RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498219.5

HPS1-214, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-214ENST00000498219 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HPS1-214ENST00000498219 HSPA2P54652 639 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS1-214ENST00000498219 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HPS1-214ENST00000498219 PTPRKQ15262 1439 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS1-214ENST00000498219 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS1-214ENST00000498219 ITGAEP38570 1179 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS1-214ENST00000498219 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS1-214ENST00000498219 NCOA1Q15788 1441 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS1-214ENST00000498219 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS1-214ENST00000498219 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS1-214ENST00000498219 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS1-214ENST00000498219 ADGRL2O95490 1459 aa22.55■■□□□ 1.2
HPS1-214ENST00000498219 CEP152O94986 1710 aa22.55■■□□□ 1.2
HPS1-214ENST00000498219 ERBINQ96RT1 1412 aa22.55■■□□□ 1.2
HPS1-214ENST00000498219 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.53■■□□□ 1.2
HPS1-214ENST00000498219 ABCC3O15438 1527 aa22.52■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 NPATQ14207 1427 aa22.5■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.5■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 DEPDC5O75140 1603 aa22.48■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.48■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 PZPP20742 1482 aa22.47■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.46■■□□□ 1.19
HPS1-214ENST00000498219 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.45■■□□□ 1.18
HPS1-214ENST00000498219 ROCK1Q13464 1354 aa22.42■■□□□ 1.18
HPS1-214ENST00000498219 TNRQ92752 1358 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS1-214ENST00000498219 STRCQ7RTU9 1775 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS1-214ENST00000498219 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
HPS1-214ENST00000498219 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
HPS1-214ENST00000498219 KANK1Q14678 1352 aa22.39■■□□□ 1.18
HPS1-214ENST00000498219 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.38■■□□□ 1.17
HPS1-214ENST00000498219 ERVK-7P63135 1459 aa22.36■■□□□ 1.17
HPS1-214ENST00000498219 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.34■■□□□ 1.17
HPS1-214ENST00000498219 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.34■■□□□ 1.17
HPS1-214ENST00000498219 UNC13BO14795 1591 aa22.33■■□□□ 1.17
HPS1-214ENST00000498219 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.33■■□□□ 1.17
HPS1-214ENST00000498219 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.31■■□□□ 1.16
HPS1-214ENST00000498219 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.3■■□□□ 1.16
HPS1-214ENST00000498219 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS1-214ENST00000498219 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS1-214ENST00000498219 NLRP1Q9C000 1473 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS1-214ENST00000498219 TET3O43151 1660 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS1-214ENST00000498219 NAIPQ13075 1403 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS1-214ENST00000498219 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.25■■□□□ 1.15
HPS1-214ENST00000498219 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS1-214ENST00000498219 NUP155O75694 1391 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS1-214ENST00000498219 PLA2R1Q13018 1463 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS1-214ENST00000498219 SYNMO15061 1565 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS1-214ENST00000498219 E9PCH4 1651 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS1-214ENST00000498219 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS1-214ENST00000498219 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS1-214ENST00000498219 PIK3C2BO00750 1634 aa22.2■■□□□ 1.15
HPS1-214ENST00000498219 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HPS1-214ENST00000498219 PTPRTO14522 1441 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS1-214ENST00000498219 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HPS1-214ENST00000498219 HFM1A2PYH4 1435 aa22.19■■□□□ 1.14
HPS1-214ENST00000498219 NOS1P29475 1434 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS1-214ENST00000498219 PKD2Q13563 968 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS1-214ENST00000498219 IDI1Q13907 227 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS1-214ENST00000498219 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS1-214ENST00000498219 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HPS1-214ENST00000498219 TRIM52Q96A61 297 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS1-214ENST00000498219 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS1-214ENST00000498219 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS1-214ENST00000498219 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS1-214ENST00000498219 ADGRB3O60242 1522 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS1-214ENST00000498219 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 LTKP29376 864 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 IQGAP1P46940 1657 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 SLIT1O75093 1534 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 CERKQ8TCT0 537 aa22.05■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.05■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 MED14O60244 1454 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HPS1-214ENST00000498219 SETD5Q9C0A6 1442 aa22■■□□□ 1.11
HPS1-214ENST00000498219 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HPS1-214ENST00000498219 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HPS1-214ENST00000498219 EID1Q9Y6B2 187 aa21.99■■□□□ 1.11
HPS1-214ENST00000498219 FOXD1Q16676 465 aa21.97■■□□□ 1.11
HPS1-214ENST00000498219 CLTCL1P53675 1640 aa21.97■■□□□ 1.11
HPS1-214ENST00000498219 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.95■■□□□ 1.1
HPS1-214ENST00000498219 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.95■■□□□ 1.1
HPS1-214ENST00000498219 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HPS1-214ENST00000498219 FBXO41Q8TF61 875 aa21.94■■□□□ 1.1
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