RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3-211ENST00000542667 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3-211ENST00000542667 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3-211ENST00000542667 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3-211ENST00000542667 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3-211ENST00000542667 PTPRKQ15262 1439 aa22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3-211ENST00000542667 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3-211ENST00000542667 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.09■■□□□ 1.13
TM7SF3-211ENST00000542667 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TM7SF3-211ENST00000542667 ITGAEP38570 1179 aa22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3-211ENST00000542667 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3-211ENST00000542667 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3-211ENST00000542667 NPATQ14207 1427 aa22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3-211ENST00000542667 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3-211ENST00000542667 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3-211ENST00000542667 CEP152O94986 1710 aa22.05■■□□□ 1.12
TM7SF3-211ENST00000542667 NCOA1Q15788 1441 aa22.05■■□□□ 1.12
TM7SF3-211ENST00000542667 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3-211ENST00000542667 STRCQ7RTU9 1775 aa22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3-211ENST00000542667 ABCC3O15438 1527 aa22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3-211ENST00000542667 ERBINQ96RT1 1412 aa22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3-211ENST00000542667 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TM7SF3-211ENST00000542667 ADGRL2O95490 1459 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-211ENST00000542667 PZPP20742 1482 aa22■■□□□ 1.11
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-211ENST00000542667 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-211ENST00000542667 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-211ENST00000542667 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-211ENST00000542667 TNRQ92752 1358 aa21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3-211ENST00000542667 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3-211ENST00000542667 DEPDC5O75140 1603 aa21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3-211ENST00000542667 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3-211ENST00000542667 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3-211ENST00000542667 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.9■■□□□ 1.1
TM7SF3-211ENST00000542667 KANK1Q14678 1352 aa21.89■■□□□ 1.1
TM7SF3-211ENST00000542667 ERVK-7P63135 1459 aa21.89■■□□□ 1.09
TM7SF3-211ENST00000542667 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TM7SF3-211ENST00000542667 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-211ENST00000542667 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
TM7SF3-211ENST00000542667 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3-211ENST00000542667 ROCK1Q13464 1354 aa21.86■■□□□ 1.09
TM7SF3-211ENST00000542667 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.84■■□□□ 1.09
TM7SF3-211ENST00000542667 NLRP1Q9C000 1473 aa21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3-211ENST00000542667 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3-211ENST00000542667 PTPRTO14522 1441 aa21.81■■□□□ 1.08
TM7SF3-211ENST00000542667 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.81■■□□□ 1.08
TM7SF3-211ENST00000542667 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.81■■□□□ 1.08
TM7SF3-211ENST00000542667 PLA2R1Q13018 1463 aa21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3-211ENST00000542667 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3-211ENST00000542667 UNC13BO14795 1591 aa21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3-211ENST00000542667 PKD2Q13563 968 aa21.77■■□□□ 1.08
TM7SF3-211ENST00000542667 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TM7SF3-211ENST00000542667 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 CERKQ8TCT0 537 aa21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.75■■□□□ 1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 SYNMO15061 1565 aa21.75■■□□□ 1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.74■■□□□ 1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 PIK3C2BO00750 1634 aa21.74■■□□□ 1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 TET3O43151 1660 aa21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 IDI1Q13907 227 aa21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 NUP155O75694 1391 aa21.73■■□□□ 1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.72■■□□□ 1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 NAIPQ13075 1403 aa21.71■■□□□ 1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.7■■□□□ 1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 E9PCH4 1651 aa21.7■■□□□ 1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.7■■□□□ 1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 NOS1P29475 1434 aa21.7■■□□□ 1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.69■■□□□ 1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 FBXO41Q8TF61 875 aa21.68■■□□□ 1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.68■■□□□ 1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 LTKP29376 864 aa21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 IQGAP1P46940 1657 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 HFM1A2PYH4 1435 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 MED14O60244 1454 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 TRIM52Q96A61 297 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 SLIT1O75093 1534 aa21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 ADGRB3O60242 1522 aa21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 EID1Q9Y6B2 187 aa21.57■■□□□ 1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.55■■□□□ 1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.54■■□□□ 1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.53■■□□□ 1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 FOXD1Q16676 465 aa21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.5■■□□□ 1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 BCANQ96GW7 911 aa21.49■■□□□ 1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.4 ms