RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532743.5

RAD51-208, Transcript of RAD51 recombinase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAD51, Length 1,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51-208ENST00000532743 PTPRKQ15262 1439 aa37.44■■■■□ 3.58
RAD51-208ENST00000532743 ERBINQ96RT1 1412 aa37.44■■■■□ 3.58
RAD51-208ENST00000532743 C3P01024 1663 aa37.43■■■■□ 3.58
RAD51-208ENST00000532743 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.4■■■■□ 3.58
RAD51-208ENST00000532743 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.4■■■■□ 3.58
RAD51-208ENST00000532743 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
RAD51-208ENST00000532743 ROCK1Q13464 1354 aa37.35■■■■□ 3.57
RAD51-208ENST00000532743 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.34■■■■□ 3.57
RAD51-208ENST00000532743 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.34■■■■□ 3.57
RAD51-208ENST00000532743 DEPDC5O75140 1603 aa37.34■■■■□ 3.57
RAD51-208ENST00000532743 CEP152O94986 1710 aa37.34■■■■□ 3.57
RAD51-208ENST00000532743 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.33■■■■□ 3.57
RAD51-208ENST00000532743 PPP6R1Q9UPN7 881 aa37.3■■■■□ 3.56
RAD51-208ENST00000532743 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.29■■■■□ 3.56
RAD51-208ENST00000532743 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
RAD51-208ENST00000532743 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.28■■■■□ 3.56
RAD51-208ENST00000532743 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
RAD51-208ENST00000532743 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.23■■■■□ 3.55
RAD51-208ENST00000532743 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
RAD51-208ENST00000532743 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.22■■■■□ 3.55
RAD51-208ENST00000532743 ABCC3O15438 1527 aa37.21■■■■□ 3.55
RAD51-208ENST00000532743 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.21■■■■□ 3.55
RAD51-208ENST00000532743 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
RAD51-208ENST00000532743 ZMYM3Q14202 1370 aa37.2■■■■□ 3.55
RAD51-208ENST00000532743 KANK1Q14678 1352 aa37.17■■■■□ 3.54
RAD51-208ENST00000532743 UNC13BO14795 1591 aa37.16■■■■□ 3.54
RAD51-208ENST00000532743 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.16■■■■□ 3.543e-6■■■■□ 20.1
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RAD51-208ENST00000532743 PZPP20742 1482 aa37.07■■■■□ 3.53
RAD51-208ENST00000532743 NAIPQ13075 1403 aa37.07■■■■□ 3.52
RAD51-208ENST00000532743 HFM1A2PYH4 1435 aa37.06■■■■□ 3.52
RAD51-208ENST00000532743 NPATQ14207 1427 aa37.06■■■■□ 3.52
RAD51-208ENST00000532743 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.04■■■■□ 3.52
RAD51-208ENST00000532743 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.02■■■■□ 3.52
RAD51-208ENST00000532743 TET3O43151 1660 aa37.01■■■■□ 3.52
RAD51-208ENST00000532743 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.01■■■■□ 3.52
RAD51-208ENST00000532743 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.01■■■■□ 3.51
RAD51-208ENST00000532743 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.01■■■■□ 3.51
RAD51-208ENST00000532743 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.98■■■■□ 3.51
RAD51-208ENST00000532743 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
RAD51-208ENST00000532743 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.92■■■■□ 3.5
RAD51-208ENST00000532743 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.91■■■■□ 3.5
RAD51-208ENST00000532743 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
RAD51-208ENST00000532743 NUP155O75694 1391 aa36.9■■■■□ 3.5
RAD51-208ENST00000532743 ERVK-7P63135 1459 aa36.89■■■■□ 3.5
RAD51-208ENST00000532743 TNRQ92752 1358 aa36.89■■■■□ 3.5
RAD51-208ENST00000532743 E9PCH4 1651 aa36.89■■■■□ 3.5
RAD51-208ENST00000532743 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
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RAD51-208ENST00000532743 TRIM52Q96A61 297 aa36.78■■■■□ 3.48
RAD51-208ENST00000532743 NLRP1Q9C000 1473 aa36.78■■■■□ 3.48
RAD51-208ENST00000532743 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.77■■■■□ 3.48
RAD51-208ENST00000532743 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.76■■■■□ 3.48
RAD51-208ENST00000532743 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.74■■■■□ 3.47
RAD51-208ENST00000532743 SYNMO15061 1565 aa36.74■■■■□ 3.47
RAD51-208ENST00000532743 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.69■■■■□ 3.46
RAD51-208ENST00000532743 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.69■■■■□ 3.46
RAD51-208ENST00000532743 PIK3C2BO00750 1634 aa36.69■■■■□ 3.46
RAD51-208ENST00000532743 NOS1P29475 1434 aa36.67■■■■□ 3.46
RAD51-208ENST00000532743 STRCQ7RTU9 1775 aa36.67■■■■□ 3.46
RAD51-208ENST00000532743 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.66■■■■□ 3.46
RAD51-208ENST00000532743 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
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RAD51-208ENST00000532743 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
RAD51-208ENST00000532743 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
RAD51-208ENST00000532743 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
RAD51-208ENST00000532743 PLA2R1Q13018 1463 aa36.57■■■■□ 3.44
RAD51-208ENST00000532743 ADGRB3O60242 1522 aa36.54■■■■□ 3.44
RAD51-208ENST00000532743 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
RAD51-208ENST00000532743 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.53■■■■□ 3.44
RAD51-208ENST00000532743 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.52■■■■□ 3.44
RAD51-208ENST00000532743 PKD2Q13563 968 aa36.51■■■■□ 3.44
RAD51-208ENST00000532743 KIF1BO60333 1816 aa36.5■■■■□ 3.43
RAD51-208ENST00000532743 TRPM2O94759 1503 aa36.5■■■■□ 3.43
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RAD51-208ENST00000532743 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.45■■■■□ 3.43
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RAD51-208ENST00000532743 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.45■■■■□ 3.43
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RAD51-208ENST00000532743 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.26■■■■□ 3.39
RAD51-208ENST00000532743 MED14O60244 1454 aa36.25■■■■□ 3.39
RAD51-208ENST00000532743 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
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RAD51-208ENST00000532743 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.21■■■■□ 3.39
RAD51-208ENST00000532743 LTKP29376 864 aa36.19■■■■□ 3.38
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