RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 TNRQ92752 1358 aa33.51■■■□□ 2.96
NELFE-210ENST00000491139 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
NELFE-210ENST00000491139 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.46■■■□□ 2.95
NELFE-210ENST00000491139 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa33.46■■■□□ 2.95
NELFE-210ENST00000491139 PZPP20742 1482 aa33.45■■■□□ 2.95
NELFE-210ENST00000491139 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.45■■■□□ 2.95
NELFE-210ENST00000491139 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
NELFE-210ENST00000491139 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.44■■■□□ 2.94
NELFE-210ENST00000491139 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
NELFE-210ENST00000491139 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.43■■■□□ 2.94
NELFE-210ENST00000491139 TOM1O60784 492 aa33.43■■■□□ 2.94
NELFE-210ENST00000491139 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.42■■■□□ 2.94
NELFE-210ENST00000491139 CPS1P31327 1500 aa33.42■■■□□ 2.94
NELFE-210ENST00000491139 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.41■■■□□ 2.94
NELFE-210ENST00000491139 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.4■■■□□ 2.94
NELFE-210ENST00000491139 PIP4K2BP78356 416 aa33.4■■■□□ 2.94
NELFE-210ENST00000491139 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP33.4■■■□□ 2.94
NELFE-210ENST00000491139 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.39■■■□□ 2.94
NELFE-210ENST00000491139 HSPA1LP34931 641 aa33.39■■■□□ 2.94
NELFE-210ENST00000491139 NCOA2Q15596 1464 aa33.37■■■□□ 2.93
NELFE-210ENST00000491139 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.37■■■□□ 2.932e-7■■■■□ 20.6
NELFE-210ENST00000491139 MIA2Q96PC5 1412 aa33.36■■■□□ 2.93
NELFE-210ENST00000491139 NLRP1Q9C000 1473 aa33.34■■■□□ 2.93
NELFE-210ENST00000491139 TSPY4P0CV99 314 aa33.34■■■□□ 2.93
NELFE-210ENST00000491139 TSPY10P0CW01 314 aa33.34■■■□□ 2.93
NELFE-210ENST00000491139 UGGT1Q9NYU2 1555 aa33.3■■■□□ 2.92
NELFE-210ENST00000491139 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
NELFE-210ENST00000491139 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.27■■■□□ 2.92
NELFE-210ENST00000491139 VWDEQ8N2E2 1590 aa33.27■■■□□ 2.92
NELFE-210ENST00000491139 MED14O60244 1454 aa33.26■■■□□ 2.92
NELFE-210ENST00000491139 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
NELFE-210ENST00000491139 DEPDC5O75140 1603 aa33.24■■■□□ 2.91
NELFE-210ENST00000491139 IQGAP1P46940 1657 aa33.17■■■□□ 2.9
NELFE-210ENST00000491139 ABCC3O15438 1527 aa33.16■■■□□ 2.9
NELFE-210ENST00000491139 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
NELFE-210ENST00000491139 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
NELFE-210ENST00000491139 ALKQ9UM73 1620 aa33.12■■■□□ 2.89
NELFE-210ENST00000491139 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
NELFE-210ENST00000491139 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.11■■■□□ 2.89
NELFE-210ENST00000491139 ERVK-7P63135 1459 aa33.1■■■□□ 2.89
NELFE-210ENST00000491139 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.09■■■□□ 2.89
NELFE-210ENST00000491139 LRRC7Q96NW7 1537 aa33.07■■■□□ 2.89
NELFE-210ENST00000491139 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
NELFE-210ENST00000491139 STRCP1A6NGW2 1772 aa33.06■■■□□ 2.88
NELFE-210ENST00000491139 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
NELFE-210ENST00000491139 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
NELFE-210ENST00000491139 MROH1Q8NDA8 1641 aa33.02■■■□□ 2.88
NELFE-210ENST00000491139 SYNMO15061 1565 aa33.01■■■□□ 2.88
NELFE-210ENST00000491139 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.01■■■□□ 2.87
NELFE-210ENST00000491139 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
NELFE-210ENST00000491139 CEP152O94986 1710 aa32.98■■■□□ 2.87
NELFE-210ENST00000491139 UBR1Q8IWV7 1749 aa32.98■■■□□ 2.87
NELFE-210ENST00000491139 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.97■■■□□ 2.87
NELFE-210ENST00000491139 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.96■■■□□ 2.87
NELFE-210ENST00000491139 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
NELFE-210ENST00000491139 TXNDC2Q86VQ3 553 aa32.96■■■□□ 2.87
NELFE-210ENST00000491139 LTKP29376 864 aa32.95■■■□□ 2.87
NELFE-210ENST00000491139 EID1Q9Y6B2 187 aa32.91■■■□□ 2.86
NELFE-210ENST00000491139 ARHGAP23Q9P227 1491 aa32.91■■■□□ 2.86
NELFE-210ENST00000491139 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa32.9■■■□□ 2.86
NELFE-210ENST00000491139 SLIT1O75093 1534 aa32.9■■■□□ 2.86
NELFE-210ENST00000491139 MAP3K1Q13233 1512 aa32.9■■■□□ 2.86
NELFE-210ENST00000491139 KIF15Q9NS87 1388 aa32.88■■■□□ 2.85
NELFE-210ENST00000491139 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
NELFE-210ENST00000491139 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.85■■■□□ 2.85
NELFE-210ENST00000491139 ERBINQ96RT1 1412 aa32.85■■■□□ 2.85
NELFE-210ENST00000491139 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.84■■■□□ 2.852e-6■■□□□ 12.4
NELFE-210ENST00000491139 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.82■■■□□ 2.84
NELFE-210ENST00000491139 STAG3Q9UJ98 1225 aa32.82■■■□□ 2.84
NELFE-210ENST00000491139 ABCC5O15440 1437 aa32.8■■■□□ 2.84
NELFE-210ENST00000491139 TMEM2Q9UHN6 1383 aa32.8■■■□□ 2.84
NELFE-210ENST00000491139 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
NELFE-210ENST00000491139 KANK1Q14678 1352 aa32.78■■■□□ 2.84
NELFE-210ENST00000491139 PIK3C2BO00750 1634 aa32.77■■■□□ 2.84
NELFE-210ENST00000491139 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.75■■■□□ 2.83
NELFE-210ENST00000491139 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
NELFE-210ENST00000491139 FAM135BQ49AJ0 1406 aa32.73■■■□□ 2.83
NELFE-210ENST00000491139 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.71■■■□□ 2.83
NELFE-210ENST00000491139 IDI1Q13907 227 aa32.71■■■□□ 2.83
NELFE-210ENST00000491139 TMEM94Q12767 1356 aa32.7■■■□□ 2.83
NELFE-210ENST00000491139 DAPK1P53355 1430 aa32.7■■■□□ 2.83
NELFE-210ENST00000491139 KCNA6P17658 529 aa32.7■■■□□ 2.83
NELFE-210ENST00000491139 EFCAB6Q5THR3 1501 aa32.7■■■□□ 2.83
NELFE-210ENST00000491139 APLP2Q06481 763 aa32.68■■■□□ 2.82
NELFE-210ENST00000491139 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
NELFE-210ENST00000491139 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
NELFE-210ENST00000491139 SLC26A8Q96RN1 970 aa32.66■■■□□ 2.82
NELFE-210ENST00000491139 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.65■■■□□ 2.82
NELFE-210ENST00000491139 LMTK2Q8IWU2 1503 aa32.65■■■□□ 2.82
NELFE-210ENST00000491139 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.64■■■□□ 2.82
NELFE-210ENST00000491139 TET3O43151 1660 aa32.61■■■□□ 2.81
NELFE-210ENST00000491139 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.6■■■□□ 2.81
NELFE-210ENST00000491139 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
NELFE-210ENST00000491139 NOS1P29475 1434 aa32.58■■■□□ 2.81
NELFE-210ENST00000491139 BCANQ96GW7 911 aa32.57■■■□□ 2.8
NELFE-210ENST00000491139 SLC52A1Q9NWF4 448 aa32.57■■■□□ 2.8
NELFE-210ENST00000491139 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa32.56■■■□□ 2.8
NELFE-210ENST00000491139 POTEAQ6S8J7 498 aa32.54■■■□□ 2.8
NELFE-210ENST00000491139 ADGRB3O60242 1522 aa32.54■■■□□ 2.8
NELFE-210ENST00000491139 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
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