RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531933.1

ATG13-218, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 3

Gene ATG13, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-218ENST00000531933 NCOA1Q15788 1441 aa15.12■□□□□ 0.01
ATG13-218ENST00000531933 MROH2AA6NES4 1674 aa15.12■□□□□ 0.01
ATG13-218ENST00000531933 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
ATG13-218ENST00000531933 ROCK1Q13464 1354 aa15.11■□□□□ 0.01
ATG13-218ENST00000531933 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
ATG13-218ENST00000531933 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.1■□□□□ 0.01
ATG13-218ENST00000531933 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.09■□□□□ 0.01
ATG13-218ENST00000531933 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
ATG13-218ENST00000531933 PTPRKQ15262 1439 aa15.08■□□□□ 0
ATG13-218ENST00000531933 C3P01024 1663 aa15.07■□□□□ 0
ATG13-218ENST00000531933 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.07■□□□□ 0
ATG13-218ENST00000531933 KANK1Q14678 1352 aa15.07■□□□□ 0
ATG13-218ENST00000531933 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.07■□□□□ 0
ATG13-218ENST00000531933 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
ATG13-218ENST00000531933 DEPDC5O75140 1603 aa15.05■□□□□ -0
ATG13-218ENST00000531933 MROH1Q8NDA8 1641 aa15.03■□□□□ -0
ATG13-218ENST00000531933 ZMYM3Q14202 1370 aa15.03■□□□□ -0
ATG13-218ENST00000531933 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.03■□□□□ -0
ATG13-218ENST00000531933 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
ATG13-218ENST00000531933 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -0
ATG13-218ENST00000531933 CEP152O94986 1710 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG13-218ENST00000531933 ABCC3O15438 1527 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG13-218ENST00000531933 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG13-218ENST00000531933 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15□□□□□ -0.01
ATG13-218ENST00000531933 NPATQ14207 1427 aa15□□□□□ -0.01
ATG13-218ENST00000531933 UNC13BO14795 1591 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG13-218ENST00000531933 PZPP20742 1482 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG13-218ENST00000531933 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG13-218ENST00000531933 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG13-218ENST00000531933 HFM1A2PYH4 1435 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG13-218ENST00000531933 NAIPQ13075 1403 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG13-218ENST00000531933 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.96□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 TET3O43151 1660 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 TNRQ92752 1358 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 NUP155O75694 1391 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 ERVK-7P63135 1459 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG13-218ENST00000531933 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG13-218ENST00000531933 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG13-218ENST00000531933 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG13-218ENST00000531933 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG13-218ENST00000531933 TRIM52Q96A61 297 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG13-218ENST00000531933 NLRP1Q9C000 1473 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG13-218ENST00000531933 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG13-218ENST00000531933 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG13-218ENST00000531933 HSPA2P54652 639 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-218ENST00000531933 E9PCH4 1651 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-218ENST00000531933 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-218ENST00000531933 NOS1P29475 1434 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-218ENST00000531933 SYNMO15061 1565 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG13-218ENST00000531933 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG13-218ENST00000531933 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG13-218ENST00000531933 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG13-218ENST00000531933 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG13-218ENST00000531933 PLA2R1Q13018 1463 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG13-218ENST00000531933 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG13-218ENST00000531933 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG13-218ENST00000531933 PIK3C2BO00750 1634 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG13-218ENST00000531933 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG13-218ENST00000531933 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
ATG13-218ENST00000531933 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 PKD2Q13563 968 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 ADGRB3O60242 1522 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 HRCP23327 699 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 STRCQ7RTU9 1775 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 IDI1Q13907 227 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 TRPM2O94759 1503 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 PTPRTO14522 1441 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 EID1Q9Y6B2 187 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-218ENST00000531933 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 KIF1BO60333 1816 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 SLIT1O75093 1534 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 CLTCL1P53675 1640 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 IQGAP1P46940 1657 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 MED14O60244 1454 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG13-218ENST00000531933 FOXD1Q16676 465 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms