RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500800.2

SMARCA5-AS1-201, SMARCA5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCA5-AS1, Length 945 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.76■■■■□ 3.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 KIF15Q9NS87 1388 aa34.75■■■■□ 3.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.75■■■■□ 3.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 HSPA2P54652 639 aa34.72■■■■□ 3.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PTPRKQ15262 1439 aa34.71■■■■□ 3.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ERBINQ96RT1 1412 aa34.7■■■■□ 3.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ADGRL2O95490 1459 aa34.7■■■■□ 3.15
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.7■■■■□ 3.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.69■■■■□ 3.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.69■■■■□ 3.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NCOA1Q15788 1441 aa34.67■■■■□ 3.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.66■■■■□ 3.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.66■■■■□ 3.14
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ABCC3O15438 1527 aa34.62■■■■□ 3.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PZPP20742 1482 aa34.62■■■■□ 3.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DEPDC5O75140 1603 aa34.61■■■■□ 3.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.61■■■■□ 3.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.6■■■■□ 3.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CEP152O94986 1710 aa34.59■■■■□ 3.13
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 STRCQ7RTU9 1775 aa34.57■■■■□ 3.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.53■■■■□ 3.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.12
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ROCK1Q13464 1354 aa34.48■■■■□ 3.11
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TNRQ92752 1358 aa34.48■■■■□ 3.11
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.46■■■■□ 3.11
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.45■■■■□ 3.11
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.45■■■■□ 3.1
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.44■■■■□ 3.1
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 KANK1Q14678 1352 aa34.42■■■■□ 3.1
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.41■■■■□ 3.1
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.4■■■■□ 3.1
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.4■■■■□ 3.1
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ERVK-7P63135 1459 aa34.39■■■■□ 3.1
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NLRP1Q9C000 1473 aa34.38■■■■□ 3.09
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.37■■■■□ 3.09
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PLA2R1Q13018 1463 aa34.37■■■■□ 3.09
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ITGAEP38570 1179 aa34.35■■■■□ 3.09
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 UNC13BO14795 1591 aa34.33■■■■□ 3.09
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PTPRTO14522 1441 aa34.33■■■■□ 3.09
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.29■■■■□ 3.08
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.26■■■■□ 3.07
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PKD2Q13563 968 aa34.24■■■■□ 3.07
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TET3O43151 1660 aa34.24■■■■□ 3.07
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.22■■■■□ 3.07
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.22■■■■□ 3.07
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.19■■■■□ 3.06
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.19■■■■□ 3.06
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NOS1P29475 1434 aa34.15■■■■□ 3.06
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SYNMO15061 1565 aa34.15■■■■□ 3.06
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.13■■■■□ 3.05
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PIK3C2BO00750 1634 aa34.12■■■■□ 3.05
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NAIPQ13075 1403 aa34.12■■■■□ 3.05
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 E9PCH4 1651 aa34.1■■■■□ 3.05
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NUP155O75694 1391 aa34.08■■■■□ 3.05
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.07■■■■□ 3.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 HFM1A2PYH4 1435 aa34.05■■■■□ 3.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 MED14O60244 1454 aa34.05■■■■□ 3.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.04■■■■□ 3.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CERKQ8TCT0 537 aa34.04■■■■□ 3.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SLIT1O75093 1534 aa34.03■■■■□ 3.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 IDI1Q13907 227 aa34.02■■■■□ 3.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.01■■■■□ 3.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34■■■■□ 3.03
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 FBXO41Q8TF61 875 aa33.98■■■■□ 3.03
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 IQGAP1P46940 1657 aa33.98■■■■□ 3.03
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ADGRB3O60242 1522 aa33.97■■■■□ 3.03
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.93■■■■□ 3.02
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.93■■■■□ 3.02
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.92■■■■□ 3.02
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.89■■■■□ 3.02
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 LTKP29376 864 aa33.88■■■■□ 3.01
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.88■■■■□ 3.01
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 IQSEC2Q5JU85 1478 aa33.87■■■■□ 3.01
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TXNDC2Q86VQ3 553 aa33.86■■■■□ 3.01
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 EID1Q9Y6B2 187 aa33.85■■■■□ 3.01
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CPS1P31327 1500 aa33.78■■■■□ 3
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TRIM52Q96A61 297 aa33.77■■■■□ 3
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 ZFYVE9O95405 1425 aa33.76■■■□□ 2.99
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 STRCP1A6NGW2 1772 aa33.74■■■□□ 2.99
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 TRPM2O94759 1503 aa33.73■■■□□ 2.99
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RIMS2Q9UQ26 1411 aa33.7■■■□□ 2.99
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CLTCL1P53675 1640 aa33.68■■■□□ 2.98
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms