aa33.39■■■□□ 2.94
PUS1-211ENST00000544662 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.37■■■□□ 2.93
PUS1-211ENST00000544662 VWDEQ8N2E2 1590 aa33.35■■■□□ 2.93
PUS1-211ENST00000544662 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.34■■■□□ 2.93
PUS1-211ENST00000544662 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
PUS1-211ENST00000544662 ERVK-7P63135 1459 aa33.32■■■□□ 2.92
PUS1-211ENST00000544662 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa33.32■■■□□ 2.92
PUS1-211ENST00000544662 LMTK2Q8IWU2 1503 aa33.31■■■□□ 2.92
PUS1-211ENST00000544662 DMRT2Q9Y5R5 561 aa33.29■■■□□ 2.92
PUS1-211ENST00000544662 NLRP1Q9C000 1473 aa33.29■■■□□ 2.92
PUS1-211ENST00000544662 PLA2R1Q13018 1463 aa33.25■■■□□ 2.91
PUS1-211ENST00000544662 UNC13BO14795 1591 aa33.25■■■□□ 2.91
PUS1-211ENST00000544662 PTPRTO14522 1441 aa33.22■■■□□ 2.91
PUS1-211ENST00000544662 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.22■■■□□ 2.91
PUS1-211ENST00000544662 EFCAB6Q5THR3 1501 aa33.21■■■□□ 2.91
PUS1-211ENST00000544662 UGGT1Q9NYU2 1555 aa33.2■■■□□ 2.91
PUS1-211ENST00000544662 PKD2Q13563 968 aa33.16■■■□□ 2.9
PUS1-211ENST00000544662 TET3O43151 1660 aa33.16■■■□□ 2.9
PUS1-211ENST00000544662 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
PUS1-211ENST00000544662 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.12■■■□□ 2.89
PUS1-211ENST00000544662 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33.11■■■□□ 2.89
PUS1-211ENST00000544662 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
PUS1-211ENST00000544662 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.1■■■□□ 2.89
PUS1-211ENST00000544662 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
PUS1-211ENST00000544662 NOS1P29475 1434 aa33.09■■■□□ 2.89
PUS1-211ENST00000544662 NAIPQ13075 1403 aa33.09■■■□□ 2.89
PUS1-211ENST00000544662 SYNMO15061 1565 aa33.09■■■□□ 2.89
PUS1-211ENST00000544662 NUP155O75694 1391 aa33.08■■■□□ 2.89
PUS1-211ENST00000544662 PIK3C2BO00750 1634 aa33.06■■■□□ 2.88
PUS1-211ENST00000544662 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.04■■■□□ 2.88
PUS1-211ENST00000544662 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.04■■■□□ 2.88
PUS1-211ENST00000544662 E9PCH4 1651 aa33.03■■■□□ 2.88
PUS1-211ENST00000544662 HFM1A2PYH4 1435 aa33.02■■■□□ 2.88
PUS1-211ENST00000544662 IDI1Q13907 227 aa33■■■□□ 2.87
PUS1-211ENST00000544662 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
PUS1-211ENST00000544662 CERKQ8TCT0 537 aa32.99■■■□□ 2.87
PUS1-211ENST00000544662 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
PUS1-211ENST00000544662 SLC52A1Q9NWF4 448 aa32.95■■■□□ 2.87
PUS1-211ENST00000544662 STAG3Q9UJ98 1225 aa32.95■■■□□ 2.87
PUS1-211ENST00000544662 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.95■■■□□ 2.86
PUS1-211ENST00000544662 MED14O60244 1454 aa32.94■■■□□ 2.86
PUS1-211ENST00000544662 ARHGAP23Q9P227 1491 aa32.93■■■□□ 2.86
PUS1-211ENST00000544662 SLIT1O75093 1534 aa32.93■■■□□ 2.86
PUS1-211ENST00000544662 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
PUS1-211ENST00000544662 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
PUS1-211ENST00000544662 ADGRB3O60242 1522 aa32.91■■■□□ 2.86
PUS1-211ENST00000544662 FBXO41Q8TF61 875 aa32.9■■■□□ 2.86
PUS1-211ENST00000544662 IQGAP1P46940 1657 aa32.89■■■□□ 2.86
PUS1-211ENST00000544662 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
PUS1-211ENST00000544662 TMEM2Q9UHN6 1383 aa32.87■■■□□ 2.85
PUS1-211ENST00000544662 LTKP29376 864 aa32.86■■■□□ 2.85
PUS1-211ENST00000544662 TXNDC2Q86VQ3 553 aa32.86■■■□□ 2.85
PUS1-211ENST00000544662 TRIM52Q96A61 297 aa32.84■■■□□ 2.85
PUS1-211ENST00000544662 EID1Q9Y6B2 187 aa32.83■■■□□ 2.85
PUS1-211ENST00000544662 MYO5BQ9ULV0 1848 aa32.82■■■□□ 2.84
PUS1-211ENST00000544662 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa32.8■■■□□ 2.84
PUS1-211ENST00000544662 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa32.8■■■□□ 2.84
PUS1-211ENST00000544662 CHGAP10645 457 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
PUS1-211ENST00000544662 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.73■■■□□ 2.83
PUS1-211ENST00000544662 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
PUS1-211ENST00000544662 ZFYVE9O95405 1425 aa32.7■■■□□ 2.83
PUS1-211ENST00000544662 CPS1P31327 1500 aa32.69■■■□□ 2.82
PUS1-211ENST00000544662 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.68■■■□□ 2.82
PUS1-211ENST00000544662 RIMS2Q9UQ26 1411 aa32.68■■■□□ 2.82
PUS1-211ENST00000544662 TRPM2O94759 1503 aa32.67■■■□□ 2.82
PUS1-211ENST00000544662 STRCP1A6NGW2 1772 aa32.65■■■□□ 2.82
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