RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510403.5

SPOCK3-214, Transcript of SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3, humanhuman

TSL 4

Gene SPOCK3, Length 563 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3-214ENST00000510403 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
SPOCK3-214ENST00000510403 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.23■■■■□ 3.71
SPOCK3-214ENST00000510403 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.18■■■■□ 3.7
SPOCK3-214ENST00000510403 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.15■■■■□ 3.7
SPOCK3-214ENST00000510403 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.69
SPOCK3-214ENST00000510403 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.12■■■■□ 3.69
SPOCK3-214ENST00000510403 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.11■■■■□ 3.69
SPOCK3-214ENST00000510403 ZMYM3Q14202 1370 aa38.09■■■■□ 3.69
SPOCK3-214ENST00000510403 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
SPOCK3-214ENST00000510403 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.08■■■■□ 3.69
SPOCK3-214ENST00000510403 KANK1Q14678 1352 aa38.06■■■■□ 3.68
SPOCK3-214ENST00000510403 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
SPOCK3-214ENST00000510403 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.05■■■■□ 3.68
SPOCK3-214ENST00000510403 MROH2AA6NES4 1674 aa38.04■■■■□ 3.68
SPOCK3-214ENST00000510403 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.01■■■■□ 3.68
SPOCK3-214ENST00000510403 DEPDC5O75140 1603 aa38■■■■□ 3.67
SPOCK3-214ENST00000510403 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.99■■■■□ 3.67
SPOCK3-214ENST00000510403 NAIPQ13075 1403 aa37.99■■■■□ 3.67
SPOCK3-214ENST00000510403 HFM1A2PYH4 1435 aa37.98■■■■□ 3.67
SPOCK3-214ENST00000510403 C3P01024 1663 aa37.98■■■■□ 3.67
SPOCK3-214ENST00000510403 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
SPOCK3-214ENST00000510403 ABCC3O15438 1527 aa37.95■■■■□ 3.67
SPOCK3-214ENST00000510403 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.89■■■■□ 3.66
SPOCK3-214ENST00000510403 NPATQ14207 1427 aa37.88■■■■□ 3.66
SPOCK3-214ENST00000510403 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.87■■■■□ 3.65
SPOCK3-214ENST00000510403 UNC13BO14795 1591 aa37.85■■■■□ 3.65
SPOCK3-214ENST00000510403 PZPP20742 1482 aa37.85■■■■□ 3.65
SPOCK3-214ENST00000510403 CEP152O94986 1710 aa37.85■■■■□ 3.65
SPOCK3-214ENST00000510403 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
SPOCK3-214ENST00000510403 NUP155O75694 1391 aa37.84■■■■□ 3.65
SPOCK3-214ENST00000510403 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.84■■■■□ 3.65
SPOCK3-214ENST00000510403 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.81■■■■□ 3.64
SPOCK3-214ENST00000510403 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.81■■■■□ 3.64
SPOCK3-214ENST00000510403 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.8■■■■□ 3.64
SPOCK3-214ENST00000510403 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
SPOCK3-214ENST00000510403 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.76■■■■□ 3.63
SPOCK3-214ENST00000510403 TRIM52Q96A61 297 aa37.75■■■■□ 3.63
SPOCK3-214ENST00000510403 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.75■■■■□ 3.63
SPOCK3-214ENST00000510403 TNRQ92752 1358 aa37.72■■■■□ 3.63
SPOCK3-214ENST00000510403 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.71■■■■□ 3.63
SPOCK3-214ENST00000510403 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.71■■■■□ 3.63
SPOCK3-214ENST00000510403 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.68■■■■□ 3.62
SPOCK3-214ENST00000510403 TET3O43151 1660 aa37.68■■■■□ 3.62
SPOCK3-214ENST00000510403 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.67■■■■□ 3.62
SPOCK3-214ENST00000510403 ERVK-7P63135 1459 aa37.66■■■■□ 3.62
SPOCK3-214ENST00000510403 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.65■■■■□ 3.62
SPOCK3-214ENST00000510403 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
SPOCK3-214ENST00000510403 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
SPOCK3-214ENST00000510403 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
SPOCK3-214ENST00000510403 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.59■■■■□ 3.61
SPOCK3-214ENST00000510403 HRCP23327 699 aa37.59■■■■□ 3.61
SPOCK3-214ENST00000510403 NLRP1Q9C000 1473 aa37.58■■■■□ 3.61
SPOCK3-214ENST00000510403 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
SPOCK3-214ENST00000510403 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.57■■■■□ 3.6
SPOCK3-214ENST00000510403 HSPA2P54652 639 aa37.56■■■■□ 3.6
SPOCK3-214ENST00000510403 NOS1P29475 1434 aa37.54■■■■□ 3.6
SPOCK3-214ENST00000510403 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.54■■■■□ 3.6
SPOCK3-214ENST00000510403 E9PCH4 1651 aa37.51■■■■□ 3.6
SPOCK3-214ENST00000510403 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
SPOCK3-214ENST00000510403 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.5■■■■□ 3.59
SPOCK3-214ENST00000510403 PKD2Q13563 968 aa37.49■■■■□ 3.59
SPOCK3-214ENST00000510403 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
SPOCK3-214ENST00000510403 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
SPOCK3-214ENST00000510403 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.47■■■■□ 3.59
SPOCK3-214ENST00000510403 IDI1Q13907 227 aa37.45■■■■□ 3.59
SPOCK3-214ENST00000510403 SYNMO15061 1565 aa37.42■■■■□ 3.58
SPOCK3-214ENST00000510403 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.41■■■■□ 3.58
SPOCK3-214ENST00000510403 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.41■■■■□ 3.58
SPOCK3-214ENST00000510403 PTPRTO14522 1441 aa37.37■■■■□ 3.57
SPOCK3-214ENST00000510403 PLA2R1Q13018 1463 aa37.32■■■■□ 3.56
SPOCK3-214ENST00000510403 PIK3C2BO00750 1634 aa37.3■■■■□ 3.56
SPOCK3-214ENST00000510403 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.3■■■■□ 3.56
SPOCK3-214ENST00000510403 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.3■■■■□ 3.56
SPOCK3-214ENST00000510403 FOXD1Q16676 465 aa37.29■■■■□ 3.56
SPOCK3-214ENST00000510403 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.27■■■■□ 3.56
SPOCK3-214ENST00000510403 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.27■■■■□ 3.56
SPOCK3-214ENST00000510403 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
SPOCK3-214ENST00000510403 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
SPOCK3-214ENST00000510403 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.24■■■■□ 3.55
SPOCK3-214ENST00000510403 TRPM2O94759 1503 aa37.24■■■■□ 3.55
SPOCK3-214ENST00000510403 ADGRB3O60242 1522 aa37.21■■■■□ 3.55
SPOCK3-214ENST00000510403 STRCQ7RTU9 1775 aa37.21■■■■□ 3.55
SPOCK3-214ENST00000510403 EID1Q9Y6B2 187 aa37.19■■■■□ 3.54
SPOCK3-214ENST00000510403 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.18■■■■□ 3.54
SPOCK3-214ENST00000510403 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
SPOCK3-214ENST00000510403 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.16■■■■□ 3.54
SPOCK3-214ENST00000510403 SLIT1O75093 1534 aa37.15■■■■□ 3.54
SPOCK3-214ENST00000510403 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.14■■■■□ 3.54
SPOCK3-214ENST00000510403 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.14■■■■□ 3.54
SPOCK3-214ENST00000510403 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.11■■■■□ 3.53
SPOCK3-214ENST00000510403 CLTCL1P53675 1640 aa37.11■■■■□ 3.53
SPOCK3-214ENST00000510403 LTKP29376 864 aa37.09■■■■□ 3.53
SPOCK3-214ENST00000510403 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.09■■■■□ 3.53
SPOCK3-214ENST00000510403 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.53
SPOCK3-214ENST00000510403 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.07■■■■□ 3.52
SPOCK3-214ENST00000510403 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
SPOCK3-214ENST00000510403 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
SPOCK3-214ENST00000510403 MED14O60244 1454 aa37.04■■■■□ 3.52
SPOCK3-214ENST00000510403 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa37.04■■■■□ 3.52
SPOCK3-214ENST00000510403 KIF1BO60333 1816 aa37.03■■■■□ 3.52
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