RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490886.5

EXD3-211, Transcript of exonuclease 3'-5' domain containing 3, humanhuman

TSL 5

Gene EXD3, Length 1,123 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD3-211ENST00000490886 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.45■■■□□ 2.3
EXD3-211ENST00000490886 DAPK1P53355 1430 aa29.44■■■□□ 2.3
EXD3-211ENST00000490886 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
EXD3-211ENST00000490886 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
EXD3-211ENST00000490886 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.41■■■□□ 2.3
EXD3-211ENST00000490886 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.4■■■□□ 2.3
EXD3-211ENST00000490886 STRCQ7RTU9 1775 aa29.38■■■□□ 2.29
EXD3-211ENST00000490886 KIF15Q9NS87 1388 aa29.38■■■□□ 2.29
EXD3-211ENST00000490886 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.36■■■□□ 2.29
EXD3-211ENST00000490886 PZPP20742 1482 aa29.35■■■□□ 2.29
EXD3-211ENST00000490886 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.34■■■□□ 2.29
EXD3-211ENST00000490886 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
EXD3-211ENST00000490886 ERBINQ96RT1 1412 aa29.32■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.32■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.31■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.3■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 ABCC3O15438 1527 aa29.3■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 NCOA1Q15788 1441 aa29.29■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.29■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.28■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 TNRQ92752 1358 aa29.27■■■□□ 2.28
EXD3-211ENST00000490886 ADGRL2O95490 1459 aa29.25■■■□□ 2.27
EXD3-211ENST00000490886 PTPRTO14522 1441 aa29.25■■■□□ 2.27
EXD3-211ENST00000490886 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.24■■■□□ 2.27
EXD3-211ENST00000490886 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
EXD3-211ENST00000490886 CEP152O94986 1710 aa29.22■■■□□ 2.27
EXD3-211ENST00000490886 PLA2R1Q13018 1463 aa29.21■■■□□ 2.27
EXD3-211ENST00000490886 DEPDC5O75140 1603 aa29.2■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 FBXO41Q8TF61 875 aa29.19■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.16■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 NLRP1Q9C000 1473 aa29.16■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.15■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 PKD2Q13563 968 aa29.14■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 ERVK-7P63135 1459 aa29.14■■■□□ 2.26
EXD3-211ENST00000490886 KANK1Q14678 1352 aa29.13■■■□□ 2.25
EXD3-211ENST00000490886 CERKQ8TCT0 537 aa29.12■■■□□ 2.25
EXD3-211ENST00000490886 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.11■■■□□ 2.25
EXD3-211ENST00000490886 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.253e-11■■■■■ 37.1
EXD3-211ENST00000490886 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.09■■■□□ 2.25
EXD3-211ENST00000490886 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.09■■■□□ 2.25
EXD3-211ENST00000490886 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.07■■■□□ 2.24
EXD3-211ENST00000490886 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.07■■■□□ 2.24
EXD3-211ENST00000490886 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
EXD3-211ENST00000490886 ROCK1Q13464 1354 aa29.05■■■□□ 2.24
EXD3-211ENST00000490886 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
EXD3-211ENST00000490886 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 ITGAEP38570 1179 aa28.98■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.97■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.97■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.97■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
EXD3-211ENST00000490886 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.94■■■□□ 2.22
EXD3-211ENST00000490886 UNC13BO14795 1591 aa28.93■■■□□ 2.22
EXD3-211ENST00000490886 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
EXD3-211ENST00000490886 MED14O60244 1454 aa28.9■■■□□ 2.22
EXD3-211ENST00000490886 NOS1P29475 1434 aa28.89■■■□□ 2.22
EXD3-211ENST00000490886 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 TET3O43151 1660 aa28.88■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 PIK3C2BO00750 1634 aa28.87■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.87■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 SYNMO15061 1565 aa28.87■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.84■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 SLIT1O75093 1534 aa28.84■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 IDI1Q13907 227 aa28.83■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.83■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 IQGAP1P46940 1657 aa28.83■■■□□ 2.21
EXD3-211ENST00000490886 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.82■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.8■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.79■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 NUP155O75694 1391 aa28.77■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.76■■■□□ 2.2
EXD3-211ENST00000490886 LTKP29376 864 aa28.76■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.76■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 ADGRB3O60242 1522 aa28.75■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 E9PCH4 1651 aa28.75■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 EID1Q9Y6B2 187 aa28.75■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 CPS1P31327 1500 aa28.74■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 NAIPQ13075 1403 aa28.71■■■□□ 2.19
EXD3-211ENST00000490886 HFM1A2PYH4 1435 aa28.65■■■□□ 2.18
EXD3-211ENST00000490886 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.62■■■□□ 2.17
EXD3-211ENST00000490886 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.62■■■□□ 2.17
EXD3-211ENST00000490886 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.61■■■□□ 2.17
EXD3-211ENST00000490886 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.61■■■□□ 2.17
EXD3-211ENST00000490886 ZFYVE9O95405 1425 aa28.58■■■□□ 2.17
EXD3-211ENST00000490886 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
EXD3-211ENST00000490886 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.56■■■□□ 2.16
EXD3-211ENST00000490886 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.55■■■□□ 2.16
EXD3-211ENST00000490886 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.54■■■□□ 2.16
EXD3-211ENST00000490886 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
EXD3-211ENST00000490886 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.5■■■□□ 2.15
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