RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 CCDC141Q6ZP82 1450 aa7.4□□□□□ -1.22
CLVS1-205ENST00000519846 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.4□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa7.4□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa7.39□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 PREX2Q70Z35 1606 aa7.39□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7.39□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.39□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 ABCC1P33527 1531 aa7.39□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 A2MP01023 1474 aa7.38□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa7.38□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.38□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 MIA2Q96PC5 1412 aa7.37□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 KANK1Q14678 1352 aa7.37□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.37□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 MAGI2Q86UL8 1455 aa7.36□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 ATP7AQ04656 1500 aa7.36□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 ABCC5O15440 1437 aa7.36□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 DAPK1P53355 1430 aa7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 HECW2Q9P2P5 1572 aa7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 MAP3K1Q13233 1512 aa7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 MBD5Q9P267 1494 aa7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 MLH3Q9UHC1 1453 aa7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.35□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 NUP155O75694 1391 aa7.34□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 PTPRMP28827 1452 aa7.34□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 ZMYM3Q14202 1370 aa7.34□□□□□ -1.23
CLVS1-205ENST00000519846 RICTORQ6R327 1708 aa7.34□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 MADDQ8WXG6 1647 aa7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 ABCA6Q8N139 1617 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 MYT1Q01538 1121 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 PCGF6Q9BYE7 350 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 RGL3Q3MIN7 710 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 PTPRKQ15262 1439 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 KDM5CP41229 1560 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 NCOA1Q15788 1441 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 TNRQ92752 1358 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 EID1Q9Y6B2 187 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-205ENST00000519846 C14orf37Q86TY3 774 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 MSH5O43196 834 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 BCORL1Q5H9F3 1711 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 IDI1Q13907 227 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 ARHGEF5Q12774 1597 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 DUOX2Q9NRD8 1548 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 NEUROD1Q13562 356 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 RGL2O15211 777 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 AGLP35573 1532 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 ERBINQ96RT1 1412 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 PIP4K2BP78356 416 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 SETD5Q9C0A6 1442 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 ROCK1Q13464 1354 aa7.21□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 NAIPQ13075 1403 aa7.21□□□□□ -1.25
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CLVS1-205ENST00000519846 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.21□□□□□ -1.26
CLVS1-205ENST00000519846 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.21□□□□□ -1.26
CLVS1-205ENST00000519846 CFAP44Q96MT7 982 aa7.2□□□□□ -1.26
CLVS1-205ENST00000519846 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9 ms