RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514596.1

CTBP1-215, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 2

Gene CTBP1, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-215	ENST00000514596	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CTBP1-215	ENST00000514596	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CTBP1-215	ENST00000514596	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
CTBP1-215	ENST00000514596	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CTBP1-215	ENST00000514596	MIA2	Q96PC5	1412 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CTBP1-215	ENST00000514596	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
CTBP1-215	ENST00000514596	CPS1	P31327	1500 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CTBP1-215	ENST00000514596	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
CTBP1-215	ENST00000514596	TOM1	O60784	492 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CTBP1-215	ENST00000514596	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CTBP1-215	ENST00000514596	HSPA1L	P34931	641 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP1-215	ENST00000514596	PIP4K2B	P78356	416 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-215	ENST00000514596	MBD5	Q9P267	1494 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CTBP1-215	ENST00000514596	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP1-215	ENST00000514596	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		29	■■■□□ 2.23
CTBP1-215	ENST00000514596	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		29	■■■□□ 2.23
CTBP1-215	ENST00000514596	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CTBP1-215	ENST00000514596	TNR	Q92752	1358 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CTBP1-215	ENST00000514596	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.98	■■■□□ 2.23
CTBP1-215	ENST00000514596	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.98	■■■□□ 2.23
CTBP1-215	ENST00000514596	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.97	■■■□□ 2.23
CTBP1-215	ENST00000514596	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.95	■■■□□ 2.23
CTBP1-215	ENST00000514596	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
CTBP1-215	ENST00000514596	PZP	P20742	1482 aa		28.94	■■■□□ 2.22
CTBP1-215	ENST00000514596	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		28.94	■■■□□ 2.22
CTBP1-215	ENST00000514596	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.93	■■■□□ 2.22
CTBP1-215	ENST00000514596	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CTBP1-215	ENST00000514596	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
CTBP1-215	ENST00000514596	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
CTBP1-215	ENST00000514596	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CTBP1-215	ENST00000514596	KIF3B	O15066	747 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CTBP1-215	ENST00000514596	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
CTBP1-215	ENST00000514596	NLRP1	Q9C000	1473 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CTBP1-215	ENST00000514596	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.87	■■■□□ 2.21
CTBP1-215	ENST00000514596	DEPDC5	O75140	1603 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CTBP1-215	ENST00000514596	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CTBP1-215	ENST00000514596	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
CTBP1-215	ENST00000514596	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP1-215	ENST00000514596	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP1-215	ENST00000514596	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP1-215	ENST00000514596	MED14	O60244	1454 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP1-215	ENST00000514596	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CTBP1-215	ENST00000514596	ALK	Q9UM73	1620 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CTBP1-215	ENST00000514596	TSPY4	P0CV99	314 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CTBP1-215	ENST00000514596	TSPY10	P0CW01	314 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CTBP1-215	ENST00000514596	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
CTBP1-215	ENST00000514596	DAPK1	P53355	1430 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CTBP1-215	ENST00000514596	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
CTBP1-215	ENST00000514596	ABCC5	O15440	1437 aa		28.75	■■■□□ 2.19
CTBP1-215	ENST00000514596	SYNM	O15061	1565 aa		28.75	■■■□□ 2.19
CTBP1-215	ENST00000514596	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CTBP1-215	ENST00000514596	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
CTBP1-215	ENST00000514596	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CTBP1-215	ENST00000514596	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
CTBP1-215	ENST00000514596	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
CTBP1-215	ENST00000514596	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
CTBP1-215	ENST00000514596	ABCC3	O15438	1527 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTBP1-215	ENST00000514596	ADGRL2	O95490	1459 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTBP1-215	ENST00000514596	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTBP1-215	ENST00000514596	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CTBP1-215	ENST00000514596	ERVK-7	P63135	1459 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTBP1-215	ENST00000514596	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTBP1-215	ENST00000514596	KIF15	Q9NS87	1388 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTBP1-215	ENST00000514596	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
CTBP1-215	ENST00000514596	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CTBP1-215	ENST00000514596	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CTBP1-215	ENST00000514596	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.51	■■■□□ 2.15
CTBP1-215	ENST00000514596	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
CTBP1-215	ENST00000514596	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.49	■■■□□ 2.15
CTBP1-215	ENST00000514596	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28.48	■■■□□ 2.15
CTBP1-215	ENST00000514596	CEP152	O94986	1710 aa		28.48	■■■□□ 2.15
CTBP1-215	ENST00000514596	SLIT1	O75093	1534 aa		28.48	■■■□□ 2.15
CTBP1-215	ENST00000514596	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		28.47	■■■□□ 2.15
CTBP1-215	ENST00000514596	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.46	■■■□□ 2.15
CTBP1-215	ENST00000514596	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
CTBP1-215	ENST00000514596	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		28.46	■■■□□ 2.15
CTBP1-215	ENST00000514596	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
CTBP1-215	ENST00000514596	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.44	■■■□□ 2.14
CTBP1-215	ENST00000514596	LTK	P29376	864 aa		28.43	■■■□□ 2.14
CTBP1-215	ENST00000514596	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		28.43	■■■□□ 2.14
CTBP1-215	ENST00000514596	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
CTBP1-215	ENST00000514596	ITGAE	P38570	1179 aa		28.39	■■■□□ 2.14
CTBP1-215	ENST00000514596	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.38	■■■□□ 2.13
CTBP1-215	ENST00000514596	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.38	■■■□□ 2.13
CTBP1-215	ENST00000514596	TMEM94	Q12767	1356 aa		28.33	■■■□□ 2.13
CTBP1-215	ENST00000514596	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.33	■■■□□ 2.13
CTBP1-215	ENST00000514596	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CTBP1-215	ENST00000514596	POTEA	Q6S8J7	498 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CTBP1-215	ENST00000514596	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CTBP1-215	ENST00000514596	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		28.31	■■■□□ 2.12
CTBP1-215	ENST00000514596	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.3	■■■□□ 2.12
CTBP1-215	ENST00000514596	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
CTBP1-215	ENST00000514596	UNC13B	O14795	1591 aa		28.28	■■■□□ 2.12
CTBP1-215	ENST00000514596	KANK1	Q14678	1352 aa		28.27	■■■□□ 2.12
CTBP1-215	ENST00000514596	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.27	■■■□□ 2.12
CTBP1-215	ENST00000514596	KCNA6	P17658	529 aa		28.26	■■■□□ 2.11
CTBP1-215	ENST00000514596	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
CTBP1-215	ENST00000514596	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.24	■■■□□ 2.11
CTBP1-215	ENST00000514596	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.23	■■■□□ 2.11

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