RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536420.5

ACVR1B-204, Transcript of activin A receptor type 1B, humanhuman

TSL 4

Gene ACVR1B, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1B-204ENST00000536420 LTBP4Q8N2S1 1624 aa38.16■■■■□ 3.7
ACVR1B-204ENST00000536420 IQSEC2Q5JU85 1478 aa38.15■■■■□ 3.7
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ACVR1B-204ENST00000536420 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.12■■■■□ 3.69
ACVR1B-204ENST00000536420 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.1■■■■□ 3.69
ACVR1B-204ENST00000536420 A2ML1A8K2U0 1454 aa38.09■■■■□ 3.69
ACVR1B-204ENST00000536420 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
ACVR1B-204ENST00000536420 MIA2Q96PC5 1412 aa38.06■■■■□ 3.68
ACVR1B-204ENST00000536420 PZPP20742 1482 aa38.06■■■■□ 3.68
ACVR1B-204ENST00000536420 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.05■■■■□ 3.68
ACVR1B-204ENST00000536420 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
ACVR1B-204ENST00000536420 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
ACVR1B-204ENST00000536420 TNRQ92752 1358 aa38.03■■■■□ 3.68
ACVR1B-204ENST00000536420 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.02■■■■□ 3.68
ACVR1B-204ENST00000536420 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.99■■■■□ 3.67
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ACVR1B-204ENST00000536420 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
ACVR1B-204ENST00000536420 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
ACVR1B-204ENST00000536420 APLP2Q06481 763 aa37.92■■■■□ 3.66
ACVR1B-204ENST00000536420 NLRP1Q9C000 1473 aa37.91■■■■□ 3.66
ACVR1B-204ENST00000536420 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
ACVR1B-204ENST00000536420 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
ACVR1B-204ENST00000536420 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
ACVR1B-204ENST00000536420 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.83■■■■□ 3.65
ACVR1B-204ENST00000536420 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.83■■■■□ 3.65
ACVR1B-204ENST00000536420 ABCC3O15438 1527 aa37.82■■■■□ 3.65
ACVR1B-204ENST00000536420 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.81■■■■□ 3.64
ACVR1B-204ENST00000536420 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.78■■■■□ 3.64
ACVR1B-204ENST00000536420 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.77■■■■□ 3.64
ACVR1B-204ENST00000536420 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.77■■■■□ 3.64
ACVR1B-204ENST00000536420 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.76■■■■□ 3.64
ACVR1B-204ENST00000536420 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.75■■■■□ 3.63
ACVR1B-204ENST00000536420 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.75■■■■□ 3.63
ACVR1B-204ENST00000536420 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.74■■■■□ 3.63
ACVR1B-204ENST00000536420 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.74■■■■□ 3.63
ACVR1B-204ENST00000536420 DEPDC5O75140 1603 aa37.73■■■■□ 3.63
ACVR1B-204ENST00000536420 CPS1P31327 1500 aa37.71■■■■□ 3.63
ACVR1B-204ENST00000536420 MED14O60244 1454 aa37.71■■■■□ 3.63
ACVR1B-204ENST00000536420 ABCC5O15440 1437 aa37.7■■■■□ 3.63
ACVR1B-204ENST00000536420 KIF15Q9NS87 1388 aa37.7■■■■□ 3.63
ACVR1B-204ENST00000536420 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.7■■■■□ 3.63
ACVR1B-204ENST00000536420 CEP152O94986 1710 aa37.7■■■■□ 3.63
ACVR1B-204ENST00000536420 ERBINQ96RT1 1412 aa37.7■■■■□ 3.62
ACVR1B-204ENST00000536420 ERVK-7P63135 1459 aa37.69■■■■□ 3.62
ACVR1B-204ENST00000536420 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
ACVR1B-204ENST00000536420 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
ACVR1B-204ENST00000536420 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.65■■■■□ 3.62
ACVR1B-204ENST00000536420 DAPK1P53355 1430 aa37.64■■■■□ 3.62
ACVR1B-204ENST00000536420 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
ACVR1B-204ENST00000536420 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.63■■■■□ 3.61
ACVR1B-204ENST00000536420 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.63■■■■□ 3.61
ACVR1B-204ENST00000536420 IQGAP1P46940 1657 aa37.59■■■■□ 3.61
ACVR1B-204ENST00000536420 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.57■■■■□ 3.6
ACVR1B-204ENST00000536420 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.56■■■■□ 3.6
ACVR1B-204ENST00000536420 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.56■■■■□ 3.6
ACVR1B-204ENST00000536420 KANK1Q14678 1352 aa37.55■■■■□ 3.6
ACVR1B-204ENST00000536420 TOM1O60784 492 aa37.55■■■■□ 3.6
ACVR1B-204ENST00000536420 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.5■■■■□ 3.59
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ACVR1B-204ENST00000536420 SLIT1O75093 1534 aa37.44■■■■□ 3.58
ACVR1B-204ENST00000536420 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.43■■■■□ 3.58
ACVR1B-204ENST00000536420 ILDR2Q71H61 639 aa37.43■■■■□ 3.58
ACVR1B-204ENST00000536420 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
ACVR1B-204ENST00000536420 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.43■■■■□ 3.58
ACVR1B-204ENST00000536420 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
ACVR1B-204ENST00000536420 ADGRL2O95490 1459 aa37.39■■■■□ 3.58
ACVR1B-204ENST00000536420 PIP4K2BP78356 416 aa37.39■■■■□ 3.58
ACVR1B-204ENST00000536420 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.39■■■■□ 3.58
ACVR1B-204ENST00000536420 EID1Q9Y6B2 187 aa37.39■■■■□ 3.58
ACVR1B-204ENST00000536420 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
ACVR1B-204ENST00000536420 SYNMO15061 1565 aa37.36■■■■□ 3.57
ACVR1B-204ENST00000536420 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.36■■■■□ 3.57
ACVR1B-204ENST00000536420 PIK3C2BO00750 1634 aa37.36■■■■□ 3.57
ACVR1B-204ENST00000536420 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.35■■■■□ 3.57
ACVR1B-204ENST00000536420 LTKP29376 864 aa37.34■■■■□ 3.57
ACVR1B-204ENST00000536420 SOCS7O14512 581 aa37.33■■■■□ 3.57
ACVR1B-204ENST00000536420 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
ACVR1B-204ENST00000536420 LRRC7Q96NW7 1537 aa37.32■■■■□ 3.57
ACVR1B-204ENST00000536420 HSPA1LP34931 641 aa37.31■■■■□ 3.56
ACVR1B-204ENST00000536420 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.3■■■■□ 3.56
ACVR1B-204ENST00000536420 IDI1Q13907 227 aa37.28■■■■□ 3.56
ACVR1B-204ENST00000536420 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.27■■■■□ 3.56
ACVR1B-204ENST00000536420 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.26■■■■□ 3.55
ACVR1B-204ENST00000536420 NOS1P29475 1434 aa37.25■■■■□ 3.55
ACVR1B-204ENST00000536420 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.24■■■■□ 3.55
ACVR1B-204ENST00000536420 ALKQ9UM73 1620 aa37.23■■■■□ 3.55
ACVR1B-204ENST00000536420 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
ACVR1B-204ENST00000536420 ADGRB3O60242 1522 aa37.14■■■■□ 3.54
ACVR1B-204ENST00000536420 TET3O43151 1660 aa37.12■■■■□ 3.53
ACVR1B-204ENST00000536420 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
ACVR1B-204ENST00000536420 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
ACVR1B-204ENST00000536420 ROCK1Q13464 1354 aa37.07■■■■□ 3.53
ACVR1B-204ENST00000536420 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.07■■■■□ 3.52
ACVR1B-204ENST00000536420 KCNA6P17658 529 aa37.07■■■■□ 3.52
ACVR1B-204ENST00000536420 UNC13BO14795 1591 aa37.05■■■■□ 3.52
ACVR1B-204ENST00000536420 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
ACVR1B-204ENST00000536420 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.02■■■■□ 3.52
ACVR1B-204ENST00000536420 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.96■■■■□ 3.51
ACVR1B-204ENST00000536420 TMEM94Q12767 1356 aa36.96■■■■□ 3.51
ACVR1B-204ENST00000536420 BCANQ96GW7 911 aa36.96■■■■□ 3.51
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