RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491293.1

C1orf35-206, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf35, Length 854 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-206ENST00000491293 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.74■■■■□ 3.63
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C1orf35-206ENST00000491293 ZMYM3Q14202 1370 aa37.72■■■■□ 3.63
C1orf35-206ENST00000491293 C3P01024 1663 aa37.72■■■■□ 3.63
C1orf35-206ENST00000491293 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.7■■■■□ 3.63
C1orf35-206ENST00000491293 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
C1orf35-206ENST00000491293 PPP6R1Q9UPN7 881 aa37.7■■■■□ 3.63
C1orf35-206ENST00000491293 ADGRL2O95490 1459 aa37.69■■■■□ 3.62
C1orf35-206ENST00000491293 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
C1orf35-206ENST00000491293 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.68■■■■□ 3.62
C1orf35-206ENST00000491293 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
C1orf35-206ENST00000491293 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.64■■■■□ 3.62
C1orf35-206ENST00000491293 ERBINQ96RT1 1412 aa37.61■■■■□ 3.61
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C1orf35-206ENST00000491293 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.58■■■■□ 3.61
C1orf35-206ENST00000491293 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.58■■■■□ 3.611e-8■■■□□ 15.2
C1orf35-206ENST00000491293 MROH2AA6NES4 1674 aa37.57■■■■□ 3.61
C1orf35-206ENST00000491293 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.56■■■■□ 3.6
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C1orf35-206ENST00000491293 STRCQ7RTU9 1775 aa37.54■■■■□ 3.6
C1orf35-206ENST00000491293 CERKQ8TCT0 537 aa37.53■■■■□ 3.6
C1orf35-206ENST00000491293 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.53■■■■□ 3.6
C1orf35-206ENST00000491293 ROCK1Q13464 1354 aa37.53■■■■□ 3.6
C1orf35-206ENST00000491293 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.52■■■■□ 3.6
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C1orf35-206ENST00000491293 NPATQ14207 1427 aa37.45■■■■□ 3.59
C1orf35-206ENST00000491293 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.44■■■■□ 3.58
C1orf35-206ENST00000491293 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
C1orf35-206ENST00000491293 DEPDC5O75140 1603 aa37.41■■■■□ 3.58
C1orf35-206ENST00000491293 PZPP20742 1482 aa37.4■■■■□ 3.58
C1orf35-206ENST00000491293 CEP152O94986 1710 aa37.39■■■■□ 3.58
C1orf35-206ENST00000491293 KANK1Q14678 1352 aa37.34■■■■□ 3.57
C1orf35-206ENST00000491293 PTPRTO14522 1441 aa37.34■■■■□ 3.57
C1orf35-206ENST00000491293 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
C1orf35-206ENST00000491293 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.32■■■■□ 3.56
C1orf35-206ENST00000491293 TNRQ92752 1358 aa37.31■■■■□ 3.56
C1orf35-206ENST00000491293 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.3■■■■□ 3.56
C1orf35-206ENST00000491293 NAIPQ13075 1403 aa37.27■■■■□ 3.56
C1orf35-206ENST00000491293 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.26■■■■□ 3.56
C1orf35-206ENST00000491293 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.25■■■■□ 3.55
C1orf35-206ENST00000491293 ERVK-7P63135 1459 aa37.24■■■■□ 3.55
C1orf35-206ENST00000491293 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.24■■■■□ 3.55
C1orf35-206ENST00000491293 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.23■■■■□ 3.55
C1orf35-206ENST00000491293 UNC13BO14795 1591 aa37.21■■■■□ 3.55
C1orf35-206ENST00000491293 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.19■■■■□ 3.54
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C1orf35-206ENST00000491293 NUP155O75694 1391 aa37.18■■■■□ 3.54
C1orf35-206ENST00000491293 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
C1orf35-206ENST00000491293 HFM1A2PYH4 1435 aa37.17■■■■□ 3.54
C1orf35-206ENST00000491293 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
C1orf35-206ENST00000491293 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.16■■■■□ 3.54
C1orf35-206ENST00000491293 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.13■■■■□ 3.53
C1orf35-206ENST00000491293 PKD2Q13563 968 aa37.11■■■■□ 3.53
C1orf35-206ENST00000491293 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.1■■■■□ 3.53
C1orf35-206ENST00000491293 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.09■■■■□ 3.53
C1orf35-206ENST00000491293 PLA2R1Q13018 1463 aa37.09■■■■□ 3.53
C1orf35-206ENST00000491293 NLRP1Q9C000 1473 aa37.08■■■■□ 3.53
C1orf35-206ENST00000491293 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.05■■■■□ 3.52
C1orf35-206ENST00000491293 TET3O43151 1660 aa37.04■■■■□ 3.52
C1orf35-206ENST00000491293 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
C1orf35-206ENST00000491293 NOS1P29475 1434 aa37.03■■■■□ 3.52
C1orf35-206ENST00000491293 IDI1Q13907 227 aa37.02■■■■□ 3.52
C1orf35-206ENST00000491293 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37■■■■□ 3.51
C1orf35-206ENST00000491293 TRIM52Q96A61 297 aa37■■■■□ 3.51
C1orf35-206ENST00000491293 SYNMO15061 1565 aa37■■■■□ 3.51
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C1orf35-206ENST00000491293 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
C1orf35-206ENST00000491293 E9PCH4 1651 aa36.96■■■■□ 3.51
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C1orf35-206ENST00000491293 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.87■■■■□ 3.49
C1orf35-206ENST00000491293 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.87■■■■□ 3.49
C1orf35-206ENST00000491293 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.87■■■■□ 3.49
C1orf35-206ENST00000491293 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.86■■■■□ 3.49
C1orf35-206ENST00000491293 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.86■■■■□ 3.49
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C1orf35-206ENST00000491293 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
C1orf35-206ENST00000491293 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.8■■■■□ 3.48
C1orf35-206ENST00000491293 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.79■■■■□ 3.48
C1orf35-206ENST00000491293 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.78■■■■□ 3.48
C1orf35-206ENST00000491293 FOXD1Q16676 465 aa36.78■■■■□ 3.48
C1orf35-206ENST00000491293 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.75■■■■□ 3.47
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C1orf35-206ENST00000491293 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.75■■■■□ 3.47
C1orf35-206ENST00000491293 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.75■■■■□ 3.47
C1orf35-206ENST00000491293 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.73■■■■□ 3.47
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C1orf35-206ENST00000491293 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
C1orf35-206ENST00000491293 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.66■■■■□ 3.46
C1orf35-206ENST00000491293 EID1Q9Y6B2 187 aa36.66■■■■□ 3.46
C1orf35-206ENST00000491293 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.66■■■■□ 3.46
C1orf35-206ENST00000491293 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
C1orf35-206ENST00000491293 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.65■■■■□ 3.46
C1orf35-206ENST00000491293 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
C1orf35-206ENST00000491293 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.61■■■■□ 3.45
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