RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
PTPRU-211ENST00000531385 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
PTPRU-211ENST00000531385 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
PTPRU-211ENST00000531385 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.95■■■□□ 2.23
PTPRU-211ENST00000531385 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.95■■■□□ 2.23
PTPRU-211ENST00000531385 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRU-211ENST00000531385 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRU-211ENST00000531385 PTPRKQ15262 1439 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRU-211ENST00000531385 NPATQ14207 1427 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRU-211ENST00000531385 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.88■■■□□ 2.21
PTPRU-211ENST00000531385 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.88■■■□□ 2.21
PTPRU-211ENST00000531385 NCOA1Q15788 1441 aa28.86■■■□□ 2.21
PTPRU-211ENST00000531385 ERBINQ96RT1 1412 aa28.86■■■□□ 2.21
PTPRU-211ENST00000531385 ABCC3O15438 1527 aa28.86■■■□□ 2.21
PTPRU-211ENST00000531385 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.86■■■□□ 2.21
PTPRU-211ENST00000531385 CEP152O94986 1710 aa28.86■■■□□ 2.21
PTPRU-211ENST00000531385 ADGRL2O95490 1459 aa28.85■■■□□ 2.21
PTPRU-211ENST00000531385 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.85■■■□□ 2.21
PTPRU-211ENST00000531385 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
PTPRU-211ENST00000531385 PZPP20742 1482 aa28.81■■■□□ 2.2
PTPRU-211ENST00000531385 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PTPRU-211ENST00000531385 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
PTPRU-211ENST00000531385 ITGAEP38570 1179 aa28.79■■■□□ 2.2
PTPRU-211ENST00000531385 DEPDC5O75140 1603 aa28.79■■■□□ 2.2
PTPRU-211ENST00000531385 STRCQ7RTU9 1775 aa28.78■■■□□ 2.2
PTPRU-211ENST00000531385 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
PTPRU-211ENST00000531385 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.76■■■□□ 2.2
PTPRU-211ENST00000531385 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
PTPRU-211ENST00000531385 TNRQ92752 1358 aa28.74■■■□□ 2.19
PTPRU-211ENST00000531385 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
PTPRU-211ENST00000531385 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
PTPRU-211ENST00000531385 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.71■■■□□ 2.19
PTPRU-211ENST00000531385 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.18
PTPRU-211ENST00000531385 ERVK-7P63135 1459 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRU-211ENST00000531385 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRU-211ENST00000531385 ROCK1Q13464 1354 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRU-211ENST00000531385 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRU-211ENST00000531385 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRU-211ENST00000531385 KANK1Q14678 1352 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRU-211ENST00000531385 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRU-211ENST00000531385 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRU-211ENST00000531385 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRU-211ENST00000531385 NLRP1Q9C000 1473 aa28.58■■■□□ 2.17
PTPRU-211ENST00000531385 UNC13BO14795 1591 aa28.58■■■□□ 2.17
PTPRU-211ENST00000531385 PLA2R1Q13018 1463 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRU-211ENST00000531385 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRU-211ENST00000531385 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.54■■■□□ 2.16
PTPRU-211ENST00000531385 PTPRTO14522 1441 aa28.52■■■□□ 2.16
PTPRU-211ENST00000531385 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.51■■■□□ 2.15
PTPRU-211ENST00000531385 TET3O43151 1660 aa28.48■■■□□ 2.15
PTPRU-211ENST00000531385 SYNMO15061 1565 aa28.48■■■□□ 2.15
PTPRU-211ENST00000531385 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PTPRU-211ENST00000531385 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.46■■■□□ 2.15
PTPRU-211ENST00000531385 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.45■■■□□ 2.15
PTPRU-211ENST00000531385 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.45■■■□□ 2.15
PTPRU-211ENST00000531385 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.45■■■□□ 2.14
PTPRU-211ENST00000531385 NAIPQ13075 1403 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRU-211ENST00000531385 PIK3C2BO00750 1634 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRU-211ENST00000531385 PKD2Q13563 968 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRU-211ENST00000531385 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
PTPRU-211ENST00000531385 NOS1P29475 1434 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRU-211ENST00000531385 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PTPRU-211ENST00000531385 NUP155O75694 1391 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRU-211ENST00000531385 E9PCH4 1651 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRU-211ENST00000531385 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
PTPRU-211ENST00000531385 IDI1Q13907 227 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRU-211ENST00000531385 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRU-211ENST00000531385 CERKQ8TCT0 537 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRU-211ENST00000531385 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRU-211ENST00000531385 HFM1A2PYH4 1435 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PTPRU-211ENST00000531385 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PTPRU-211ENST00000531385 ADGRB3O60242 1522 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRU-211ENST00000531385 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRU-211ENST00000531385 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRU-211ENST00000531385 IQGAP1P46940 1657 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRU-211ENST00000531385 SLIT1O75093 1534 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRU-211ENST00000531385 MED14O60244 1454 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRU-211ENST00000531385 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PTPRU-211ENST00000531385 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.27■■■□□ 2.12
PTPRU-211ENST00000531385 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PTPRU-211ENST00000531385 LTKP29376 864 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRU-211ENST00000531385 FBXO41Q8TF61 875 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRU-211ENST00000531385 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRU-211ENST00000531385 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRU-211ENST00000531385 TRIM52Q96A61 297 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRU-211ENST00000531385 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRU-211ENST00000531385 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PTPRU-211ENST00000531385 EID1Q9Y6B2 187 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRU-211ENST00000531385 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
PTPRU-211ENST00000531385 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.13■■■□□ 2.09
PTPRU-211ENST00000531385 ZFYVE9O95405 1425 aa28.11■■■□□ 2.09
PTPRU-211ENST00000531385 CLTCL1P53675 1640 aa28.1■■■□□ 2.09
PTPRU-211ENST00000531385 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.1■■■□□ 2.09
PTPRU-211ENST00000531385 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
PTPRU-211ENST00000531385 TRPM2O94759 1503 aa28.08■■■□□ 2.09
PTPRU-211ENST00000531385 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.07■■■□□ 2.08
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