RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502676.1

PITX1-202, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-202ENST00000502676 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
PITX1-202ENST00000502676 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.67■■■■□ 3.3
PITX1-202ENST00000502676 NCOA1Q15788 1441 aa35.65■■■■□ 3.3
PITX1-202ENST00000502676 ERBINQ96RT1 1412 aa35.65■■■■□ 3.3
PITX1-202ENST00000502676 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.64■■■■□ 3.3
PITX1-202ENST00000502676 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.64■■■■□ 3.3
PITX1-202ENST00000502676 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.63■■■■□ 3.29
PITX1-202ENST00000502676 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
PITX1-202ENST00000502676 ADGRL2O95490 1459 aa35.62■■■■□ 3.29
PITX1-202ENST00000502676 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.62■■■■□ 3.29
PITX1-202ENST00000502676 HSPA2P54652 639 aa35.61■■■■□ 3.29
PITX1-202ENST00000502676 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
PITX1-202ENST00000502676 NPATQ14207 1427 aa35.6■■■■□ 3.29
PITX1-202ENST00000502676 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.59■■■■□ 3.29
PITX1-202ENST00000502676 ITGAEP38570 1179 aa35.58■■■■□ 3.29
PITX1-202ENST00000502676 PTPRKQ15262 1439 aa35.56■■■■□ 3.28
PITX1-202ENST00000502676 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.52■■■■□ 3.28
PITX1-202ENST00000502676 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
PITX1-202ENST00000502676 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.51■■■■□ 3.28
PITX1-202ENST00000502676 ABCC3O15438 1527 aa35.5■■■■□ 3.27
PITX1-202ENST00000502676 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
PITX1-202ENST00000502676 PZPP20742 1482 aa35.48■■■■□ 3.27
PITX1-202ENST00000502676 ROCK1Q13464 1354 aa35.47■■■■□ 3.27
PITX1-202ENST00000502676 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.47■■■■□ 3.27
PITX1-202ENST00000502676 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
PITX1-202ENST00000502676 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
PITX1-202ENST00000502676 KANK1Q14678 1352 aa35.45■■■■□ 3.27
PITX1-202ENST00000502676 DEPDC5O75140 1603 aa35.43■■■■□ 3.26
PITX1-202ENST00000502676 CEP152O94986 1710 aa35.41■■■■□ 3.26
PITX1-202ENST00000502676 TNRQ92752 1358 aa35.39■■■■□ 3.26
PITX1-202ENST00000502676 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.39■■■■□ 3.26
PITX1-202ENST00000502676 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.36■■■■□ 3.25
PITX1-202ENST00000502676 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
PITX1-202ENST00000502676 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
PITX1-202ENST00000502676 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.29■■■■□ 3.24
PITX1-202ENST00000502676 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.28■■■■□ 3.24
PITX1-202ENST00000502676 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.28■■■■□ 3.24
PITX1-202ENST00000502676 ERVK-7P63135 1459 aa35.28■■■■□ 3.24
PITX1-202ENST00000502676 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.27■■■■□ 3.24
PITX1-202ENST00000502676 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.25■■■■□ 3.23
PITX1-202ENST00000502676 NLRP1Q9C000 1473 aa35.23■■■■□ 3.23
PITX1-202ENST00000502676 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.23■■■■□ 3.23
PITX1-202ENST00000502676 STRCQ7RTU9 1775 aa35.22■■■■□ 3.23
PITX1-202ENST00000502676 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
PITX1-202ENST00000502676 UNC13BO14795 1591 aa35.2■■■■□ 3.23
PITX1-202ENST00000502676 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.16■■■■□ 3.22
PITX1-202ENST00000502676 PLA2R1Q13018 1463 aa35.15■■■■□ 3.22
PITX1-202ENST00000502676 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.13■■■■□ 3.21
PITX1-202ENST00000502676 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.13■■■■□ 3.21
PITX1-202ENST00000502676 NAIPQ13075 1403 aa35.13■■■■□ 3.21
PITX1-202ENST00000502676 NUP155O75694 1391 aa35.13■■■■□ 3.21
PITX1-202ENST00000502676 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
PITX1-202ENST00000502676 PKD2Q13563 968 aa35.1■■■■□ 3.21
PITX1-202ENST00000502676 TET3O43151 1660 aa35.1■■■■□ 3.21
PITX1-202ENST00000502676 PTPRTO14522 1441 aa35.08■■■■□ 3.21
PITX1-202ENST00000502676 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.07■■■■□ 3.2
PITX1-202ENST00000502676 HFM1A2PYH4 1435 aa35.06■■■■□ 3.2
PITX1-202ENST00000502676 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.06■■■■□ 3.2
PITX1-202ENST00000502676 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
PITX1-202ENST00000502676 NOS1P29475 1434 aa35.03■■■■□ 3.2
PITX1-202ENST00000502676 ANKLE2Q86XL3 938 aa35■■■■□ 3.19
PITX1-202ENST00000502676 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.99■■■■□ 3.19
PITX1-202ENST00000502676 SYNMO15061 1565 aa34.99■■■■□ 3.19
PITX1-202ENST00000502676 IDI1Q13907 227 aa34.97■■■■□ 3.19
PITX1-202ENST00000502676 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.96■■■■□ 3.19
PITX1-202ENST00000502676 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.96■■■■□ 3.19
PITX1-202ENST00000502676 TRIM52Q96A61 297 aa34.95■■■■□ 3.19
PITX1-202ENST00000502676 PIK3C2BO00750 1634 aa34.95■■■■□ 3.18
PITX1-202ENST00000502676 E9PCH4 1651 aa34.95■■■■□ 3.18
PITX1-202ENST00000502676 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
PITX1-202ENST00000502676 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.87■■■■□ 3.17
PITX1-202ENST00000502676 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
PITX1-202ENST00000502676 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
PITX1-202ENST00000502676 SLIT1O75093 1534 aa34.83■■■■□ 3.17
PITX1-202ENST00000502676 CERKQ8TCT0 537 aa34.83■■■■□ 3.17
PITX1-202ENST00000502676 EID1Q9Y6B2 187 aa34.83■■■■□ 3.17
PITX1-202ENST00000502676 ADGRB3O60242 1522 aa34.82■■■■□ 3.16
PITX1-202ENST00000502676 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.82■■■■□ 3.16
PITX1-202ENST00000502676 MED14O60244 1454 aa34.82■■■■□ 3.16
PITX1-202ENST00000502676 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.82■■■■□ 3.16
PITX1-202ENST00000502676 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.81■■■■□ 3.16
PITX1-202ENST00000502676 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
PITX1-202ENST00000502676 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
PITX1-202ENST00000502676 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
PITX1-202ENST00000502676 LTKP29376 864 aa34.78■■■■□ 3.16
PITX1-202ENST00000502676 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
PITX1-202ENST00000502676 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.75■■■■□ 3.15
PITX1-202ENST00000502676 IQGAP1P46940 1657 aa34.75■■■■□ 3.15
PITX1-202ENST00000502676 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.73■■■■□ 3.15
PITX1-202ENST00000502676 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.72■■■■□ 3.15
PITX1-202ENST00000502676 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
PITX1-202ENST00000502676 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.7■■■■□ 3.14
PITX1-202ENST00000502676 FBXO41Q8TF61 875 aa34.69■■■■□ 3.14
PITX1-202ENST00000502676 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
PITX1-202ENST00000502676 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
PITX1-202ENST00000502676 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.65■■■■□ 3.14
PITX1-202ENST00000502676 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.63■■■■□ 3.13
PITX1-202ENST00000502676 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.62■■■■□ 3.13
PITX1-202ENST00000502676 TRPM2O94759 1503 aa34.62■■■■□ 3.13
PITX1-202ENST00000502676 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
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