RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507785.2

MSX2-202, Transcript of msh homeobox 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSX2, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX2-202ENST00000507785 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
MSX2-202ENST00000507785 NCOA1Q15788 1441 aa42.95■■■■■ 4.47
MSX2-202ENST00000507785 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.94■■■■■ 4.46
MSX2-202ENST00000507785 PTPRKQ15262 1439 aa42.93■■■■■ 4.46
MSX2-202ENST00000507785 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
MSX2-202ENST00000507785 ERBINQ96RT1 1412 aa42.89■■■■■ 4.46
MSX2-202ENST00000507785 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.89■■■■■ 4.46
MSX2-202ENST00000507785 ZMYM3Q14202 1370 aa42.87■■■■■ 4.45
MSX2-202ENST00000507785 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
MSX2-202ENST00000507785 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.86■■■■■ 4.45
MSX2-202ENST00000507785 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.84■■■■■ 4.45
MSX2-202ENST00000507785 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.83■■■■■ 4.45
MSX2-202ENST00000507785 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.78■■■■■ 4.44
MSX2-202ENST00000507785 ROCK1Q13464 1354 aa42.76■■■■■ 4.44
MSX2-202ENST00000507785 DEPDC5O75140 1603 aa42.75■■■■■ 4.43
MSX2-202ENST00000507785 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.73■■■■■ 4.43
MSX2-202ENST00000507785 NPATQ14207 1427 aa42.73■■■■■ 4.43
MSX2-202ENST00000507785 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
MSX2-202ENST00000507785 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
MSX2-202ENST00000507785 ABCC3O15438 1527 aa42.72■■■■■ 4.43
MSX2-202ENST00000507785 ITGAEP38570 1179 aa42.69■■■■■ 4.42
MSX2-202ENST00000507785 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa42.67■■■■■ 4.42
MSX2-202ENST00000507785 CEP152O94986 1710 aa42.66■■■■■ 4.42
MSX2-202ENST00000507785 PZPP20742 1482 aa42.64■■■■■ 4.42
MSX2-202ENST00000507785 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.63■■■■■ 4.41
MSX2-202ENST00000507785 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.58■■■■■ 4.41
MSX2-202ENST00000507785 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.58■■■■■ 4.41
MSX2-202ENST00000507785 HSPA2P54652 639 aa42.55■■■■■ 4.4
MSX2-202ENST00000507785 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.53■■■■■ 4.4
MSX2-202ENST00000507785 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.53■■■■■ 4.4
MSX2-202ENST00000507785 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
MSX2-202ENST00000507785 KANK1Q14678 1352 aa42.51■■■■■ 4.4
MSX2-202ENST00000507785 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.5■■■■■ 4.39
MSX2-202ENST00000507785 UNC13BO14795 1591 aa42.48■■■■■ 4.39
MSX2-202ENST00000507785 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
MSX2-202ENST00000507785 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa42.46■■■■■ 4.39
MSX2-202ENST00000507785 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
MSX2-202ENST00000507785 TNRQ92752 1358 aa42.44■■■■■ 4.38
MSX2-202ENST00000507785 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.44■■■■■ 4.38
MSX2-202ENST00000507785 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
MSX2-202ENST00000507785 ERVK-7P63135 1459 aa42.41■■■■■ 4.38
MSX2-202ENST00000507785 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.39■■■■■ 4.38
MSX2-202ENST00000507785 NAIPQ13075 1403 aa42.37■■■■■ 4.37
MSX2-202ENST00000507785 EFCAB6Q5THR3 1501 aa42.36■■■■■ 4.37
MSX2-202ENST00000507785 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.35■■■■■ 4.37
MSX2-202ENST00000507785 STRCQ7RTU9 1775 aa42.33■■■■■ 4.37
MSX2-202ENST00000507785 HFM1A2PYH4 1435 aa42.31■■■■■ 4.36
MSX2-202ENST00000507785 TET3O43151 1660 aa42.31■■■■■ 4.36
MSX2-202ENST00000507785 NLRP1Q9C000 1473 aa42.3■■■■■ 4.36
MSX2-202ENST00000507785 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.3■■■■■ 4.36
MSX2-202ENST00000507785 NUP155O75694 1391 aa42.21■■■■■ 4.35
MSX2-202ENST00000507785 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
MSX2-202ENST00000507785 PLA2R1Q13018 1463 aa42.18■■■■■ 4.34
MSX2-202ENST00000507785 NOS1P29475 1434 aa42.18■■■■■ 4.34
MSX2-202ENST00000507785 SYNMO15061 1565 aa42.15■■■■■ 4.34
MSX2-202ENST00000507785 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.15■■■■■ 4.34
MSX2-202ENST00000507785 E9PCH4 1651 aa42.15■■■■■ 4.34
MSX2-202ENST00000507785 UBR1Q8IWV7 1749 aa42.09■■■■■ 4.33
MSX2-202ENST00000507785 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
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MSX2-202ENST00000507785 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.04■■■■■ 4.32
MSX2-202ENST00000507785 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa42.03■■■■■ 4.32
MSX2-202ENST00000507785 PKD2Q13563 968 aa42.01■■■■■ 4.32
MSX2-202ENST00000507785 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
MSX2-202ENST00000507785 IDI1Q13907 227 aa41.99■■■■■ 4.31
MSX2-202ENST00000507785 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
MSX2-202ENST00000507785 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.95■■■■■ 4.31
MSX2-202ENST00000507785 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.94■■■■■ 4.3
MSX2-202ENST00000507785 TRIM52Q96A61 297 aa41.91■■■■■ 4.3
MSX2-202ENST00000507785 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.9■■■■■ 4.3
MSX2-202ENST00000507785 ADGRB3O60242 1522 aa41.9■■■■■ 4.3
MSX2-202ENST00000507785 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.89■■■■■ 4.3
MSX2-202ENST00000507785 SLIT1O75093 1534 aa41.89■■■■■ 4.3
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MSX2-202ENST00000507785 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.88■■■■■ 4.29
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MSX2-202ENST00000507785 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.82■■■■■ 4.29
MSX2-202ENST00000507785 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.81■■■■■ 4.28
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MSX2-202ENST00000507785 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.79■■■■■ 4.28
MSX2-202ENST00000507785 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
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MSX2-202ENST00000507785 TRPM2O94759 1503 aa41.74■■■■■ 4.27
MSX2-202ENST00000507785 IQGAP1P46940 1657 aa41.74■■■■■ 4.27
MSX2-202ENST00000507785 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
MSX2-202ENST00000507785 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.7■■■■■ 4.27
MSX2-202ENST00000507785 CLTCL1P53675 1640 aa41.68■■■■■ 4.26
MSX2-202ENST00000507785 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.68■■■■■ 4.26
MSX2-202ENST00000507785 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.67■■■■■ 4.26
MSX2-202ENST00000507785 EID1Q9Y6B2 187 aa41.66■■■■■ 4.26
MSX2-202ENST00000507785 ZFYVE9O95405 1425 aa41.64■■■■■ 4.26
MSX2-202ENST00000507785 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
MSX2-202ENST00000507785 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
MSX2-202ENST00000507785 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.58■■■■■ 4.25
MSX2-202ENST00000507785 HRCP23327 699 aa41.57■■■■■ 4.25
MSX2-202ENST00000507785 FOXD1Q16676 465 aa41.57■■■■■ 4.25
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