RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543656.1

RUSC1-AS1-204, RUSC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RUSC1-AS1, Length 1,357 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.3■■□□□ 1.8
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.3■■□□□ 1.8
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.29■■□□□ 1.8
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CPS1P31327 1500 aa26.28■■□□□ 1.8
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.26■■□□□ 1.79
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TOM1O60784 492 aa26.25■■□□□ 1.79
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.25■■□□□ 1.79
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NCOA2Q15596 1464 aa26.22■■□□□ 1.79
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ALKQ9UM73 1620 aa26.21■■□□□ 1.79
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.2■■□□□ 1.78
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.19■■□□□ 1.78
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TNRQ92752 1358 aa26.17■■□□□ 1.78
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PZPP20742 1482 aa26.13■■□□□ 1.77
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MBD5Q9P267 1494 aa26.12■■□□□ 1.77
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.11■■□□□ 1.77
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.1■■□□□ 1.77
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MIA2Q96PC5 1412 aa26.08■■□□□ 1.77
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.08■■□□□ 1.77
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.08■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.08■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DEPDC5O75140 1603 aa26.07■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MED14O60244 1454 aa26.07■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KIF3BO15066 747 aa26.07■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.06■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IQGAP1P46940 1657 aa26.06■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.04■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NLRP1Q9C000 1473 aa26.03■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.01■■□□□ 1.75
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.01■■□□□ 1.75
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.01■■□□□ 1.75
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SYNMO15061 1565 aa25.99■■□□□ 1.75
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.96■■□□□ 1.75
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.91■■□□□ 1.74
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.91■■□□□ 1.74
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.91■■□□□ 1.74
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ABCC3O15438 1527 aa25.86■■□□□ 1.73
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.84■■□□□ 1.73
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ERVK-7P63135 1459 aa25.83■■□□□ 1.73
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.81■■□□□ 1.72
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CEP152O94986 1710 aa25.78■■□□□ 1.72
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.77■■□□□ 1.72
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 POTEAQ6S8J7 498 aa25.75■■□□□ 1.71
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LTKP29376 864 aa25.74■■□□□ 1.71
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ABCC5O15440 1437 aa25.74■■□□□ 1.71
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TSPY4P0CV99 314 aa25.73■■□□□ 1.71
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TSPY10P0CW01 314 aa25.73■■□□□ 1.71
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.73■■□□□ 1.71
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SLIT1O75093 1534 aa25.72■■□□□ 1.71
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DAPK1P53355 1430 aa25.72■■□□□ 1.71
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.7■■□□□ 1.71
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.69■■□□□ 1.7
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.69■■□□□ 1.7
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.66■■□□□ 1.7
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TMEM94Q12767 1356 aa25.63■■□□□ 1.69
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ITGAEP38570 1179 aa25.63■■□□□ 1.69
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PIK3C2BO00750 1634 aa25.62■■□□□ 1.69
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ROCK1Q13464 1354 aa25.61■■□□□ 1.69
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.6■■□□□ 1.69
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 EID1Q9Y6B2 187 aa25.59■■□□□ 1.69
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ADGRL2O95490 1459 aa25.59■■□□□ 1.69
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.58■■□□□ 1.69
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.57■■□□□ 1.68
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.57■■□□□ 1.68
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.57■■□□□ 1.68
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.56■■□□□ 1.68
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.54■■□□□ 1.68
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KCNA6P17658 529 aa25.52■■□□□ 1.68
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.51■■□□□ 1.67
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PHLPP1O60346 1717 aa25.51■■□□□ 1.67
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TET3O43151 1660 aa25.51■■□□□ 1.67
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.5■■□□□ 1.67
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.49■■□□□ 1.67
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.49■■□□□ 1.67
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NWD1Q149M9 1564 aa25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms