RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 GGT6Q6P531 493 aa38.95■■■■□ 3.83
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.95■■■■□ 3.83
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NDUFS3-211ENST00000533507 UNC13BO14795 1591 aa38.88■■■■□ 3.82
NDUFS3-211ENST00000533507 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
NDUFS3-211ENST00000533507 KANK1Q14678 1352 aa38.86■■■■□ 3.81
NDUFS3-211ENST00000533507 PZPP20742 1482 aa38.84■■■■□ 3.81
NDUFS3-211ENST00000533507 FOXD1Q16676 465 aa38.82■■■■□ 3.81
NDUFS3-211ENST00000533507 MLECQ14165 292 aa38.81■■■■□ 3.8
NDUFS3-211ENST00000533507 REREQ9P2R6 1566 aa38.81■■■■□ 3.8
NDUFS3-211ENST00000533507 DEPDC5O75140 1603 aa38.8■■■■□ 3.8
NDUFS3-211ENST00000533507 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.8■■■■□ 3.8
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.8■■■■□ 3.8
NDUFS3-211ENST00000533507 PKD2Q13563 968 aa38.8■■■■□ 3.8
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NDUFS3-211ENST00000533507 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.75■■■■□ 3.79
NDUFS3-211ENST00000533507 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.75■■■■□ 3.79
NDUFS3-211ENST00000533507 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa38.74■■■■□ 3.79
NDUFS3-211ENST00000533507 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.74■■■■□ 3.79
NDUFS3-211ENST00000533507 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
NDUFS3-211ENST00000533507 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.74■■■■□ 3.79
NDUFS3-211ENST00000533507 AGLP35573 1532 aa38.73■■■■□ 3.79
NDUFS3-211ENST00000533507 CLSPNQ9HAW4 1339 aa38.69■■■■□ 3.78
NDUFS3-211ENST00000533507 VWDEQ8N2E2 1590 aa38.63■■■■□ 3.78
NDUFS3-211ENST00000533507 NEUROD1Q13562 356 aa38.63■■■■□ 3.77
NDUFS3-211ENST00000533507 SIN3AQ96ST3 1273 aa38.62■■■■□ 3.77
NDUFS3-211ENST00000533507 CEP152O94986 1710 aa38.62■■■■□ 3.77
NDUFS3-211ENST00000533507 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
NDUFS3-211ENST00000533507 TET3O43151 1660 aa38.56■■■■□ 3.76
NDUFS3-211ENST00000533507 ABCC3O15438 1527 aa38.56■■■■□ 3.76
NDUFS3-211ENST00000533507 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.55■■■■□ 3.76
NDUFS3-211ENST00000533507 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa38.53■■■■□ 3.76
NDUFS3-211ENST00000533507 LMTK2Q8IWU2 1503 aa38.52■■■■□ 3.76
NDUFS3-211ENST00000533507 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
NDUFS3-211ENST00000533507 E9PCH4 1651 aa38.5■■■■□ 3.75
NDUFS3-211ENST00000533507 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
NDUFS3-211ENST00000533507 EFCAB6Q5THR3 1501 aa38.48■■■■□ 3.75
NDUFS3-211ENST00000533507 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.45■■■■□ 3.75
NDUFS3-211ENST00000533507 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
NDUFS3-211ENST00000533507 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
NDUFS3-211ENST00000533507 NPATQ14207 1427 aa38.41■■■■□ 3.74
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC144AA2RUR9 1427 aa38.36■■■■□ 3.73
NDUFS3-211ENST00000533507 PLA2R1Q13018 1463 aa38.35■■■■□ 3.73
NDUFS3-211ENST00000533507 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
NDUFS3-211ENST00000533507 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa38.33■■■■□ 3.73
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa38.32■■■■□ 3.73
NDUFS3-211ENST00000533507 ZMYM3Q14202 1370 aa38.32■■■■□ 3.72
NDUFS3-211ENST00000533507 TONSLQ96HA7 1378 aa38.31■■■■□ 3.72
NDUFS3-211ENST00000533507 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.31■■■■□ 3.72
NDUFS3-211ENST00000533507 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
NDUFS3-211ENST00000533507 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.3■■■■□ 3.72
NDUFS3-211ENST00000533507 PTPRTO14522 1441 aa38.29■■■■□ 3.72
NDUFS3-211ENST00000533507 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa38.27■■■■□ 3.72
NDUFS3-211ENST00000533507 TRPM2O94759 1503 aa38.26■■■■□ 3.71
NDUFS3-211ENST00000533507 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
NDUFS3-211ENST00000533507 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.19■■■■□ 3.7
NDUFS3-211ENST00000533507 UGGT1Q9NYU2 1555 aa38.19■■■■□ 3.7
NDUFS3-211ENST00000533507 RGL3Q3MIN7 710 aa38.19■■■■□ 3.7
NDUFS3-211ENST00000533507 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa38.19■■■■□ 3.7
NDUFS3-211ENST00000533507 NOS1P29475 1434 aa38.18■■■■□ 3.7
NDUFS3-211ENST00000533507 MADDQ8WXG6 1647 aa38.18■■■■□ 3.7
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NDUFS3-211ENST00000533507 MROH2AA6NES4 1674 aa38.16■■■■□ 3.7
NDUFS3-211ENST00000533507 CLTCL1P53675 1640 aa38.16■■■■□ 3.7
NDUFS3-211ENST00000533507 ERVK-7P63135 1459 aa38.16■■■■□ 3.7
NDUFS3-211ENST00000533507 L3MBTL2Q969R5 705 aa38.14■■■■□ 3.7
NDUFS3-211ENST00000533507 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.69
NDUFS3-211ENST00000533507 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.12■■■■□ 3.69
NDUFS3-211ENST00000533507 SYNMO15061 1565 aa38.11■■■■□ 3.69
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC52A1Q9NWF4 448 aa38.09■■■■□ 3.69
NDUFS3-211ENST00000533507 IDI1Q13907 227 aa38.08■■■■□ 3.69
NDUFS3-211ENST00000533507 C3P01024 1663 aa38.08■■■■□ 3.69
NDUFS3-211ENST00000533507 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa38.06■■■■□ 3.68
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NDUFS3-211ENST00000533507 KIF1BO60333 1816 aa38.03■■■■□ 3.68
NDUFS3-211ENST00000533507 DCAF11Q8TEB1 546 aa38.03■■■■□ 3.68
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
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NDUFS3-211ENST00000533507 TNRQ92752 1358 aa38.02■■■■□ 3.68
NDUFS3-211ENST00000533507 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
NDUFS3-211ENST00000533507 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa37.98■■■■□ 3.67
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NDUFS3-211ENST00000533507 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.83■■■■□ 3.65
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NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.81■■■■□ 3.64
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NDUFS3-211ENST00000533507 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
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NDUFS3-211ENST00000533507 NLRP1Q9C000 1473 aa37.79■■■■□ 3.64
NDUFS3-211ENST00000533507 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa37.77■■■■□ 3.64
NDUFS3-211ENST00000533507 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.74■■■■□ 3.63
NDUFS3-211ENST00000533507 STAC3Q96MF2 364 aa37.73■■■■□ 3.63
NDUFS3-211ENST00000533507 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.71■■■■□ 3.63
NDUFS3-211ENST00000533507 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa37.68■■■■□ 3.62
NDUFS3-211ENST00000533507 VGFO15240 615 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
NDUFS3-211ENST00000533507 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
NDUFS3-211ENST00000533507 PRAG1Q86YV5 1406 aa37.68■■■■□ 3.62
NDUFS3-211ENST00000533507 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
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