RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 KIF15Q9NS87 1388 aa39.5■■■■□ 3.91
TCEA1-202ENST00000517351 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.49■■■■□ 3.91
TCEA1-202ENST00000517351 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
TCEA1-202ENST00000517351 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.48■■■■□ 3.91
TCEA1-202ENST00000517351 NPATQ14207 1427 aa39.48■■■■□ 3.91
TCEA1-202ENST00000517351 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.46■■■■□ 3.91
TCEA1-202ENST00000517351 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.45■■■■□ 3.91
TCEA1-202ENST00000517351 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
TCEA1-202ENST00000517351 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.44■■■■□ 3.9
TCEA1-202ENST00000517351 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa39.43■■■■□ 3.9
TCEA1-202ENST00000517351 PTPRKQ15262 1439 aa39.4■■■■□ 3.9
TCEA1-202ENST00000517351 ERBINQ96RT1 1412 aa39.4■■■■□ 3.9
TCEA1-202ENST00000517351 NCOA1Q15788 1441 aa39.37■■■■□ 3.89
TCEA1-202ENST00000517351 ADGRL2O95490 1459 aa39.35■■■■□ 3.89
TCEA1-202ENST00000517351 MROH1Q8NDA8 1641 aa39.33■■■■□ 3.89
TCEA1-202ENST00000517351 PZPP20742 1482 aa39.3■■■■□ 3.88
TCEA1-202ENST00000517351 ABCC3O15438 1527 aa39.3■■■■□ 3.88
TCEA1-202ENST00000517351 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
TCEA1-202ENST00000517351 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.26■■■■□ 3.88
TCEA1-202ENST00000517351 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
TCEA1-202ENST00000517351 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.23■■■■□ 3.87
TCEA1-202ENST00000517351 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
TCEA1-202ENST00000517351 CEP152O94986 1710 aa39.22■■■■□ 3.87
TCEA1-202ENST00000517351 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.2■■■■□ 3.871e-7■■■■□ 24.6
TCEA1-202ENST00000517351 DEPDC5O75140 1603 aa39.2■■■■□ 3.87
TCEA1-202ENST00000517351 TNRQ92752 1358 aa39.2■■■■□ 3.87
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
TCEA1-202ENST00000517351 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
TCEA1-202ENST00000517351 ITGAEP38570 1179 aa39.17■■■■□ 3.86
TCEA1-202ENST00000517351 STRCQ7RTU9 1775 aa39.16■■■■□ 3.86
TCEA1-202ENST00000517351 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.15■■■■□ 3.86
TCEA1-202ENST00000517351 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.15■■■■□ 3.86
TCEA1-202ENST00000517351 KANK1Q14678 1352 aa39.15■■■■□ 3.86
TCEA1-202ENST00000517351 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
TCEA1-202ENST00000517351 ROCK1Q13464 1354 aa39.12■■■■□ 3.85
TCEA1-202ENST00000517351 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.11■■■■□ 3.85
TCEA1-202ENST00000517351 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.08■■■■□ 3.85
TCEA1-202ENST00000517351 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.06■■■■□ 3.84
TCEA1-202ENST00000517351 ERVK-7P63135 1459 aa39.05■■■■□ 3.84
TCEA1-202ENST00000517351 VWDEQ8N2E2 1590 aa39.04■■■■□ 3.84
TCEA1-202ENST00000517351 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa39.04■■■■□ 3.84
TCEA1-202ENST00000517351 NLRP1Q9C000 1473 aa39.03■■■■□ 3.84
TCEA1-202ENST00000517351 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP39.02■■■■□ 3.84
TCEA1-202ENST00000517351 LMTK2Q8IWU2 1503 aa39.01■■■■□ 3.84
TCEA1-202ENST00000517351 PLA2R1Q13018 1463 aa39■■■■□ 3.83
TCEA1-202ENST00000517351 PTPRTO14522 1441 aa38.97■■■■□ 3.83
TCEA1-202ENST00000517351 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa38.95■■■■□ 3.83
TCEA1-202ENST00000517351 UGGT1Q9NYU2 1555 aa38.92■■■■□ 3.82
TCEA1-202ENST00000517351 PKD2Q13563 968 aa38.92■■■■□ 3.82
TCEA1-202ENST00000517351 UNC13BO14795 1591 aa38.91■■■■□ 3.82
TCEA1-202ENST00000517351 EFCAB6Q5THR3 1501 aa38.89■■■■□ 3.82
TCEA1-202ENST00000517351 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
TCEA1-202ENST00000517351 TET3O43151 1660 aa38.81■■■■□ 3.8
TCEA1-202ENST00000517351 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
TCEA1-202ENST00000517351 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
TCEA1-202ENST00000517351 ANKLE2Q86XL3 938 aa38.77■■■■□ 3.8
TCEA1-202ENST00000517351 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
TCEA1-202ENST00000517351 NUP155O75694 1391 aa38.76■■■■□ 3.8
TCEA1-202ENST00000517351 NOS1P29475 1434 aa38.76■■■■□ 3.8
TCEA1-202ENST00000517351 UBR1Q8IWV7 1749 aa38.75■■■■□ 3.79
TCEA1-202ENST00000517351 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.75■■■■□ 3.79
TCEA1-202ENST00000517351 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.75■■■■□ 3.79
TCEA1-202ENST00000517351 NAIPQ13075 1403 aa38.73■■■■□ 3.79
TCEA1-202ENST00000517351 CERKQ8TCT0 537 aa38.73■■■■□ 3.79
TCEA1-202ENST00000517351 SYNMO15061 1565 aa38.73■■■■□ 3.79
TCEA1-202ENST00000517351 NEURL4Q96JN8 1562 aa38.72■■■■□ 3.79
TCEA1-202ENST00000517351 PIK3C2BO00750 1634 aa38.71■■■■□ 3.79
TCEA1-202ENST00000517351 IDI1Q13907 227 aa38.69■■■■□ 3.78
TCEA1-202ENST00000517351 STAG3Q9UJ98 1225 aa38.67■■■■□ 3.78
TCEA1-202ENST00000517351 E9PCH4 1651 aa38.65■■■■□ 3.78
TCEA1-202ENST00000517351 HFM1A2PYH4 1435 aa38.65■■■■□ 3.78
TCEA1-202ENST00000517351 FBXO41Q8TF61 875 aa38.65■■■■□ 3.78
TCEA1-202ENST00000517351 SLC52A1Q9NWF4 448 aa38.64■■■■□ 3.78
TCEA1-202ENST00000517351 LTBP4Q8N2S1 1624 aa38.63■■■■□ 3.77
TCEA1-202ENST00000517351 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
TCEA1-202ENST00000517351 MED14O60244 1454 aa38.61■■■■□ 3.77
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
TCEA1-202ENST00000517351 ARHGAP23Q9P227 1491 aa38.6■■■■□ 3.77
TCEA1-202ENST00000517351 SLIT1O75093 1534 aa38.59■■■■□ 3.77
TCEA1-202ENST00000517351 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
TCEA1-202ENST00000517351 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
TCEA1-202ENST00000517351 ADGRB3O60242 1522 aa38.55■■■■□ 3.76
TCEA1-202ENST00000517351 TXNDC2Q86VQ3 553 aa38.54■■■■□ 3.76
TCEA1-202ENST00000517351 IQGAP1P46940 1657 aa38.54■■■■□ 3.76
TCEA1-202ENST00000517351 TMEM2Q9UHN6 1383 aa38.54■■■■□ 3.76
TCEA1-202ENST00000517351 LTKP29376 864 aa38.52■■■■□ 3.76
TCEA1-202ENST00000517351 EID1Q9Y6B2 187 aa38.52■■■■□ 3.76
TCEA1-202ENST00000517351 TRIM52Q96A61 297 aa38.49■■■■□ 3.75
TCEA1-202ENST00000517351 CHGAP10645 457 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
TCEA1-202ENST00000517351 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa38.41■■■■□ 3.74
TCEA1-202ENST00000517351 MYO5BQ9ULV0 1848 aa38.4■■■■□ 3.74
TCEA1-202ENST00000517351 IQSEC2Q5JU85 1478 aa38.4■■■■□ 3.74
TCEA1-202ENST00000517351 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa38.39■■■■□ 3.74
TCEA1-202ENST00000517351 CPS1P31327 1500 aa38.34■■■■□ 3.73
TCEA1-202ENST00000517351 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
TCEA1-202ENST00000517351 ZFYVE9O95405 1425 aa38.31■■■■□ 3.72
TCEA1-202ENST00000517351 RIMS2Q9UQ26 1411 aa38.31■■■■□ 3.72
TCEA1-202ENST00000517351 HDGFP51858 240 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
TCEA1-202ENST00000517351 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
TCEA1-202ENST00000517351 TRPM2O94759 1503 aa38.25■■■■□ 3.71
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