RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529728.5

SERGEF-212, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 1,396 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-212ENST00000529728 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.81
SERGEF-212ENST00000529728 ZMYM3Q14202 1370 aa38.82■■■■□ 3.81
SERGEF-212ENST00000529728 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.81■■■■□ 3.8
SERGEF-212ENST00000529728 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP38.81■■■■□ 3.8
SERGEF-212ENST00000529728 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.8■■■■□ 3.8
SERGEF-212ENST00000529728 NCOA1Q15788 1441 aa38.8■■■■□ 3.8
SERGEF-212ENST00000529728 ERBINQ96RT1 1412 aa38.8■■■■□ 3.8
SERGEF-212ENST00000529728 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.79■■■■□ 3.82e-9■■■■■ 39.6
SERGEF-212ENST00000529728 NPATQ14207 1427 aa38.77■■■■□ 3.8
SERGEF-212ENST00000529728 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.76■■■■□ 3.8
SERGEF-212ENST00000529728 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.75■■■■□ 3.79
SERGEF-212ENST00000529728 DEPDC5O75140 1603 aa38.73■■■■□ 3.79
SERGEF-212ENST00000529728 PTPRKQ15262 1439 aa38.73■■■■□ 3.79
SERGEF-212ENST00000529728 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.72■■■■□ 3.79
SERGEF-212ENST00000529728 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.7■■■■□ 3.79
SERGEF-212ENST00000529728 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
SERGEF-212ENST00000529728 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
SERGEF-212ENST00000529728 ABCC3O15438 1527 aa38.68■■■■□ 3.78
SERGEF-212ENST00000529728 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.66■■■■□ 3.78
SERGEF-212ENST00000529728 CEP152O94986 1710 aa38.63■■■■□ 3.78
SERGEF-212ENST00000529728 PZPP20742 1482 aa38.63■■■■□ 3.78
SERGEF-212ENST00000529728 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.63■■■■□ 3.77
SERGEF-212ENST00000529728 ROCK1Q13464 1354 aa38.6■■■■□ 3.77
SERGEF-212ENST00000529728 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.6■■■■□ 3.77
SERGEF-212ENST00000529728 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
SERGEF-212ENST00000529728 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.57■■■■□ 3.77
SERGEF-212ENST00000529728 HSPA2P54652 639 aa38.57■■■■□ 3.77
SERGEF-212ENST00000529728 VWDEQ8N2E2 1590 aa38.56■■■■□ 3.76
SERGEF-212ENST00000529728 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.53■■■■□ 3.76
SERGEF-212ENST00000529728 STRCQ7RTU9 1775 aa38.5■■■■□ 3.75
SERGEF-212ENST00000529728 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
SERGEF-212ENST00000529728 LMTK2Q8IWU2 1503 aa38.48■■■■□ 3.75
SERGEF-212ENST00000529728 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa38.46■■■■□ 3.75
SERGEF-212ENST00000529728 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa38.45■■■■□ 3.75
SERGEF-212ENST00000529728 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
SERGEF-212ENST00000529728 UNC13BO14795 1591 aa38.43■■■■□ 3.74
SERGEF-212ENST00000529728 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
SERGEF-212ENST00000529728 TNRQ92752 1358 aa38.42■■■■□ 3.74
SERGEF-212ENST00000529728 A2ML1A8K2U0 1454 aa38.39■■■■□ 3.74
SERGEF-212ENST00000529728 ERVK-7P63135 1459 aa38.39■■■■□ 3.74
SERGEF-212ENST00000529728 KANK1Q14678 1352 aa38.39■■■■□ 3.74
SERGEF-212ENST00000529728 ITGAEP38570 1179 aa38.37■■■■□ 3.73
SERGEF-212ENST00000529728 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.35■■■■□ 3.739e-7■□□□□ 8.9
SERGEF-212ENST00000529728 NLRP1Q9C000 1473 aa38.34■■■■□ 3.73
SERGEF-212ENST00000529728 EFCAB6Q5THR3 1501 aa38.34■■■■□ 3.73
SERGEF-212ENST00000529728 PLA2R1Q13018 1463 aa38.31■■■■□ 3.72
SERGEF-212ENST00000529728 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.31■■■■□ 3.72
SERGEF-212ENST00000529728 TET3O43151 1660 aa38.29■■■■□ 3.72
SERGEF-212ENST00000529728 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.27■■■■□ 3.72
SERGEF-212ENST00000529728 NAIPQ13075 1403 aa38.22■■■■□ 3.71
SERGEF-212ENST00000529728 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
SERGEF-212ENST00000529728 UGGT1Q9NYU2 1555 aa38.2■■■■□ 3.71
SERGEF-212ENST00000529728 PTPRTO14522 1441 aa38.19■■■■□ 3.7
SERGEF-212ENST00000529728 UBR1Q8IWV7 1749 aa38.18■■■■□ 3.7
SERGEF-212ENST00000529728 HFM1A2PYH4 1435 aa38.17■■■■□ 3.7
SERGEF-212ENST00000529728 NOS1P29475 1434 aa38.17■■■■□ 3.7
SERGEF-212ENST00000529728 SYNMO15061 1565 aa38.16■■■■□ 3.7
SERGEF-212ENST00000529728 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
SERGEF-212ENST00000529728 DMRT2Q9Y5R5 561 aa38.16■■■■□ 3.7
SERGEF-212ENST00000529728 E9PCH4 1651 aa38.14■■■■□ 3.7
SERGEF-212ENST00000529728 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
SERGEF-212ENST00000529728 PIK3C2BO00750 1634 aa38.09■■■■□ 3.69
SERGEF-212ENST00000529728 PKD2Q13563 968 aa38.09■■■■□ 3.69
SERGEF-212ENST00000529728 NUP155O75694 1391 aa38.08■■■■□ 3.69
SERGEF-212ENST00000529728 NEURL4Q96JN8 1562 aa38.07■■■■□ 3.69
SERGEF-212ENST00000529728 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
SERGEF-212ENST00000529728 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa38.06■■■■□ 3.68
SERGEF-212ENST00000529728 SLIT1O75093 1534 aa37.98■■■■□ 3.67
SERGEF-212ENST00000529728 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.98■■■■□ 3.67
SERGEF-212ENST00000529728 MED14O60244 1454 aa37.97■■■■□ 3.67
SERGEF-212ENST00000529728 IDI1Q13907 227 aa37.95■■■■□ 3.67
SERGEF-212ENST00000529728 ADGRB3O60242 1522 aa37.94■■■■□ 3.66
SERGEF-212ENST00000529728 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.93■■■■□ 3.66
SERGEF-212ENST00000529728 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.92■■■■□ 3.66
SERGEF-212ENST00000529728 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.91■■■■□ 3.66
SERGEF-212ENST00000529728 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.9■■■■□ 3.66
SERGEF-212ENST00000529728 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.9■■■■□ 3.66
SERGEF-212ENST00000529728 IQGAP1P46940 1657 aa37.88■■■■□ 3.65
SERGEF-212ENST00000529728 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.85■■■■□ 3.65
SERGEF-212ENST00000529728 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.84■■■■□ 3.65
SERGEF-212ENST00000529728 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
SERGEF-212ENST00000529728 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
SERGEF-212ENST00000529728 LTKP29376 864 aa37.77■■■■□ 3.64
SERGEF-212ENST00000529728 CERKQ8TCT0 537 aa37.76■■■■□ 3.64
SERGEF-212ENST00000529728 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.75■■■■□ 3.63
SERGEF-212ENST00000529728 TRPM2O94759 1503 aa37.74■■■■□ 3.63
SERGEF-212ENST00000529728 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.72■■■■□ 3.63
SERGEF-212ENST00000529728 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
SERGEF-212ENST00000529728 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.71■■■■□ 3.63
SERGEF-212ENST00000529728 TRIM52Q96A61 297 aa37.71■■■■□ 3.63
SERGEF-212ENST00000529728 ZFYVE9O95405 1425 aa37.71■■■■□ 3.63
SERGEF-212ENST00000529728 CLTCL1P53675 1640 aa37.68■■■■□ 3.62
SERGEF-212ENST00000529728 EID1Q9Y6B2 187 aa37.68■■■■□ 3.62
SERGEF-212ENST00000529728 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.66■■■■□ 3.62
SERGEF-212ENST00000529728 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
SERGEF-212ENST00000529728 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
SERGEF-212ENST00000529728 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
SERGEF-212ENST00000529728 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.63■■■■□ 3.61
SERGEF-212ENST00000529728 FBXO41Q8TF61 875 aa37.63■■■■□ 3.61
SERGEF-212ENST00000529728 KIF1BO60333 1816 aa37.61■■■■□ 3.61
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