RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-209ENST00000526080 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-209ENST00000526080 PZPP20742 1482 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-209ENST00000526080 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-209ENST00000526080 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-209ENST00000526080 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-209ENST00000526080 TNRQ92752 1358 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-209ENST00000526080 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-209ENST00000526080 CEP162Q5TB80 1403 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-209ENST00000526080 ALKQ9UM73 1620 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRU-209ENST00000526080 HSPA1LP34931 641 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-209ENST00000526080 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-209ENST00000526080 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-209ENST00000526080 MED14O60244 1454 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-209ENST00000526080 DEPDC5O75140 1603 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRU-209ENST00000526080 NLRP1Q9C000 1473 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-209ENST00000526080 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-209ENST00000526080 MIA2Q96PC5 1412 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-209ENST00000526080 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-209ENST00000526080 KIF3BO15066 747 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-209ENST00000526080 TOM1O60784 492 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-209ENST00000526080 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-209ENST00000526080 PIP4K2BP78356 416 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 NCOA2Q15596 1464 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 IQGAP1P46940 1657 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 SYNMO15061 1565 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 ABCC3O15438 1527 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-209ENST00000526080 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-209ENST00000526080 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-209ENST00000526080 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-209ENST00000526080 ERVK-7P63135 1459 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-209ENST00000526080 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-209ENST00000526080 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-209ENST00000526080 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-209ENST00000526080 TSPY4P0CV99 314 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-209ENST00000526080 TSPY10P0CW01 314 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-209ENST00000526080 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-209ENST00000526080 CEP152O94986 1710 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-209ENST00000526080 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-209ENST00000526080 SLIT1O75093 1534 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-209ENST00000526080 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-209ENST00000526080 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-209ENST00000526080 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-209ENST00000526080 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-209ENST00000526080 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-209ENST00000526080 LTKP29376 864 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-209ENST00000526080 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-209ENST00000526080 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-209ENST00000526080 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-209ENST00000526080 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-209ENST00000526080 PIK3C2BO00750 1634 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-209ENST00000526080 MAP3K1Q13233 1512 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-209ENST00000526080 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-209ENST00000526080 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-209ENST00000526080 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-209ENST00000526080 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-209ENST00000526080 ERBINQ96RT1 1412 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-209ENST00000526080 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-209ENST00000526080 KIF15Q9NS87 1388 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-209ENST00000526080 TET3O43151 1660 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-209ENST00000526080 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PTPRU-209ENST00000526080 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-209ENST00000526080 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-209ENST00000526080 ABCC5O15440 1437 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-209ENST00000526080 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-209ENST00000526080 EID1Q9Y6B2 187 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-209ENST00000526080 NWD1Q149M9 1564 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM94Q12767 1356 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-209ENST00000526080 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-209ENST00000526080 POTEAQ6S8J7 498 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-209ENST00000526080 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-209ENST00000526080 ADGRB3O60242 1522 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-209ENST00000526080 NOS1P29475 1434 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-209ENST00000526080 KCNA6P17658 529 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-209ENST00000526080 DAPK1P53355 1430 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-209ENST00000526080 IDI1Q13907 227 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-209ENST00000526080 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-209ENST00000526080 KANK1Q14678 1352 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-209ENST00000526080 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-209ENST00000526080 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-209ENST00000526080 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-209ENST00000526080 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-209ENST00000526080 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-209ENST00000526080 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-209ENST00000526080 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-209ENST00000526080 PHLPP1O60346 1717 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRU-209ENST00000526080 ZFYVE9O95405 1425 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-209ENST00000526080 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRU-209ENST00000526080 ADGRL2O95490 1459 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms