RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523270.1

CNOT8-223, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, human

TSL 4

Gene CNOT8, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT8-223	ENST00000523270	KIF15	Q9NS87	1388 aa		31.76	■■■□□ 2.67
CNOT8-223	ENST00000523270	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		31.74	■■■□□ 2.67
CNOT8-223	ENST00000523270	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		31.74	■■■□□ 2.67
CNOT8-223	ENST00000523270	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		31.73	■■■□□ 2.67
CNOT8-223	ENST00000523270	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.72	■■■□□ 2.67
CNOT8-223	ENST00000523270	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		31.71	■■■□□ 2.67
CNOT8-223	ENST00000523270	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.69	■■■□□ 2.66
CNOT8-223	ENST00000523270	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.69	■■■□□ 2.66
CNOT8-223	ENST00000523270	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.69	■■■□□ 2.66
CNOT8-223	ENST00000523270	NPAT	Q14207	1427 aa		31.68	■■■□□ 2.66
CNOT8-223	ENST00000523270	ADGRL2	O95490	1459 aa		31.67	■■■□□ 2.66
CNOT8-223	ENST00000523270	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.66	■■■□□ 2.66
CNOT8-223	ENST00000523270	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		31.66	■■■□□ 2.66
CNOT8-223	ENST00000523270	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		31.65	■■■□□ 2.66
CNOT8-223	ENST00000523270	CEP152	O94986	1710 aa		31.64	■■■□□ 2.66
CNOT8-223	ENST00000523270	ABCC3	O15438	1527 aa		31.64	■■■□□ 2.66
CNOT8-223	ENST00000523270	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.63	■■■□□ 2.65
CNOT8-223	ENST00000523270	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		31.62	■■■□□ 2.65
CNOT8-223	ENST00000523270	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
CNOT8-223	ENST00000523270	DEPDC5	O75140	1603 aa		31.6	■■■□□ 2.65
CNOT8-223	ENST00000523270	PZP	P20742	1482 aa		31.59	■■■□□ 2.65
CNOT8-223	ENST00000523270	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
CNOT8-223	ENST00000523270	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
CNOT8-223	ENST00000523270	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.56	■■■□□ 2.64
CNOT8-223	ENST00000523270	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
CNOT8-223	ENST00000523270	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.55	■■■□□ 2.64
CNOT8-223	ENST00000523270	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.51	■■■□□ 2.64
CNOT8-223	ENST00000523270	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.64
CNOT8-223	ENST00000523270	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	31.51	■■■□□ 2.63
CNOT8-223	ENST00000523270	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
CNOT8-223	ENST00000523270	ITGAE	P38570	1179 aa		31.48	■■■□□ 2.63
CNOT8-223	ENST00000523270	TNR	Q92752	1358 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CNOT8-223	ENST00000523270	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	31.47	■■■□□ 2.63
CNOT8-223	ENST00000523270	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CNOT8-223	ENST00000523270	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CNOT8-223	ENST00000523270	ROCK1	Q13464	1354 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CNOT8-223	ENST00000523270	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CNOT8-223	ENST00000523270	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CNOT8-223	ENST00000523270	ERVK-7	P63135	1459 aa		31.42	■■■□□ 2.62
CNOT8-223	ENST00000523270	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		31.39	■■■□□ 2.61
CNOT8-223	ENST00000523270	KANK1	Q14678	1352 aa		31.37	■■■□□ 2.61
CNOT8-223	ENST00000523270	UNC13B	O14795	1591 aa		31.36	■■■□□ 2.61
CNOT8-223	ENST00000523270	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		31.36	■■■□□ 2.61
CNOT8-223	ENST00000523270	NLRP1	Q9C000	1473 aa		31.33	■■■□□ 2.61
CNOT8-223	ENST00000523270	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		31.32	■■■□□ 2.6
CNOT8-223	ENST00000523270	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.32	■■■□□ 2.6
CNOT8-223	ENST00000523270	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.29	■■■□□ 2.6
CNOT8-223	ENST00000523270	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		31.27	■■■□□ 2.6
CNOT8-223	ENST00000523270	PTPRT	O14522	1441 aa		31.27	■■■□□ 2.6
CNOT8-223	ENST00000523270	TET3	O43151	1660 aa		31.25	■■■□□ 2.59
CNOT8-223	ENST00000523270	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
CNOT8-223	ENST00000523270	SYNM	O15061	1565 aa		31.23	■■■□□ 2.59
CNOT8-223	ENST00000523270	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		31.23	■■■□□ 2.59
CNOT8-223	ENST00000523270	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		31.22	■■■□□ 2.59
CNOT8-223	ENST00000523270	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.22	■■■□□ 2.59
CNOT8-223	ENST00000523270	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		31.22	■■■□□ 2.59
CNOT8-223	ENST00000523270	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		31.21	■■■□□ 2.59
CNOT8-223	ENST00000523270	NAIP	Q13075	1403 aa		31.19	■■■□□ 2.58
CNOT8-223	ENST00000523270	PIK3C2B	O00750	1634 aa		31.19	■■■□□ 2.58
CNOT8-223	ENST00000523270	NOS1	P29475	1434 aa		31.17	■■■□□ 2.58
CNOT8-223	ENST00000523270		E9PCH4	1651 aa		31.17	■■■□□ 2.58
CNOT8-223	ENST00000523270	PKD2	Q13563	968 aa		31.17	■■■□□ 2.58
CNOT8-223	ENST00000523270	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.57
CNOT8-223	ENST00000523270	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
CNOT8-223	ENST00000523270	NUP155	O75694	1391 aa		31.13	■■■□□ 2.57
CNOT8-223	ENST00000523270	HFM1	A2PYH4	1435 aa		31.1	■■■□□ 2.57
CNOT8-223	ENST00000523270	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
CNOT8-223	ENST00000523270	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.09	■■■□□ 2.57
CNOT8-223	ENST00000523270	IDI1	Q13907	227 aa		31.07	■■■□□ 2.56
CNOT8-223	ENST00000523270	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CNOT8-223	ENST00000523270	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
CNOT8-223	ENST00000523270	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		31.04	■■■□□ 2.56
CNOT8-223	ENST00000523270	SLIT1	O75093	1534 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CNOT8-223	ENST00000523270	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CNOT8-223	ENST00000523270	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CNOT8-223	ENST00000523270	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CNOT8-223	ENST00000523270	MED14	O60244	1454 aa		31.02	■■■□□ 2.56
CNOT8-223	ENST00000523270	IQGAP1	P46940	1657 aa		31.02	■■■□□ 2.56
CNOT8-223	ENST00000523270	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.56
CNOT8-223	ENST00000523270	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.55
CNOT8-223	ENST00000523270	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	30.97	■■■□□ 2.55
CNOT8-223	ENST00000523270	LTK	P29376	864 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CNOT8-223	ENST00000523270	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		30.95	■■■□□ 2.55
CNOT8-223	ENST00000523270	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		30.95	■■■□□ 2.55
CNOT8-223	ENST00000523270	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		30.95	■■■□□ 2.54
CNOT8-223	ENST00000523270	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		30.94	■■■□□ 2.54
CNOT8-223	ENST00000523270	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		30.94	■■■□□ 2.54
CNOT8-223	ENST00000523270	FBXO41	Q8TF61	875 aa		30.93	■■■□□ 2.54
CNOT8-223	ENST00000523270	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		30.9	■■■□□ 2.54
CNOT8-223	ENST00000523270	TRIM52	Q96A61	297 aa		30.87	■■■□□ 2.53
CNOT8-223	ENST00000523270	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		30.87	■■■□□ 2.53
CNOT8-223	ENST00000523270	ZFYVE9	O95405	1425 aa		30.83	■■■□□ 2.53
CNOT8-223	ENST00000523270	EID1	Q9Y6B2	187 aa		30.83	■■■□□ 2.53
CNOT8-223	ENST00000523270	CLTCL1	P53675	1640 aa		30.81	■■■□□ 2.52
CNOT8-223	ENST00000523270	TRPM2	O94759	1503 aa		30.8	■■■□□ 2.52
CNOT8-223	ENST00000523270	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	30.8	■■■□□ 2.52
CNOT8-223	ENST00000523270	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		30.79	■■■□□ 2.52
CNOT8-223	ENST00000523270	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		30.79	■■■□□ 2.52
CNOT8-223	ENST00000523270	CPS1	P31327	1500 aa		30.77	■■■□□ 2.52
CNOT8-223	ENST00000523270	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		30.75	■■■□□ 2.51

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