RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489697.1

RAI1-204, Transcript of retinoic acid induced 1, humanhuman

TSL 3

Gene RAI1, Length 1,570 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI1-204ENST00000489697 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
RAI1-204ENST00000489697 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.78■■□□□ 1.4
RAI1-204ENST00000489697 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.77■■□□□ 1.4
RAI1-204ENST00000489697 DEPDC5O75140 1603 aa23.77■■□□□ 1.4
RAI1-204ENST00000489697 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.77■■□□□ 1.4
RAI1-204ENST00000489697 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.75■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.74■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 KANK1Q14678 1352 aa23.74■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 UNC13BO14795 1591 aa23.74■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 TRIM52Q96A61 297 aa23.74■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 NUP155O75694 1391 aa23.73■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.73■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 MADDQ8WXG6 1647 aa23.72■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.7■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.7■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 ABCC3O15438 1527 aa23.69■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 HRCP23327 699 aa23.69■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.68■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.68■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.68■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 CEP152O94986 1710 aa23.66■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.64■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 ZMYM3Q14202 1370 aa23.64■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.63■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.63■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 PZPP20742 1482 aa23.6■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 PTPRMP28827 1452 aa23.6■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.6■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 MROH2AA6NES4 1674 aa23.59■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.58■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 TET3O43151 1660 aa23.58■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.56■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.56■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 C3P01024 1663 aa23.56■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 NPATQ14207 1427 aa23.55■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 PKD2Q13563 968 aa23.55■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 E9PCH4 1651 aa23.51■■□□□ 1.35
RAI1-204ENST00000489697 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RAI1-204ENST00000489697 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
RAI1-204ENST00000489697 FOXD1Q16676 465 aa23.49■■□□□ 1.35
RAI1-204ENST00000489697 ERVK-7P63135 1459 aa23.47■■□□□ 1.35
RAI1-204ENST00000489697 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.45■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.45■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 NOS1P29475 1434 aa23.45■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 TNRQ92752 1358 aa23.44■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 PTPRTO14522 1441 aa23.4■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 PLA2R1Q13018 1463 aa23.39■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 SYNMO15061 1565 aa23.38■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.38■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 IDI1Q13907 227 aa23.35■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.35■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 TRPM2O94759 1503 aa23.34■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.34■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.34■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 NLRP1Q9C000 1473 aa23.32■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.32■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.32■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.29■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 PIK3C2BO00750 1634 aa23.29■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 CLTCL1P53675 1640 aa23.29■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.28■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.27■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RAI1-204ENST00000489697 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.23■■□□□ 1.31
RAI1-204ENST00000489697 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RAI1-204ENST00000489697 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
RAI1-204ENST00000489697 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.21■■□□□ 1.31
RAI1-204ENST00000489697 ADGRB3O60242 1522 aa23.21■■□□□ 1.31
RAI1-204ENST00000489697 HSPA2P54652 639 aa23.2■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.2■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.19■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 KIF1BO60333 1816 aa23.18■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 NEUROD1Q13562 356 aa23.17■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 RGL3Q3MIN7 710 aa23.16■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.15■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.15■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.14■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.13■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 SLIT1O75093 1534 aa23.09■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.09■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.09■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.09■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms