RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522635.5

TCEA1-211, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TCEA1, Length 1,432 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-211ENST00000522635 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.88■■■■□ 3.17
TCEA1-211ENST00000522635 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
TCEA1-211ENST00000522635 KIF3BO15066 747 aa34.87■■■■□ 3.17
TCEA1-211ENST00000522635 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
TCEA1-211ENST00000522635 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.87■■■■□ 3.17
TCEA1-211ENST00000522635 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.8■■■■□ 3.16
TCEA1-211ENST00000522635 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.8■■■■□ 3.16
TCEA1-211ENST00000522635 NUP155O75694 1391 aa34.78■■■■□ 3.16
TCEA1-211ENST00000522635 TRIM52Q96A61 297 aa34.78■■■■□ 3.16
TCEA1-211ENST00000522635 PZPP20742 1482 aa34.77■■■■□ 3.16
TCEA1-211ENST00000522635 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.75■■■■□ 3.15
TCEA1-211ENST00000522635 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.72■■■■□ 3.153e-7■■■■□ 23.7
TCEA1-211ENST00000522635 KANK1Q14678 1352 aa34.71■■■■□ 3.15
TCEA1-211ENST00000522635 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
TCEA1-211ENST00000522635 GGT6Q6P531 493 aa34.71■■■■□ 3.15
TCEA1-211ENST00000522635 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
TCEA1-211ENST00000522635 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
TCEA1-211ENST00000522635 ABCC3O15438 1527 aa34.67■■■■□ 3.14
TCEA1-211ENST00000522635 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.67■■■■□ 3.14
TCEA1-211ENST00000522635 CEP152O94986 1710 aa34.67■■■■□ 3.14
TCEA1-211ENST00000522635 TET3O43151 1660 aa34.65■■■■□ 3.14
TCEA1-211ENST00000522635 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.64■■■■□ 3.14
TCEA1-211ENST00000522635 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
TCEA1-211ENST00000522635 MLECQ14165 292 aa34.6■■■■□ 3.13
TCEA1-211ENST00000522635 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.6■■■■□ 3.13
TCEA1-211ENST00000522635 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.6■■■■□ 3.13
TCEA1-211ENST00000522635 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.57■■■■□ 3.13
TCEA1-211ENST00000522635 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.57■■■■□ 3.12
TCEA1-211ENST00000522635 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
TCEA1-211ENST00000522635 E9PCH4 1651 aa34.54■■■■□ 3.12
TCEA1-211ENST00000522635 PKD2Q13563 968 aa34.52■■■■□ 3.12
TCEA1-211ENST00000522635 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.51■■■■□ 3.11
TCEA1-211ENST00000522635 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
TCEA1-211ENST00000522635 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.48■■■■□ 3.11
TCEA1-211ENST00000522635 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.48■■■■□ 3.11
TCEA1-211ENST00000522635 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.47■■■■□ 3.11
TCEA1-211ENST00000522635 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
TCEA1-211ENST00000522635 MROH2AA6NES4 1674 aa34.46■■■■□ 3.11
TCEA1-211ENST00000522635 NPATQ14207 1427 aa34.46■■■■□ 3.11
TCEA1-211ENST00000522635 MADDQ8WXG6 1647 aa34.45■■■■□ 3.11
TCEA1-211ENST00000522635 FOXD1Q16676 465 aa34.45■■■■□ 3.11
TCEA1-211ENST00000522635 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
TCEA1-211ENST00000522635 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.4■■■■□ 3.1
TCEA1-211ENST00000522635 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.39■■■■□ 3.1
TCEA1-211ENST00000522635 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.38■■■■□ 3.09
TCEA1-211ENST00000522635 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
TCEA1-211ENST00000522635 PLA2R1Q13018 1463 aa34.36■■■■□ 3.09
TCEA1-211ENST00000522635 PTPRTO14522 1441 aa34.35■■■■□ 3.09
TCEA1-211ENST00000522635 TRPM2O94759 1503 aa34.34■■■■□ 3.09
TCEA1-211ENST00000522635 ZMYM3Q14202 1370 aa34.34■■■■□ 3.09
TCEA1-211ENST00000522635 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.33■■■■□ 3.09
TCEA1-211ENST00000522635 C3P01024 1663 aa34.31■■■■□ 3.08
TCEA1-211ENST00000522635 NOS1P29475 1434 aa34.3■■■■□ 3.08
TCEA1-211ENST00000522635 ERVK-7P63135 1459 aa34.3■■■■□ 3.08
TCEA1-211ENST00000522635 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.28■■■■□ 3.08
TCEA1-211ENST00000522635 SYNMO15061 1565 aa34.26■■■■□ 3.07
TCEA1-211ENST00000522635 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
TCEA1-211ENST00000522635 CLTCL1P53675 1640 aa34.22■■■■□ 3.07
TCEA1-211ENST00000522635 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.22■■■■□ 3.07
TCEA1-211ENST00000522635 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
TCEA1-211ENST00000522635 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.2■■■■□ 3.07
TCEA1-211ENST00000522635 PIK3C2BO00750 1634 aa34.2■■■■□ 3.06
TCEA1-211ENST00000522635 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.19■■■■□ 3.06
TCEA1-211ENST00000522635 PTPRMP28827 1452 aa34.16■■■■□ 3.06
TCEA1-211ENST00000522635 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
TCEA1-211ENST00000522635 TNRQ92752 1358 aa34.12■■■■□ 3.05
TCEA1-211ENST00000522635 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.09■■■■□ 3.05
TCEA1-211ENST00000522635 NEUROD1Q13562 356 aa34.09■■■■□ 3.05
TCEA1-211ENST00000522635 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.07■■■■□ 3.04
TCEA1-211ENST00000522635 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.06■■■■□ 3.04
TCEA1-211ENST00000522635 KIF1BO60333 1816 aa34.05■■■■□ 3.04
TCEA1-211ENST00000522635 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.04■■■■□ 3.04
TCEA1-211ENST00000522635 ADGRB3O60242 1522 aa34.04■■■■□ 3.04
TCEA1-211ENST00000522635 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.04■■■■□ 3.04
TCEA1-211ENST00000522635 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.02■■■■□ 3.04
TCEA1-211ENST00000522635 NLRP1Q9C000 1473 aa34.01■■■■□ 3.04
TCEA1-211ENST00000522635 IDI1Q13907 227 aa34.01■■■■□ 3.03
TCEA1-211ENST00000522635 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.98■■■■□ 3.03
TCEA1-211ENST00000522635 TONSLQ96HA7 1378 aa33.97■■■■□ 3.03
TCEA1-211ENST00000522635 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
TCEA1-211ENST00000522635 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa33.93■■■■□ 3.02
TCEA1-211ENST00000522635 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
TCEA1-211ENST00000522635 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.91■■■■□ 3.02
TCEA1-211ENST00000522635 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.9■■■■□ 3.02
TCEA1-211ENST00000522635 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
TCEA1-211ENST00000522635 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.89■■■■□ 3.02
TCEA1-211ENST00000522635 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
TCEA1-211ENST00000522635 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
TCEA1-211ENST00000522635 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
TCEA1-211ENST00000522635 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.87■■■■□ 3.01
TCEA1-211ENST00000522635 RGL3Q3MIN7 710 aa33.86■■■■□ 3.01
TCEA1-211ENST00000522635 IFT172Q9UG01 1749 aa33.85■■■■□ 3.01
TCEA1-211ENST00000522635 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa33.81■■■■□ 3
TCEA1-211ENST00000522635 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.81■■■■□ 3
TCEA1-211ENST00000522635 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.81■■■■□ 3
TCEA1-211ENST00000522635 PPLO60437 1756 aa33.81■■■■□ 3
TCEA1-211ENST00000522635 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
TCEA1-211ENST00000522635 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa33.77■■■■□ 3
TCEA1-211ENST00000522635 MYOM2P54296 1465 aa33.76■■■□□ 2.99
TCEA1-211ENST00000522635 DCAF11Q8TEB1 546 aa33.74■■■□□ 2.99
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