RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
SH3BP2-212ENST00000508338 GGT6Q6P531 493 aa40.65■■■■■ 4.1
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPRMP28827 1452 aa40.63■■■■■ 4.09
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.58■■■■■ 4.09
SH3BP2-212ENST00000508338 MROH2AA6NES4 1674 aa40.55■■■■■ 4.08
SH3BP2-212ENST00000508338 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.51■■■■■ 4.08
SH3BP2-212ENST00000508338 DEPDC5O75140 1603 aa40.49■■■■■ 4.07
SH3BP2-212ENST00000508338 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.47■■■■■ 4.07
SH3BP2-212ENST00000508338 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
SH3BP2-212ENST00000508338 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
SH3BP2-212ENST00000508338 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
SH3BP2-212ENST00000508338 KANK1Q14678 1352 aa40.45■■■■■ 4.07
SH3BP2-212ENST00000508338 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.44■■■■■ 4.06
SH3BP2-212ENST00000508338 ZMYM3Q14202 1370 aa40.41■■■■■ 4.06
SH3BP2-212ENST00000508338 HFM1A2PYH4 1435 aa40.41■■■■■ 4.06
SH3BP2-212ENST00000508338 C3P01024 1663 aa40.4■■■■■ 4.06
SH3BP2-212ENST00000508338 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.4■■■■■ 4.06
SH3BP2-212ENST00000508338 NAIPQ13075 1403 aa40.37■■■■■ 4.05
SH3BP2-212ENST00000508338 ABCC3O15438 1527 aa40.37■■■■■ 4.05
SH3BP2-212ENST00000508338 UNC13BO14795 1591 aa40.32■■■■■ 4.05
SH3BP2-212ENST00000508338 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
SH3BP2-212ENST00000508338 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.32■■■■■ 4.05
SH3BP2-212ENST00000508338 NPATQ14207 1427 aa40.31■■■■■ 4.04
SH3BP2-212ENST00000508338 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.31■■■■■ 4.04
SH3BP2-212ENST00000508338 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
SH3BP2-212ENST00000508338 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.28■■■■■ 4.04
SH3BP2-212ENST00000508338 CEP152O94986 1710 aa40.28■■■■■ 4.04
SH3BP2-212ENST00000508338 PZPP20742 1482 aa40.27■■■■■ 4.04
SH3BP2-212ENST00000508338 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.27■■■■■ 4.04
SH3BP2-212ENST00000508338 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
SH3BP2-212ENST00000508338 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.24■■■■■ 4.03
SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.23■■■■■ 4.03
SH3BP2-212ENST00000508338 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.17■■■■■ 4.02
SH3BP2-212ENST00000508338 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.16■■■■■ 4.02
SH3BP2-212ENST00000508338 NUP155O75694 1391 aa40.16■■■■■ 4.02
SH3BP2-212ENST00000508338 TET3O43151 1660 aa40.13■■■■■ 4.01
SH3BP2-212ENST00000508338 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.12■■■■■ 4.01
SH3BP2-212ENST00000508338 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.11■■■■■ 4.01
SH3BP2-212ENST00000508338 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.11■■■■■ 4.01
SH3BP2-212ENST00000508338 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
SH3BP2-212ENST00000508338 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.06■■■■■ 4
SH3BP2-212ENST00000508338 TNRQ92752 1358 aa40.06■■■■■ 4
SH3BP2-212ENST00000508338 ERVK-7P63135 1459 aa40.05■■■■■ 4
SH3BP2-212ENST00000508338 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.03■■■■■ 4
SH3BP2-212ENST00000508338 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM52Q96A61 297 aa40■■■■□ 3.99
SH3BP2-212ENST00000508338 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40■■■■□ 3.99
SH3BP2-212ENST00000508338 NLRP1Q9C000 1473 aa39.99■■■■□ 3.99
SH3BP2-212ENST00000508338 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
SH3BP2-212ENST00000508338 HRCP23327 699 aa39.95■■■■□ 3.99
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.92■■■■□ 3.98
SH3BP2-212ENST00000508338 E9PCH4 1651 aa39.92■■■■□ 3.98
SH3BP2-212ENST00000508338 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.91■■■■□ 3.98
SH3BP2-212ENST00000508338 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
SH3BP2-212ENST00000508338 NOS1P29475 1434 aa39.91■■■■□ 3.98
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.83■■■■□ 3.97
SH3BP2-212ENST00000508338 SYNMO15061 1565 aa39.79■■■■□ 3.96
SH3BP2-212ENST00000508338 UGGT1Q9NYU2 1555 aa39.77■■■■□ 3.96
SH3BP2-212ENST00000508338 PKD2Q13563 968 aa39.76■■■■□ 3.96
SH3BP2-212ENST00000508338 HSPA2P54652 639 aa39.75■■■■□ 3.95
SH3BP2-212ENST00000508338 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
SH3BP2-212ENST00000508338 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa39.74■■■■□ 3.95
SH3BP2-212ENST00000508338 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
SH3BP2-212ENST00000508338 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.74■■■■□ 3.95
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPRTO14522 1441 aa39.73■■■■□ 3.95
SH3BP2-212ENST00000508338 PLA2R1Q13018 1463 aa39.72■■■■□ 3.95
SH3BP2-212ENST00000508338 IDI1Q13907 227 aa39.69■■■■□ 3.94
SH3BP2-212ENST00000508338 PIK3C2BO00750 1634 aa39.69■■■■□ 3.94
SH3BP2-212ENST00000508338 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.67■■■■□ 3.94
SH3BP2-212ENST00000508338 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.67■■■■□ 3.94
SH3BP2-212ENST00000508338 TRPM2O94759 1503 aa39.65■■■■□ 3.94
SH3BP2-212ENST00000508338 ADGRB3O60242 1522 aa39.61■■■■□ 3.93
SH3BP2-212ENST00000508338 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.6■■■■□ 3.93
SH3BP2-212ENST00000508338 STRCQ7RTU9 1775 aa39.56■■■■□ 3.92
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.54■■■■□ 3.92
SH3BP2-212ENST00000508338 SLIT1O75093 1534 aa39.53■■■■□ 3.92
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.51■■■■□ 3.92
SH3BP2-212ENST00000508338 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.91
SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.5■■■■□ 3.91
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.49■■■■□ 3.91
SH3BP2-212ENST00000508338 CLTCL1P53675 1640 aa39.48■■■■□ 3.91
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SH3BP2-212ENST00000508338 FOXD1Q16676 465 aa39.47■■■■□ 3.91
SH3BP2-212ENST00000508338 EID1Q9Y6B2 187 aa39.47■■■■□ 3.91
SH3BP2-212ENST00000508338 KIF1BO60333 1816 aa39.46■■■■□ 3.91
SH3BP2-212ENST00000508338 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.45■■■■□ 3.91
SH3BP2-212ENST00000508338 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.42■■■■□ 3.9
SH3BP2-212ENST00000508338 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.42■■■■□ 3.9
SH3BP2-212ENST00000508338 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
SH3BP2-212ENST00000508338 MED14O60244 1454 aa39.4■■■■□ 3.9
SH3BP2-212ENST00000508338 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.38■■■■□ 3.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP39.37■■■■□ 3.89
SH3BP2-212ENST00000508338 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.35■■■■□ 3.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.33■■■■□ 3.89
SH3BP2-212ENST00000508338 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
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