RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521404.5

MEG3-217, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-217ENST00000521404 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.42■■□□□ 1.5
MEG3-217ENST00000521404 ABCC5O15440 1437 aa24.41■■□□□ 1.5
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MEG3-217ENST00000521404 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.39■■□□□ 1.49
MEG3-217ENST00000521404 DAPK1P53355 1430 aa24.37■■□□□ 1.49
MEG3-217ENST00000521404 STRCQ7RTU9 1775 aa24.36■■□□□ 1.49
MEG3-217ENST00000521404 PTPRTO14522 1441 aa24.36■■□□□ 1.49
MEG3-217ENST00000521404 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
MEG3-217ENST00000521404 PZPP20742 1482 aa24.35■■□□□ 1.49
MEG3-217ENST00000521404 FBXO41Q8TF61 875 aa24.35■■□□□ 1.49
MEG3-217ENST00000521404 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
MEG3-217ENST00000521404 NCOA1Q15788 1441 aa24.34■■□□□ 1.49
MEG3-217ENST00000521404 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.33■■□□□ 1.49
MEG3-217ENST00000521404 KIF15Q9NS87 1388 aa24.33■■□□□ 1.49
MEG3-217ENST00000521404 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.33■■□□□ 1.49
MEG3-217ENST00000521404 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
MEG3-217ENST00000521404 ERBINQ96RT1 1412 aa24.32■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 PLA2R1Q13018 1463 aa24.31■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.3■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 TNRQ92752 1358 aa24.3■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.29■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.29■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.29■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 PKD2Q13563 968 aa24.28■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 ABCC3O15438 1527 aa24.28■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 CERKQ8TCT0 537 aa24.27■■□□□ 1.48
MEG3-217ENST00000521404 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.25■■□□□ 1.47
MEG3-217ENST00000521404 NLRP1Q9C000 1473 aa24.24■■□□□ 1.47
MEG3-217ENST00000521404 ADGRL2O95490 1459 aa24.22■■□□□ 1.47
MEG3-217ENST00000521404 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
MEG3-217ENST00000521404 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.22■■□□□ 1.47
MEG3-217ENST00000521404 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.19■■□□□ 1.46
MEG3-217ENST00000521404 KANK1Q14678 1352 aa24.18■■□□□ 1.46
MEG3-217ENST00000521404 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.18■■□□□ 1.46
MEG3-217ENST00000521404 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.18■■□□□ 1.46
MEG3-217ENST00000521404 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
MEG3-217ENST00000521404 DEPDC5O75140 1603 aa24.17■■□□□ 1.46
MEG3-217ENST00000521404 ERVK-7P63135 1459 aa24.16■■□□□ 1.46
MEG3-217ENST00000521404 ITGAEP38570 1179 aa24.13■■□□□ 1.45
MEG3-217ENST00000521404 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
MEG3-217ENST00000521404 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.13■■□□□ 1.45
MEG3-217ENST00000521404 CEP152O94986 1710 aa24.13■■□□□ 1.45
MEG3-217ENST00000521404 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
MEG3-217ENST00000521404 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.11■■□□□ 1.45
MEG3-217ENST00000521404 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.11■■□□□ 1.45
MEG3-217ENST00000521404 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.1■■□□□ 1.45
MEG3-217ENST00000521404 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.1■■□□□ 1.45
MEG3-217ENST00000521404 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.1■■□□□ 1.45
MEG3-217ENST00000521404 ROCK1Q13464 1354 aa24.09■■□□□ 1.45
MEG3-217ENST00000521404 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.08■■□□□ 1.45
MEG3-217ENST00000521404 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
MEG3-217ENST00000521404 MED14O60244 1454 aa24.04■■□□□ 1.44
MEG3-217ENST00000521404 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
MEG3-217ENST00000521404 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.03■■□□□ 1.44
MEG3-217ENST00000521404 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
MEG3-217ENST00000521404 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.99■■□□□ 1.43
MEG3-217ENST00000521404 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
MEG3-217ENST00000521404 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
MEG3-217ENST00000521404 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.97■■□□□ 1.43
MEG3-217ENST00000521404 NOS1P29475 1434 aa23.96■■□□□ 1.43
MEG3-217ENST00000521404 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.95■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.94■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 SLIT1O75093 1534 aa23.94■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 UNC13BO14795 1591 aa23.93■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 IDI1Q13907 227 aa23.92■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.92■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 CPS1P31327 1500 aa23.92■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 EID1Q9Y6B2 187 aa23.91■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 TET3O43151 1660 aa23.91■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 IQGAP1P46940 1657 aa23.9■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 PIK3C2BO00750 1634 aa23.9■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.89■■□□□ 1.42
MEG3-217ENST00000521404 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.89■■□□□ 1.41
MEG3-217ENST00000521404 SYNMO15061 1565 aa23.88■■□□□ 1.41
MEG3-217ENST00000521404 LTKP29376 864 aa23.86■■□□□ 1.41
MEG3-217ENST00000521404 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.85■■□□□ 1.41
MEG3-217ENST00000521404 NUP155O75694 1391 aa23.84■■□□□ 1.41
MEG3-217ENST00000521404 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.84■■□□□ 1.41
MEG3-217ENST00000521404 ADGRB3O60242 1522 aa23.82■■□□□ 1.4
MEG3-217ENST00000521404 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.81■■□□□ 1.4
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MEG3-217ENST00000521404 E9PCH4 1651 aa23.76■■□□□ 1.39
MEG3-217ENST00000521404 TOM1O60784 492 aa23.75■■□□□ 1.39
MEG3-217ENST00000521404 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
MEG3-217ENST00000521404 NAIPQ13075 1403 aa23.74■■□□□ 1.39
MEG3-217ENST00000521404 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.71■■□□□ 1.39
MEG3-217ENST00000521404 HFM1A2PYH4 1435 aa23.7■■□□□ 1.39
MEG3-217ENST00000521404 ZFYVE9O95405 1425 aa23.7■■□□□ 1.39
MEG3-217ENST00000521404 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
MEG3-217ENST00000521404 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.7■■□□□ 1.38
MEG3-217ENST00000521404 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.68■■□□□ 1.38
MEG3-217ENST00000521404 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.68■■□□□ 1.38
MEG3-217ENST00000521404 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.67■■□□□ 1.38
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