RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 POTEAQ6S8J7 498 aa25.87■■□□□ 1.73
ALYREF-204ENST00000512673 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
ALYREF-204ENST00000512673 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.85■■□□□ 1.73
ALYREF-204ENST00000512673 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
ALYREF-204ENST00000512673 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.81■■□□□ 1.72
ALYREF-204ENST00000512673 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
ALYREF-204ENST00000512673 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.8■■□□□ 1.72
ALYREF-204ENST00000512673 IQGAP1P46940 1657 aa25.79■■□□□ 1.72
ALYREF-204ENST00000512673 MED14O60244 1454 aa25.78■■□□□ 1.72
ALYREF-204ENST00000512673 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
ALYREF-204ENST00000512673 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.77■■□□□ 1.72
ALYREF-204ENST00000512673 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
ALYREF-204ENST00000512673 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.76■■□□□ 1.71
ALYREF-204ENST00000512673 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.76■■□□□ 1.71
ALYREF-204ENST00000512673 DEPDC5O75140 1603 aa25.76■■□□□ 1.71
ALYREF-204ENST00000512673 PZPP20742 1482 aa25.75■■□□□ 1.71
ALYREF-204ENST00000512673 SYNMO15061 1565 aa25.73■■□□□ 1.71
ALYREF-204ENST00000512673 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.73■■□□□ 1.71
ALYREF-204ENST00000512673 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.72■■□□□ 1.71
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
ALYREF-204ENST00000512673 KIF3BO15066 747 aa25.71■■□□□ 1.71
ALYREF-204ENST00000512673 MIA2Q96PC5 1412 aa25.71■■□□□ 1.71
ALYREF-204ENST00000512673 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.69■■□□□ 1.7
ALYREF-204ENST00000512673 NLRP1Q9C000 1473 aa25.68■■□□□ 1.7
ALYREF-204ENST00000512673 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
ALYREF-204ENST00000512673 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.66■■□□□ 1.7
ALYREF-204ENST00000512673 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.66■■□□□ 1.7
ALYREF-204ENST00000512673 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.64■■□□□ 1.7
ALYREF-204ENST00000512673 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
ALYREF-204ENST00000512673 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
ALYREF-204ENST00000512673 MBD5Q9P267 1494 aa25.6■■□□□ 1.69
ALYREF-204ENST00000512673 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.59■■□□□ 1.69
ALYREF-204ENST00000512673 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.55■■□□□ 1.68
ALYREF-204ENST00000512673 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.54■■□□□ 1.68
ALYREF-204ENST00000512673 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
ALYREF-204ENST00000512673 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.52■■□□□ 1.68
ALYREF-204ENST00000512673 TIAM1Q13009 1591 aa25.51■■□□□ 1.67
ALYREF-204ENST00000512673 LTKP29376 864 aa25.5■■□□□ 1.67
ALYREF-204ENST00000512673 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
ALYREF-204ENST00000512673 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
ALYREF-204ENST00000512673 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.47■■□□□ 1.67
ALYREF-204ENST00000512673 TRIM52Q96A61 297 aa25.47■■□□□ 1.67
ALYREF-204ENST00000512673 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.46■■□□□ 1.67
ALYREF-204ENST00000512673 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.46■■□□□ 1.67
ALYREF-204ENST00000512673 ERVK-7P63135 1459 aa25.46■■□□□ 1.67
ALYREF-204ENST00000512673 TMEM94Q12767 1356 aa25.45■■□□□ 1.67
ALYREF-204ENST00000512673 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
ALYREF-204ENST00000512673 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.44■■□□□ 1.66
ALYREF-204ENST00000512673 NCOA2Q15596 1464 aa25.44■■□□□ 1.66
ALYREF-204ENST00000512673 ABCC3O15438 1527 aa25.42■■□□□ 1.66
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.42■■□□□ 1.66
ALYREF-204ENST00000512673 MAP3K1Q13233 1512 aa25.37■■□□□ 1.65
ALYREF-204ENST00000512673 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.37■■□□□ 1.65
ALYREF-204ENST00000512673 PHLPP1O60346 1717 aa25.37■■□□□ 1.65
ALYREF-204ENST00000512673 SLIT1O75093 1534 aa25.35■■□□□ 1.65
ALYREF-204ENST00000512673 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.34■■□□□ 1.65
ALYREF-204ENST00000512673 JCADQ9P266 1359 aa25.34■■□□□ 1.65
ALYREF-204ENST00000512673 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
ALYREF-204ENST00000512673 CEP152O94986 1710 aa25.34■■□□□ 1.65
ALYREF-204ENST00000512673 LRP6O75581 1613 aa25.34■■□□□ 1.65
ALYREF-204ENST00000512673 EID1Q9Y6B2 187 aa25.32■■□□□ 1.64
ALYREF-204ENST00000512673 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ALYREF-204ENST00000512673 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.29■■□□□ 1.64
ALYREF-204ENST00000512673 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.29■■□□□ 1.64
ALYREF-204ENST00000512673 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.28■■□□□ 1.64
ALYREF-204ENST00000512673 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.28■■□□□ 1.64
ALYREF-204ENST00000512673 KCNA6P17658 529 aa25.28■■□□□ 1.64
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-204ENST00000512673 SLAIN2Q9P270 581 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-204ENST00000512673 CEP162Q5TB80 1403 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-204ENST00000512673 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-204ENST00000512673 PIK3C2BO00750 1634 aa25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-204ENST00000512673 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-204ENST00000512673 TSPY4P0CV99 314 aa25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-204ENST00000512673 TSPY10P0CW01 314 aa25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-204ENST00000512673 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-204ENST00000512673 MSH6P52701 1360 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-204ENST00000512673 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-204ENST00000512673 RXRBP28702 533 aa25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-204ENST00000512673 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.2■■□□□ 1.62
ALYREF-204ENST00000512673 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.2■■□□□ 1.62
ALYREF-204ENST00000512673 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.17■■□□□ 1.62
ALYREF-204ENST00000512673 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ALYREF-204ENST00000512673 TET3O43151 1660 aa25.16■■□□□ 1.62
ALYREF-204ENST00000512673 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ALYREF-204ENST00000512673 NWD1Q149M9 1564 aa25.14■■□□□ 1.62
ALYREF-204ENST00000512673 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ALYREF-204ENST00000512673 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ALYREF-204ENST00000512673 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ALYREF-204ENST00000512673 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.12■■□□□ 1.61
ALYREF-204ENST00000512673 BCANQ96GW7 911 aa25.12■■□□□ 1.61
ALYREF-204ENST00000512673 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.11■■□□□ 1.61
ALYREF-204ENST00000512673 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.09■■□□□ 1.61
ALYREF-204ENST00000512673 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
ALYREF-204ENST00000512673 SHPRHQ149N8 1683 aa25.08■■□□□ 1.61
ALYREF-204ENST00000512673 IDI1Q13907 227 aa25.08■■□□□ 1.61
ALYREF-204ENST00000512673 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
ALYREF-204ENST00000512673 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.08■■□□□ 1.61
ALYREF-204ENST00000512673 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
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