RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492710.1

EPC1-209, Transcript of enhancer of polycomb homolog 1, humanhuman

TSL 2

Gene EPC1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPC1-209ENST00000492710 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.5□□□□□ -0.25
EPC1-209ENST00000492710 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
EPC1-209ENST00000492710 GGT6Q6P531 493 aa13.5□□□□□ -0.25
EPC1-209ENST00000492710 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
EPC1-209ENST00000492710 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.49□□□□□ -0.25
EPC1-209ENST00000492710 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.48□□□□□ -0.25
EPC1-209ENST00000492710 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
EPC1-209ENST00000492710 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa13.48□□□□□ -0.25
EPC1-209ENST00000492710 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
EPC1-209ENST00000492710 PLA2R1Q13018 1463 aa13.47□□□□□ -0.25
EPC1-209ENST00000492710 MBD5Q9P267 1494 aa13.47□□□□□ -0.25
EPC1-209ENST00000492710 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.45□□□□□ -0.26
EPC1-209ENST00000492710 SOCS7O14512 581 aa13.45□□□□□ -0.26
EPC1-209ENST00000492710 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.42□□□□□ -0.26
EPC1-209ENST00000492710 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.42□□□□□ -0.26
EPC1-209ENST00000492710 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13.42□□□□□ -0.26
EPC1-209ENST00000492710 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.41□□□□□ -0.26
EPC1-209ENST00000492710 PKD2Q13563 968 aa13.41□□□□□ -0.26
EPC1-209ENST00000492710 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
EPC1-209ENST00000492710 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.4□□□□□ -0.26
EPC1-209ENST00000492710 CEP162Q5TB80 1403 aa13.4□□□□□ -0.26
EPC1-209ENST00000492710 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.39□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 CEP152O94986 1710 aa13.39□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 NCOA2Q15596 1464 aa13.39□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.39□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 PZPP20742 1482 aa13.37□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 KIF3BO15066 747 aa13.37□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.37□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.37□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 TNRQ92752 1358 aa13.36□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 IQGAP1P46940 1657 aa13.36□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 ALKQ9UM73 1620 aa13.35□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.34□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 DEPDC5O75140 1603 aa13.34□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.34□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 CPS1P31327 1500 aa13.34□□□□□ -0.27
EPC1-209ENST00000492710 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.33□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.33□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 PIP4K2BP78356 416 aa13.33□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.33□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.33□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.32□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 ABCC3O15438 1527 aa13.31□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 HSPA1LP34931 641 aa13.31□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.31□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 MIA2Q96PC5 1412 aa13.3□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 NLRP1Q9C000 1473 aa13.29□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 MED14O60244 1454 aa13.29□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.28□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa13.28□□□□□ -0.28
EPC1-209ENST00000492710 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.27□□□□□ -0.29
EPC1-209ENST00000492710 ERVK-7P63135 1459 aa13.26□□□□□ -0.29
EPC1-209ENST00000492710 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
EPC1-209ENST00000492710 SYNMO15061 1565 aa13.25□□□□□ -0.29
EPC1-209ENST00000492710 TOM1O60784 492 aa13.25□□□□□ -0.29
EPC1-209ENST00000492710 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.25□□□□□ -0.29
EPC1-209ENST00000492710 LRRC7Q96NW7 1537 aa13.24□□□□□ -0.29
EPC1-209ENST00000492710 TSPY4P0CV99 314 aa13.24□□□□□ -0.29
EPC1-209ENST00000492710 TSPY10P0CW01 314 aa13.24□□□□□ -0.29
EPC1-209ENST00000492710 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
EPC1-209ENST00000492710 PIK3C2BO00750 1634 aa13.23□□□□□ -0.29
EPC1-209ENST00000492710 VPS8Q8N3P4 1428 aa13.22□□□□□ -0.29
EPC1-209ENST00000492710 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa13.22□□□□□ -0.29
EPC1-209ENST00000492710 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.2□□□□□ -0.3
EPC1-209ENST00000492710 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.2□□□□□ -0.3
EPC1-209ENST00000492710 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.2□□□□□ -0.3
EPC1-209ENST00000492710 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.2□□□□□ -0.3
EPC1-209ENST00000492710 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
EPC1-209ENST00000492710 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
EPC1-209ENST00000492710 SLC4A2P04920 1241 aa13.17□□□□□ -0.3
EPC1-209ENST00000492710 LTKP29376 864 aa13.17□□□□□ -0.3
EPC1-209ENST00000492710 SLIT1O75093 1534 aa13.17□□□□□ -0.3
EPC1-209ENST00000492710 MAP3K1Q13233 1512 aa13.17□□□□□ -0.3
EPC1-209ENST00000492710 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.16□□□□□ -0.3
EPC1-209ENST00000492710 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
EPC1-209ENST00000492710 ABCC5O15440 1437 aa13.14□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 RNF39Q9H2S5 420 aa13.14□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 KIF15Q9NS87 1388 aa13.14□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.13□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.13□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa13.12□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.12□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 ERBINQ96RT1 1412 aa13.12□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 DAPK1P53355 1430 aa13.11□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.1□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.1□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 TET3O43151 1660 aa13.09□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.08□□□□□ -0.31
EPC1-209ENST00000492710 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
EPC1-209ENST00000492710 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms