RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489918.1

C1orf61-220, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 427 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-220ENST00000489918 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.38■■■□□ 2.45
C1orf61-220ENST00000489918 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.38■■■□□ 2.45
C1orf61-220ENST00000489918 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.38■■■□□ 2.45
C1orf61-220ENST00000489918 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
C1orf61-220ENST00000489918 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
C1orf61-220ENST00000489918 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.36■■■□□ 2.45
C1orf61-220ENST00000489918 NPATQ14207 1427 aa30.35■■■□□ 2.45
C1orf61-220ENST00000489918 PTPRKQ15262 1439 aa30.34■■■□□ 2.45
C1orf61-220ENST00000489918 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.32■■■□□ 2.44
C1orf61-220ENST00000489918 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.32■■■□□ 2.44
C1orf61-220ENST00000489918 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.31■■■□□ 2.44
C1orf61-220ENST00000489918 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.29■■■□□ 2.44
C1orf61-220ENST00000489918 NCOA1Q15788 1441 aa30.29■■■□□ 2.44
C1orf61-220ENST00000489918 ERBINQ96RT1 1412 aa30.29■■■□□ 2.44
C1orf61-220ENST00000489918 ADGRL2O95490 1459 aa30.27■■■□□ 2.44
C1orf61-220ENST00000489918 ABCC3O15438 1527 aa30.26■■■□□ 2.43
C1orf61-220ENST00000489918 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.24■■■□□ 2.43
C1orf61-220ENST00000489918 PZPP20742 1482 aa30.24■■■□□ 2.43
C1orf61-220ENST00000489918 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
C1orf61-220ENST00000489918 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
C1orf61-220ENST00000489918 CEP152O94986 1710 aa30.22■■■□□ 2.43
C1orf61-220ENST00000489918 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
C1orf61-220ENST00000489918 STRCQ7RTU9 1775 aa30.19■■■□□ 2.42
C1orf61-220ENST00000489918 DEPDC5O75140 1603 aa30.18■■■□□ 2.42
C1orf61-220ENST00000489918 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
C1orf61-220ENST00000489918 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
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C1orf61-220ENST00000489918 TNRQ92752 1358 aa30.15■■■□□ 2.42
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C1orf61-220ENST00000489918 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.14■■■□□ 2.418e-7■■■■■ 64.2
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C1orf61-220ENST00000489918 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.11■■■□□ 2.41
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C1orf61-220ENST00000489918 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.09■■■□□ 2.41
C1orf61-220ENST00000489918 ROCK1Q13464 1354 aa30.07■■■□□ 2.4
C1orf61-220ENST00000489918 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
C1orf61-220ENST00000489918 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.07■■■□□ 2.4
C1orf61-220ENST00000489918 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.07■■■□□ 2.4
C1orf61-220ENST00000489918 ERVK-7P63135 1459 aa30.06■■■□□ 2.4
C1orf61-220ENST00000489918 KANK1Q14678 1352 aa30.05■■■□□ 2.4
C1orf61-220ENST00000489918 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.03■■■□□ 2.4
C1orf61-220ENST00000489918 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.01■■■□□ 2.4
C1orf61-220ENST00000489918 NLRP1Q9C000 1473 aa30■■■□□ 2.39
C1orf61-220ENST00000489918 PLA2R1Q13018 1463 aa29.99■■■□□ 2.39
C1orf61-220ENST00000489918 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.99■■■□□ 2.39
C1orf61-220ENST00000489918 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.99■■■□□ 2.39
C1orf61-220ENST00000489918 PTPRTO14522 1441 aa29.97■■■□□ 2.39
C1orf61-220ENST00000489918 UNC13BO14795 1591 aa29.95■■■□□ 2.39
C1orf61-220ENST00000489918 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.94■■■□□ 2.38
C1orf61-220ENST00000489918 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.94■■■□□ 2.38
C1orf61-220ENST00000489918 PKD2Q13563 968 aa29.89■■■□□ 2.38
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C1orf61-220ENST00000489918 TET3O43151 1660 aa29.86■■■□□ 2.37
C1orf61-220ENST00000489918 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
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C1orf61-220ENST00000489918 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.85■■■□□ 2.37
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C1orf61-220ENST00000489918 NOS1P29475 1434 aa29.83■■■□□ 2.37
C1orf61-220ENST00000489918 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.82■■■□□ 2.36
C1orf61-220ENST00000489918 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.82■■■□□ 2.36
C1orf61-220ENST00000489918 NAIPQ13075 1403 aa29.81■■■□□ 2.36
C1orf61-220ENST00000489918 PIK3C2BO00750 1634 aa29.81■■■□□ 2.36
C1orf61-220ENST00000489918 NUP155O75694 1391 aa29.8■■■□□ 2.36
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C1orf61-220ENST00000489918 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.78■■■□□ 2.36
C1orf61-220ENST00000489918 E9PCH4 1651 aa29.77■■■□□ 2.36
C1orf61-220ENST00000489918 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.77■■■□□ 2.36
C1orf61-220ENST00000489918 IDI1Q13907 227 aa29.76■■■□□ 2.35
C1orf61-220ENST00000489918 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
C1orf61-220ENST00000489918 HFM1A2PYH4 1435 aa29.73■■■□□ 2.35
C1orf61-220ENST00000489918 FBXO41Q8TF61 875 aa29.72■■■□□ 2.35
C1orf61-220ENST00000489918 MED14O60244 1454 aa29.71■■■□□ 2.35
C1orf61-220ENST00000489918 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.71■■■□□ 2.35
C1orf61-220ENST00000489918 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
C1orf61-220ENST00000489918 SLIT1O75093 1534 aa29.7■■■□□ 2.34
C1orf61-220ENST00000489918 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.68■■■□□ 2.34
C1orf61-220ENST00000489918 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.68■■■□□ 2.34
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C1orf61-220ENST00000489918 ADGRB3O60242 1522 aa29.67■■■□□ 2.34
C1orf61-220ENST00000489918 IQGAP1P46940 1657 aa29.67■■■□□ 2.34
C1orf61-220ENST00000489918 LTKP29376 864 aa29.66■■■□□ 2.34
C1orf61-220ENST00000489918 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
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C1orf61-220ENST00000489918 EID1Q9Y6B2 187 aa29.57■■■□□ 2.32
C1orf61-220ENST00000489918 TRIM52Q96A61 297 aa29.56■■■□□ 2.32
C1orf61-220ENST00000489918 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.55■■■□□ 2.32
C1orf61-220ENST00000489918 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.51■■■□□ 2.31
C1orf61-220ENST00000489918 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
C1orf61-220ENST00000489918 ZFYVE9O95405 1425 aa29.5■■■□□ 2.31
C1orf61-220ENST00000489918 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.49■■■□□ 2.31
C1orf61-220ENST00000489918 CPS1P31327 1500 aa29.48■■■□□ 2.31
C1orf61-220ENST00000489918 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.47■■■□□ 2.31
C1orf61-220ENST00000489918 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
C1orf61-220ENST00000489918 TRPM2O94759 1503 aa29.44■■■□□ 2.3
C1orf61-220ENST00000489918 CLTCL1P53675 1640 aa29.43■■■□□ 2.3
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