RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1B-215ENST00000498054 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1B-215ENST00000498054 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1B-215ENST00000498054 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1B-215ENST00000498054 ZMYND10O75800 440 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1B-215ENST00000498054 DDX12PQ92771 950 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR1B-215ENST00000498054 NUTM2FA1L443 756 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1B-215ENST00000498054 EVI5O60447 810 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1B-215ENST00000498054 KCNK17Q96T54 332 aa9.09□□□□□ -0.95
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POLR1B-215ENST00000498054 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
POLR1B-215ENST00000498054 KCNH8Q96L42 1107 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1B-215ENST00000498054 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.04□□□□□ -0.96
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POLR1B-215ENST00000498054 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
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POLR1B-215ENST00000498054 GPR37O15354 613 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 MAP3K7O43318 606 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.95□□□□□ -0.98
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POLR1B-215ENST00000498054 GNPATO15228 680 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 PHF14O94880 888 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 HIC1Q14526 733 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 EPAS1Q99814 870 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 FECHP22830 423 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 MAP2K5Q13163 448 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 IRF6O14896 467 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 PDE4DQ08499 809 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC102AQ96A19 550 aa8.91□□□□□ -0.98
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POLR1B-215ENST00000498054 PTGDRQ13258 359 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1B-215ENST00000498054 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.9□□□□□ -0.98
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POLR1B-215ENST00000498054 FBXW7Q969H0 707 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1B-215ENST00000498054 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1B-215ENST00000498054 IL27Q8NEV9 243 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1B-215ENST00000498054 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.88□□□□□ -0.99
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POLR1B-215ENST00000498054 NBPF3Q9H094 633 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1B-215ENST00000498054 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1B-215ENST00000498054 WNT2BQ93097 391 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1B-215ENST00000498054 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1B-215ENST00000498054 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
POLR1B-215ENST00000498054 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
POLR1B-215ENST00000498054 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1B-215ENST00000498054 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
POLR1B-215ENST00000498054 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.81□□□□□ -1
POLR1B-215ENST00000498054 AMHR2Q16671 573 aa8.8□□□□□ -1
POLR1B-215ENST00000498054 FAM161AQ3B820 660 aa8.79□□□□□ -1
POLR1B-215ENST00000498054 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.79□□□□□ -1
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POLR1B-215ENST00000498054 FAM117AQ9C073 453 aa8.78□□□□□ -1
POLR1B-215ENST00000498054 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
POLR1B-215ENST00000498054 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.78□□□□□ -1
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 PADI6Q6TGC4 694 aa8.77□□□□□ -1.01
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POLR1B-215ENST00000498054 BCAMP50895 628 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 OATP04181 439 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 C14orf37Q86TY3 774 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 CLCN1P35523 988 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 PRSS12P56730 875 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-215ENST00000498054 NLRP7Q8WX94 980 aa8.73□□□□□ -1.01
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