RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523562.5

HSF4-224, Transcript of heat shock transcription factor 4, human

TSL 2

Gene HSF4, Length 1,839 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HSF4-224	ENST00000523562	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.82	■■■□□ 2.84
HSF4-224	ENST00000523562	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.82	■■■□□ 2.84
HSF4-224	ENST00000523562	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.82	■■■□□ 2.84
HSF4-224	ENST00000523562	FOXD1	Q16676	465 aa		32.81	■■■□□ 2.84
HSF4-224	ENST00000523562	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
HSF4-224	ENST00000523562	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.8	■■■□□ 2.84
HSF4-224	ENST00000523562	PKD2	Q13563	968 aa		32.79	■■■□□ 2.84
HSF4-224	ENST00000523562	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.77	■■■□□ 2.84
HSF4-224	ENST00000523562	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.77	■■■□□ 2.84
HSF4-224	ENST00000523562	KIF3B	O15066	747 aa		32.77	■■■□□ 2.84
HSF4-224	ENST00000523562	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.73	■■■□□ 2.83
HSF4-224	ENST00000523562	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.71	■■■□□ 2.83
HSF4-224	ENST00000523562	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.7	■■■□□ 2.83
HSF4-224	ENST00000523562	KANK1	Q14678	1352 aa		32.7	■■■□□ 2.83
HSF4-224	ENST00000523562	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
HSF4-224	ENST00000523562	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
HSF4-224	ENST00000523562	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.67	■■■□□ 2.82
HSF4-224	ENST00000523562	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.67	■■■□□ 2.82
HSF4-224	ENST00000523562	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
HSF4-224	ENST00000523562	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.64	■■■□□ 2.82
HSF4-224	ENST00000523562	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.62	■■■□□ 2.81
HSF4-224	ENST00000523562	ATP10A	O60312	1499 aa		32.6	■■■□□ 2.81
HSF4-224	ENST00000523562	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
HSF4-224	ENST00000523562	TET3	O43151	1660 aa		32.59	■■■□□ 2.81
HSF4-224	ENST00000523562	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.56	■■■□□ 2.8
HSF4-224	ENST00000523562	GGT6	Q6P531	493 aa		32.55	■■■□□ 2.8
HSF4-224	ENST00000523562	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.54	■■■□□ 2.8
HSF4-224	ENST00000523562		E9PCH4	1651 aa		32.53	■■■□□ 2.8
HSF4-224	ENST00000523562	CEP152	O94986	1710 aa		32.51	■■■□□ 2.8
HSF4-224	ENST00000523562	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.48	■■■□□ 2.79
HSF4-224	ENST00000523562	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.46	■■■□□ 2.79
HSF4-224	ENST00000523562	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.45	■■■□□ 2.79
HSF4-224	ENST00000523562	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
HSF4-224	ENST00000523562	AGL	P35573	1532 aa		32.45	■■■□□ 2.78
HSF4-224	ENST00000523562	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.43	■■■□□ 2.78
HSF4-224	ENST00000523562	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.42	■■■□□ 2.78
HSF4-224	ENST00000523562	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.42	■■■□□ 2.78
HSF4-224	ENST00000523562	ABCC3	O15438	1527 aa		32.42	■■■□□ 2.78
HSF4-224	ENST00000523562	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
HSF4-224	ENST00000523562	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.4	■■■□□ 2.78
HSF4-224	ENST00000523562	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.37	■■■□□ 2.77
HSF4-224	ENST00000523562	TRPM2	O94759	1503 aa		32.37	■■■□□ 2.77
HSF4-224	ENST00000523562	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.36	■■■□□ 2.77
HSF4-224	ENST00000523562	PTPRT	O14522	1441 aa		32.34	■■■□□ 2.77
HSF4-224	ENST00000523562	NPAT	Q14207	1427 aa		32.29	■■■□□ 2.76
HSF4-224	ENST00000523562	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.28	■■■□□ 2.76
HSF4-224	ENST00000523562	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
HSF4-224	ENST00000523562	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
HSF4-224	ENST00000523562	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.25	■■■□□ 2.75
HSF4-224	ENST00000523562	MLEC	Q14165	292 aa		32.23	■■■□□ 2.75
HSF4-224	ENST00000523562	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.23	■■■□□ 2.75
HSF4-224	ENST00000523562	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
HSF4-224	ENST00000523562	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
HSF4-224	ENST00000523562	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.19	■■■□□ 2.74
HSF4-224	ENST00000523562	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.18	■■■□□ 2.74
HSF4-224	ENST00000523562	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.16	■■■□□ 2.74
HSF4-224	ENST00000523562	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
HSF4-224	ENST00000523562	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.15	■■■□□ 2.74
HSF4-224	ENST00000523562	KIF1B	O60333	1816 aa		32.15	■■■□□ 2.74
HSF4-224	ENST00000523562	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.14	■■■□□ 2.73
HSF4-224	ENST00000523562	NOS1	P29475	1434 aa		32.12	■■■□□ 2.73
HSF4-224	ENST00000523562	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
HSF4-224	ENST00000523562	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.12	■■■□□ 2.73
HSF4-224	ENST00000523562	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.12	■■■□□ 2.73
HSF4-224	ENST00000523562	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.11	■■■□□ 2.73
HSF4-224	ENST00000523562	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.09	■■■□□ 2.73
HSF4-224	ENST00000523562	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.08	■■■□□ 2.73
HSF4-224	ENST00000523562	SYNM	O15061	1565 aa		32.08	■■■□□ 2.73
HSF4-224	ENST00000523562	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.03	■■■□□ 2.72
HSF4-224	ENST00000523562	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.02	■■■□□ 2.72
HSF4-224	ENST00000523562	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32	■■■□□ 2.71
HSF4-224	ENST00000523562	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
HSF4-224	ENST00000523562	ADGRB3	O60242	1522 aa		32	■■■□□ 2.71
HSF4-224	ENST00000523562	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		31.99	■■■□□ 2.71
HSF4-224	ENST00000523562	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.98	■■■□□ 2.71
HSF4-224	ENST00000523562	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
HSF4-224	ENST00000523562	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		31.98	■■■□□ 2.71
HSF4-224	ENST00000523562	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.96	■■■□□ 2.71
HSF4-224	ENST00000523562	STAC3	Q96MF2	364 aa		31.96	■■■□□ 2.71
HSF4-224	ENST00000523562	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		31.95	■■■□□ 2.71
HSF4-224	ENST00000523562	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.94	■■■□□ 2.7
HSF4-224	ENST00000523562	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		31.91	■■■□□ 2.7
HSF4-224	ENST00000523562	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.91	■■■□□ 2.7
HSF4-224	ENST00000523562	IDI1	Q13907	227 aa		31.91	■■■□□ 2.7
HSF4-224	ENST00000523562	IFT172	Q9UG01	1749 aa		31.91	■■■□□ 2.7
HSF4-224	ENST00000523562	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.89	■■■□□ 2.7
HSF4-224	ENST00000523562	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
HSF4-224	ENST00000523562	MYOM2	P54296	1465 aa		31.86	■■■□□ 2.69
HSF4-224	ENST00000523562	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
HSF4-224	ENST00000523562	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
HSF4-224	ENST00000523562	PPL	O60437	1756 aa		31.85	■■■□□ 2.69
HSF4-224	ENST00000523562	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		31.84	■■■□□ 2.69
HSF4-224	ENST00000523562	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.84	■■■□□ 2.69
HSF4-224	ENST00000523562	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.83	■■■□□ 2.69
HSF4-224	ENST00000523562	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		31.83	■■■□□ 2.69
HSF4-224	ENST00000523562	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
HSF4-224	ENST00000523562	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		31.8	■■■□□ 2.68
HSF4-224	ENST00000523562	C3	P01024	1663 aa		31.8	■■■□□ 2.68
HSF4-224	ENST00000523562	TNR	Q92752	1358 aa		31.79	■■■□□ 2.68
HSF4-224	ENST00000523562	USP47	Q96K76	1375 aa		31.79	■■■□□ 2.68

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