RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 MAP3K1Q13233 1512 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP4-210ENST00000489601 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP4-210ENST00000489601 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP4-210ENST00000489601 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SH3BP4-210ENST00000489601 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP4-210ENST00000489601 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP4-210ENST00000489601 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP4-210ENST00000489601 PZPP20742 1482 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP4-210ENST00000489601 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP4-210ENST00000489601 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP4-210ENST00000489601 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP4-210ENST00000489601 MIA2Q96PC5 1412 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP4-210ENST00000489601 TNRQ92752 1358 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP4-210ENST00000489601 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP4-210ENST00000489601 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SH3BP4-210ENST00000489601 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SH3BP4-210ENST00000489601 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SH3BP4-210ENST00000489601 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP4-210ENST00000489601 NLRP1Q9C000 1473 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP4-210ENST00000489601 ABCC3O15438 1527 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP4-210ENST00000489601 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SH3BP4-210ENST00000489601 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP4-210ENST00000489601 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP4-210ENST00000489601 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 APLP2Q06481 763 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 ABCC5O15440 1437 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 DEPDC5O75140 1603 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 CEP152O94986 1710 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP4-210ENST00000489601 MED14O60244 1454 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP4-210ENST00000489601 ERVK-7P63135 1459 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP4-210ENST00000489601 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP4-210ENST00000489601 KIF15Q9NS87 1388 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP4-210ENST00000489601 CPS1P31327 1500 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP4-210ENST00000489601 ERBINQ96RT1 1412 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP4-210ENST00000489601 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SH3BP4-210ENST00000489601 DAPK1P53355 1430 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP4-210ENST00000489601 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP4-210ENST00000489601 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP4-210ENST00000489601 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SH3BP4-210ENST00000489601 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP4-210ENST00000489601 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP4-210ENST00000489601 IQGAP1P46940 1657 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP4-210ENST00000489601 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP4-210ENST00000489601 ILDR2Q71H61 639 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP4-210ENST00000489601 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP4-210ENST00000489601 TOM1O60784 492 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP4-210ENST00000489601 KANK1Q14678 1352 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP4-210ENST00000489601 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
SH3BP4-210ENST00000489601 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP4-210ENST00000489601 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP4-210ENST00000489601 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP4-210ENST00000489601 SLIT1O75093 1534 aa25.83■■□□□ 1.72
SH3BP4-210ENST00000489601 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP4-210ENST00000489601 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP4-210ENST00000489601 ADGRL2O95490 1459 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP4-210ENST00000489601 LTKP29376 864 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP4-210ENST00000489601 PIP4K2BP78356 416 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP4-210ENST00000489601 PIK3C2BO00750 1634 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP4-210ENST00000489601 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP4-210ENST00000489601 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
SH3BP4-210ENST00000489601 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP4-210ENST00000489601 HSPA1LP34931 641 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP4-210ENST00000489601 SYNMO15061 1565 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP4-210ENST00000489601 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SH3BP4-210ENST00000489601 ALKQ9UM73 1620 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP4-210ENST00000489601 SOCS7O14512 581 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP4-210ENST00000489601 EID1Q9Y6B2 187 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BP4-210ENST00000489601 IDI1Q13907 227 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SH3BP4-210ENST00000489601 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP4-210ENST00000489601 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP4-210ENST00000489601 NOS1P29475 1434 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP4-210ENST00000489601 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP4-210ENST00000489601 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
SH3BP4-210ENST00000489601 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
SH3BP4-210ENST00000489601 ADGRB3O60242 1522 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP4-210ENST00000489601 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SH3BP4-210ENST00000489601 TET3O43151 1660 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP4-210ENST00000489601 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP4-210ENST00000489601 UNC13BO14795 1591 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP4-210ENST00000489601 KCNA6P17658 529 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP4-210ENST00000489601 ROCK1Q13464 1354 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP4-210ENST00000489601 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP4-210ENST00000489601 ZFYVE9O95405 1425 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM94Q12767 1356 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.49■■□□□ 1.67
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